| (18) AGO2.ip | (42) BRAIN | (2) CELL-LINE | (3) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (3) EMBRYO | (4) ESC | (1) FIBROBLAST | (1) LIVER | (1) LUNG | (6) OTHER | (3) PIWI.ip | (11) TESTES | (1) TOTAL-RNA |
| CGTCGGGGAGCGCGAGATCTCTGGGAATGCCCTGCGCTACGCTCCTGACGGTGAGTGCTGGGCTGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAGGCCAGTCCAGTCTCTAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAGGCATCATCGGACTTCAGCTAATCAACGGCAAGAACGAGTCGGCCCACATC ...........................................................(((((.((((((.....(((((((..((....)))))))))...)))))).)))))......................................................... ..........................................................59.............................................................122................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR037904(GSM510440) brain_rep1. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042477(GSM539869) mouse brain tissue [09-002]. (brain) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR394084(GSM855970) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (dicer cell line) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAG.................................................. | 22 | 1 | 104.00 | 104.00 | 16.00 | 8.00 | 8.00 | 3.00 | 4.00 | 3.00 | 8.00 | 6.00 | 3.00 | 3.00 | 6.00 | 4.00 | 3.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | 3.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAGT................................................. | 23 | 1 | 77.00 | 104.00 | 8.00 | 7.00 | 9.00 | 1.00 | 3.00 | 8.00 | 5.00 | 4.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | 3.00 | 2.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGC.................................................... | 20 | 1 | 33.00 | 33.00 | 2.00 | 2.00 | 4.00 | 1.00 | 3.00 | 1.00 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCA................................................... | 21 | 1 | 23.00 | 23.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 4.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAGA................................................. | 23 | 1 | 8.00 | 104.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CATCATCGGACTTCAGCT............................... | 18 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAG...................................................................................... | 23 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAT.................................................. | 22 | 1 | 7.00 | 23.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCTT.................................................. | 22 | 1 | 6.00 | 33.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCT................................................... | 21 | 1 | 6.00 | 33.00 | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAGC................................................. | 23 | 1 | 5.00 | 104.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GCATCATCGGACTTCAGCT............................... | 19 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TCATCGGACTTCAGCTAATCAACGG...................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAGT..................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAGTT................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 104.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GCATCATCGGACTTCAGC................................ | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAGGTT................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAA.................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 23.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................GAGTGCTGGGCTGTGGGGT..................................................................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TGTGGGGTCGCCTGGGACTGT........................................................................................ | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAGG..................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................GGCATCATCGGACTTCAGCT............................... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................GCGCTACGCTCCTGACG.......................................................................................................................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................CGGACTTCAGCTAATCAACGGCAAGAACG.............. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................ACGGCAAGAACGAGTCG......... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCATCGGACTTCAGCT............................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GCATCATCGGACTTCAGCTAATC........................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................TGTGGGGTCGCCTGGGACTGTTAT..................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTGCTGGGCTGTGA........................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................CATCATCGGACTTCAGC................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CATCATCGGACTTCAGCTA.............................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCTTT................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 33.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CATCATCGGACTTCAGCTAATCAACGG...................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GGCAAGAACGAGTCGAGC...... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................CTCCAGGGTCCCGCGCAG.................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCATCGGACTTCAGCTAATCAACGGCAA................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGTGCTGGGCTGTGAA....................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................GTGAGTGCTGGGCTGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAGGCCAGTCCAGTCTCTAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAGT................................................. | 73 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................AGAACGAGTCGGCCCACA.. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GCATCATCGGACTTCGGGC............................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCTA.................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 33.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TCTCTGGGAATGCCCTGCGCT...................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GAACGAGTCGGCCCACATC | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TCATCGGACTTCAGCTGTGC........................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................TAGGCCAGTCCAGTCTCTAAGCTCT................................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................AATGCCCTGCGCTACGC.................................................................................................................................. | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................TGGGGTCGCCTGGGACTGTAGGTTT.................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCCCGCGCATT................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 23.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GCATCATCGGACTTCTGTT............................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................TGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAT...................................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................GGCTGTGGGGTCGCCACC.............................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................TGGGGTCGCCTGGGACTGTAGG..................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................GGACTTCAGCTAATCAACGG...................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CATCATCGGACTTCAGCTAATCAACG....................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................CAAGAACGAGTCGGCCCAC... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................ACGCTCCTGACGGTGATAGG.................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................GGACTTCAGCTAATCAACGGCAAGAACG.............. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................ATCGGACTTCAGCTAATC........................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................GGTGAGTGCTGGGCTAGAG........................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................ACGGCAAGAACGAGTCGGC....... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| .....................................................................................................................................................GCAAGAACGAGTCGGCCCACATC | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CGCGAGATCTCTGGGAATGCC............................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................GAGTGCTGGGCTGTGGG....................................................................................................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................CGCCTGGGACTGTAG...................................................................................... | 15 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TAAGCTCCAGGGTCC......................................................... | 15 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CGTCGGGGAGCGCGAGATCTCTGGGAATGCCCTGCGCTACGCTCCTGACGGTGAGTGCTGGGCTGTGGGGTCGCCTGGGACTGTAGGCCAGTCCAGTCTCTAAGCTCCAGGGTCCCGCGCAGGCATCATCGGACTTCAGCTAATCAACGGCAAGAACGAGTCGGCCCACATC ...........................................................(((((.((((((.....(((((((..((....)))))))))...)))))).)))))......................................................... ..........................................................59.............................................................122................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR037904(GSM510440) brain_rep1. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042477(GSM539869) mouse brain tissue [09-002]. (brain) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR394084(GSM855970) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (dicer cell line) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................GCCCTGCGCTACGCTCCTGACGGTGA...................................................................................................................... | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GAGATCTCTGGGAATTTGT............................................................................................................................................ | 19 | 5.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | |
| ...................................................................................TAGGCCAGTCCAGTCTCT....................................................................... | 18 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................CAGGCATCATCGGACTTCAGCTAATCA.......................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...............................CTGCGCTACGCTCCTGACGGT........................................................................................................................ | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GCCCTGCGCTACGCTCCTGACGGTG....................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCCAGGGTCCCGCGCAGGC................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TACGCTCCTGACGGTGAG..................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................CGCTACGCTCCTGACGGT........................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................GCGCAGGCATCATCGGAC...................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................TGCCCTGCGCTACGCTCCTGAC........................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................GAATGCCCTGCGCTACG................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................GCGCTACGCTCCTGACGGT........................................................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................CCCTGCGCTACGCTCCTGACGG......................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCATCGGACTTCAGA................................ | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................TAGGCCAGTCCAGTCTCTAAGC................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................TCCCGCGCAGGCAT.............................................. | 14 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................TGGGAATGCCCTGCGCTACGCTCCTG............................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................CTGGGCTGTGGGGTCGCGG................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | |
| .......................................CGCTCCTGACGGTGAGTGCTGGGC............................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GCCCTGCGCTACGCTCCTGACGGT........................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................CTCTGGGAATGCCCTGCGCTA..................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |