| (2) AGO1.ip | (15) AGO2.ip | (2) AGO3.ip | (2) B-CELL | (24) BRAIN | (3) CELL-LINE | (2) DGCR8.mut | (9) EMBRYO | (3) ESC | (4) FIBROBLAST | (1) HEART | (1) KIDNEY | (2) LIVER | (1) LYMPH | (9) OTHER | (5) OTHER.mut | (2) PIWI.ip | (6) SKIN | (4) SPLEEN | (13) TESTES | (1) THYMUS |
| GGCCTACTGGAGAGAGGGAGGCTGTTGGTCCTGTCAGATCTGGAGGGAAGCAGAGAGGCCTGGGCTGGGTCAGCTGGTGGGACGTGCTCCCGGAGGCCCCCCCCACCGTGGCTCATTACCTGGACCTGCACTGGCCCACCACATGAGGCCAGGGCAGTGTGGCGGAGCCTCAAAGGGATGTCCTTCCACCTACCCGGCAGGTCCTGGAGCTCCTGAAGGTGGCCTGGAAGAGGCGACTCATTTTTACCGT ...............................................................(((((((.((.(((.((((((...((((.(((((.((.(((((...((..((.....))..)).((.((((((((.....)).)))))).)).))).)).)).)))))...)))))))))).))).))))))))).................................................... ............................................................61.........................................................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | SRR553603(SRX182809) source: Spermatids. (Spermatids) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042443(GSM539835) mouse pro B cells [09-002]. (b cell) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR553584(SRX182790) source: Heart. (Heart) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGT................................................. | 21 | 1 | 120.00 | 8.00 | 15.00 | 7.00 | 5.00 | 5.00 | 5.00 | 6.00 | 5.00 | - | 6.00 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | 2.00 | 3.00 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGA................................................. | 21 | 1 | 17.00 | 8.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 4.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAG.................................................. | 20 | 1 | 8.00 | 8.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGTT................................................ | 22 | 1 | 7.00 | 8.00 | 1.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................CAGATCTGGAGGGAAGAA...................................................................................................................................................................................................... | 18 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGTAG............................................... | 23 | 1 | 2.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................AAGGTGGCCTGGAAGAGGCG............... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................TGAAGGTGGCCTGGAAGAGG................. | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................CCTTCCACCTACCCGGCAG.................................................. | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCCC..................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................................................GGAGCTCCTGAAGGTGCT........................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ..............AGGGAGGCTGTTGGTTCA.......................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................TGGGTCAGCTGGTGGGCGC...................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................CCTGGGCTGGGTCAGACGA............................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGTA................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................TGGAAGAGGCGACTCATTTTTACCGT | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................CAGATCTGGAGGGAAGAAG..................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................AGGCCTGGGCTGGGTTCGG................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGC.................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................AAGGTGGCCTGGAAGAGGCGA.............. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGTGTGGCGGAGCCTCAAAGGGATGTCCTTCCA.............................................................. | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................TCCTGTCAGATCTGGAGGGAAGCA...................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCATT................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGG................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGGCCAGGGCAGTGTGGCGGAG................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CAGGGCAGTGTGGCGGAGAC................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGTATA.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GCCAGGGCAGTGTGGCGGAGCCTCA.............................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGGAGCTCCTGAAGGCAG............................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................GGCAGTGTGGCGGAGCGG................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAT.................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................CCTTCCACCTACCCGGCAGA................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................CCAGGGCAGTGTGGCGGAGCC................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...................................AGATCTGGAGGGAAGAAGT.................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................GGCCAGGGCAGTGTGGCGGAG................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGGAGCTCCTGAAGGTGGCCTGGAA..................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GGCAGTGTGGCGGAGGGG................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................ATCTGGAGGGAAGCACCC................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................GTTGGTCCTGTCAGAT................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................CTGGAGCTCCTGAAGGTGGCCTGGAA..................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................AAGGTGGCCTGGAAGAGGCGAC............. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGTAAT.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................GGTGGCCTGGAAGAGGCGA.............. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTCCACCTACCCGGCAGTTT............................................... | 23 | 1 | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................CTGAAGGTGGCCTGGA...................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................CTTCCACCTACCCGG..................................................... | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |
| ..........................................................................TGGTGGGACGTGCT.................................................................................................................................................................. | 14 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 |
| GGCCTACTGGAGAGAGGGAGGCTGTTGGTCCTGTCAGATCTGGAGGGAAGCAGAGAGGCCTGGGCTGGGTCAGCTGGTGGGACGTGCTCCCGGAGGCCCCCCCCACCGTGGCTCATTACCTGGACCTGCACTGGCCCACCACATGAGGCCAGGGCAGTGTGGCGGAGCCTCAAAGGGATGTCCTTCCACCTACCCGGCAGGTCCTGGAGCTCCTGAAGGTGGCCTGGAAGAGGCGACTCATTTTTACCGT ...............................................................(((((((.((.(((.((((((...((((.(((((.((.(((((...((..((.....))..)).((.((((((((.....)).)))))).)).))).)).)).)))))...)))))))))).))).))))))))).................................................... ............................................................61.........................................................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | SRR553603(SRX182809) source: Spermatids. (Spermatids) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042443(GSM539835) mouse pro B cells [09-002]. (b cell) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR553584(SRX182790) source: Heart. (Heart) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................CGGAGGCCCCCCCCACCA.............................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................TGTCCTTCCACCTACCCGGCAGG................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................CAGATCTGGAGGGAAGTA...................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |