| (1) AGO.mut | (3) AGO1.ip | (2) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (4) B-CELL | (6) BRAIN | (6) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (11) EMBRYO | (5) ESC | (2) FIBROBLAST | (1) HEART | (2) KIDNEY | (2) LIVER | (1) LYMPH | (9) OTHER | (2) OTHER.mut | (1) OVARY | (1) PANCREAS | (3) PIWI.ip | (1) PIWI.mut | (3) SKIN | (4) SPLEEN | (18) TESTES | (1) THYMUS | (5) TOTAL-RNA | (1) UTERUS |
| TGGAAGGCTGCAGCAGTGCAGGGGGCATCGCCGAGTGCTTCGTGCAAAGAGTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGACGGACGCTGGGCCGGGATTCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTGGTGCTGACTCCCATGTCCCCACAGAGCGAAGATTTTGACATCTATACATTGTACTGCATGAACTACCCAAGGTG ...................................................................................................(((((.((((((..((.((......))))..)))))).)))))..................................................... ...........................................................................................92...................................................145................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR059773(GSM562835) CD4_Dicer. (spleen) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | GSM416732(GSM416732) MEF. (cell line) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR023848(GSM307157) mEFsmallrna_rep1. (cell line) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR042481(GSM539873) mouse pancreatic tissue [09-002]. (pancreas) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR525241(SRA056111/SRX170317) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago1 Blood) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | GSM566420(GSM566420) "Endougenous small RNA from mouse NIH3T3 cell, infected with MHV-68". (fibroblast) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | GSM261959(GSM261959) oocytesmallRNA-19to30. (oocyte) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM317183(GSM317183) Ago-1 IP small RNAs from mouse brain. (ago1 brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR095853(SRX039174) "sequencing of miRNA from wild type and disea. (heart) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................................................................................................................TGACTCCCATGTCCCCACAGA................................................. | 21 | 1 | 47.00 | 47.00 | - | - | - | 10.00 | 3.00 | 6.00 | 3.00 | - | 4.00 | - | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................ACATTGTACTGCATGAACT.......... | 19 | 1 | 19.00 | 19.00 | - | - | - | 2.00 | 7.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TGACTCCCATGTCCCCACAGT................................................. | 21 | 1 | 16.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGACGGACGCTGGGCCGGGATTCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTGGTGCTGACTCCCATGTCCCCACAG.................................................. | 95 | 1 | 14.00 | 14.00 | - | - | 14.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TGACTCCCATGTCCCCACAGAA................................................ | 22 | 1 | 6.00 | 47.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................ATACATTGTACTGCATGAACT.......... | 21 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................GGTGCTGACTCCCATGTCCCCACAGA................................................. | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCATGGGGCCATGGGGATCTAG............................................................................. | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................CTGCATGAACTACCCAAG... | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................TACATTGTACTGCATGAACTACCCAAGC.. | 28 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................GCGAAGATTTTGACATCTGCA............................ | 21 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGACGGACGCTGGGCCGGGATTCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTGGTGCTGACTCCCATGTCCCCCCAG.................................................. | 95 | 2.00 | 0.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................GACTCCCATGTCCCCACAGAAGA.............................................. | 23 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGACGGACGCTGGGCCGGGATTCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTGGTGCTGACTCCCATGTCCCCAC.................................................... | 93 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................GACTCCCATGTCCCCACAGAAA............................................... | 22 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGG........................................................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGG....................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................GTACTGCATGAACTACCCAAGCT. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGG............................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................TGACATCTATACATTGTACTGCATGAAC........... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................GGGGGACGGACGCTGGGCCGGG..................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................TTGACATCTATACATTGTACTGCA................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGG..................................................................................................................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................TGACTCCCATGTCCCCACAG.................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................ATGGGGCCATGGGGATCT............................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................AGATTTTGACATCTATACATTGTACTGC................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................CATGGGGCCATGGGGATCTAG............................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................CATTGTACTGCATGAACT.......... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........TGCAGCAGTGCAGGGGGCATT...................................................................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................GTAGGACAGCTTGAGGCTGGGG....................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................GCATCGCCGAGTGCTTCGTGCAAAGA................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTGT......................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....AGGCTGCAGCAGTGCCTT............................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................GAGGCTGGGGGACGGACGCT............................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................CAGCTTGAGGCTGGGGGA..................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................GGCTGGGGGACGGACCGGG............................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................TCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTG.......................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...AAGGCTGCAGCAGTGCAGGGGGC......................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGG......................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................GTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGACG................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGACGGACGCTGGGCCGGGATTCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTGGTGCTGACTCCCATGTCCCCACAA.................................................. | 95 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................TGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGAC.................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................TACTGCATGAACTACCCGAGC.. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................GACTCCCATGTCCCCACAGAAAA.............................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................GACTCCCATGTCCCCACAGA................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCATGGGGCCATGGGGATCTAGT............................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................TGCATGAACTACCCAAG... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCATGGGGCCATGGGGA.................................................................................. | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................ATTGTACTGCATGAACTACCCAAG... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................TGACATCTATACATTGTAC.................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TGACTCCCATGTCCCCACAAG................................................. | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| .............................................................................................................................TGACTCCCATGTCCCCACA................................................... | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TGACTCCCATGTCCCCAC.................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................AGGCTGGGGGACGGA................................................................................................................. | 15 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - |
| TGGAAGGCTGCAGCAGTGCAGGGGGCATCGCCGAGTGCTTCGTGCAAAGAGTGAGTAGGACAGCTTGAGGCTGGGGGACGGACGCTGGGCCGGGATTCATGGGGCCATGGGGATCTAGGTGGTGCTGACTCCCATGTCCCCACAGAGCGAAGATTTTGACATCTATACATTGTACTGCATGAACTACCCAAGGTG ...................................................................................................(((((.((((((..((.((......))))..)))))).)))))..................................................... ...........................................................................................92...................................................145................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR059773(GSM562835) CD4_Dicer. (spleen) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | GSM416732(GSM416732) MEF. (cell line) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR023848(GSM307157) mEFsmallrna_rep1. (cell line) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR042481(GSM539873) mouse pancreatic tissue [09-002]. (pancreas) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR525241(SRA056111/SRX170317) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago1 Blood) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | GSM566420(GSM566420) "Endougenous small RNA from mouse NIH3T3 cell, infected with MHV-68". (fibroblast) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | GSM261959(GSM261959) oocytesmallRNA-19to30. (oocyte) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM317183(GSM317183) Ago-1 IP small RNAs from mouse brain. (ago1 brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR095853(SRX039174) "sequencing of miRNA from wild type and disea. (heart) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ..........................................................................GGGACGGACGCTGGGGCG....................................................................................................... | 18 | 37.00 | 0.00 | 23.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................GGGACGGACGCTGGGCGC....................................................................................................... | 18 | 6.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................GGGACGGACGCTGGGCGCGC..................................................................................................... | 20 | 5.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................GGGACGGACGCTGGGGC........................................................................................................ | 17 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..........................................................................GGGACGGACGCTGGGCG........................................................................................................ | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................GCCGAGTGCTTCGTGCAAAGAGTGAGTA.......................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................GGACGCTGGGCCGGGTCAC................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................GGGACGGACGCTGGGC......................................................................................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................GACTCCCATGTCCCCACAGAGCGAA............................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................................AAAGAGTGAGTAGGAC...................................................................................................................................... | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................GGCCGGGATTCAT............................................................................................... | 13 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 |
| ..........................................................................GGGACGGACGCTG............................................................................................................ | 13 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - |