| (2) AGO1.ip | (11) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (34) BRAIN | (1) CELL-LINE | (2) DGCR8.mut | (5) EMBRYO | (7) ESC | (5) FIBROBLAST | (3) KIDNEY | (11) LIVER | (2) LUNG | (13) OTHER | (5) OTHER.mut | (1) OVARY | (2) PANCREAS | (5) SKIN | (1) SPLEEN | (9) TESTES | (4) TOTAL-RNA | (1) UTERUS |
| TCAGGTGTGGCAGGGGCTGCACACTTCCTATAGAATTTGTATAAAACAGTCTGTGCCTATCCACTACACCGGAGCGCGTTGTTACGACCCAGTTCCTGTGCCTGTGCGCCTGGGCTGGCGAGTGCACCTATTAGGCCGTTTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGCCCTTTGGAGTGTTACTGTCTTGCCTCCTCTCCCTCAGGCTGAAGTTAAATAGCAAGAGGAACCAGCTGGTGCGAGAACTGGAGGAAG ...............................................................................................................................................(((((..((((((..((((...............))))..))).))).)))))...................................................... .......................................................................................................................................136.............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR042480(GSM539872) mouse kidney tissue [09-002]. (kidney) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042477(GSM539869) mouse brain tissue [09-002]. (brain) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR077866(GSM637803) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042478(GSM539870) mouse lung tissue [09-002]. (lung) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR065049(SRR065049) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042481(GSM539873) mouse pancreatic tissue [09-002]. (pancreas) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR042462(GSM539854) mouse macrophages [09-002]. (bone marrow) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | RuiDGCR8WT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | SRR065053(SRR065053) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | GSM510454(GSM510454) newborn_rep10. (total RNA) | GSM640581(GSM640581) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306538(GSM750581) 19-24nt. (ago2 brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAG........................................................................................ | 22 | 1 | 236.00 | 236.00 | 87.00 | 27.00 | 6.00 | 14.00 | 4.00 | - | 6.00 | 6.00 | 4.00 | 1.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | 4.00 | 2.00 | 3.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | 5.00 | 2.00 | 4.00 | 3.00 | 1.00 | - | 2.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 3.00 | 1.00 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAG........................................................................................ | 21 | 1 | 36.00 | 36.00 | - | 9.00 | 3.00 | - | - | - | - | 3.00 | 2.00 | - | 4.00 | - | - | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGC....................................................................................... | 23 | 1 | 31.00 | 31.00 | - | 11.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGA....................................................................................... | 23 | 1 | 27.00 | 236.00 | 8.00 | 4.00 | - | - | - | 10.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCA......................................................................................... | 21 | 1 | 21.00 | 21.00 | - | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAG........................................................................................ | 23 | 1 | 17.00 | 17.00 | - | 3.00 | - | - | - | 7.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAA........................................................................................ | 22 | 1 | 16.00 | 21.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGC.......................................................................................... | 20 | 1 | 15.00 | 15.00 | - | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAGC....................................................................................... | 22 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGT....................................................................................... | 23 | 1 | 10.00 | 236.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAT........................................................................................ | 22 | 1 | 7.00 | 21.00 | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCA......................................................................................... | 22 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCA......................................................................................... | 20 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAT........................................................................................ | 23 | 1 | 6.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGT.......................................................................................... | 20 | 5.00 | 0.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | |
| ....................................................................................................................................................................................TCTTGCCTCCTCTCCCTCAGA................................................. | 21 | 4.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGTA...................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 236.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAGA....................................................................................... | 22 | 1 | 3.00 | 36.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCT......................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 15.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGA.......................................................................................... | 20 | 3.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAAAA...................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 21.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................TGTCTTGCCTCCTCTCCCTCAGA................................................. | 23 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAT........................................................................................ | 21 | 1 | 2.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TCTTGCCTCCTCTCCCTCAGT................................................. | 21 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................TGGGAGCTGGAGCACTGCAG........................................................................................ | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TTTTTGGGAGCTGGAGCACTGCA......................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................AGTGTTACTGTCTTGCAATG............................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAGAAT..................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 36.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................AAATAGCAAGAGGAAGGA....................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................GGAGCTGGAGCACTGCAGCT...................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGCAGA.................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 31.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGAT...................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 236.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GTTTTTGGGAGCTGGAGCACTG........................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGC....................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGC.......................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGTAAG.................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGTAGA.................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 236.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TGGGAGCTGGAGCACTGCA......................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TGTTACGACCCAGTTCCTGTGCCT................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACT............................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAAA....................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 21.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAGAGA..................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 36.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................GTCTTGCCTCCTCTCCCTCAGA................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGA....................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCATT....................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACGGC.......................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................GGAGCTGGAGCACTGCAGCTC..................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................TGGGAGCTGGAGCACTGCAGC....................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGTA......................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAA........................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................GTGCGAGAACTGGAGAT.. | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAGT....................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 36.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................TGAAGTTAAATAGCAAGAGGAA.......................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................AACAGTCTGTGCCTAC.............................................................................................................................................................................................. | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAA........................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGAGT..................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 236.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGTAT..................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 236.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGGA...................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 236.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCCG........................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 15.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGAAC........................................................................................ | 22 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTCT.......................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTA........................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGCCCTTTGGAGTGTTACTGTCTTGCCTCCTCTCCCTCAG.................................................. | 60 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTCA.......................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCAGG....................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 36.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................AAATAGCAAGAGGAACCAGCTGGT................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TAAATAGCAAGAGGATCGC....................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................GTTACGACCCAGTTCCTGTGCCT................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGTAT..................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGAAG........................................................................................ | 22 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................TTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGT....................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTGGGAGCTGGAGCACTGCCT........................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTTGGGAGCTGGAGCACTGCAAAAA..................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 21.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TCAGGTGTGGCAGGGGCTGCACACTTCCTATAGAATTTGTATAAAACAGTCTGTGCCTATCCACTACACCGGAGCGCGTTGTTACGACCCAGTTCCTGTGCCTGTGCGCCTGGGCTGGCGAGTGCACCTATTAGGCCGTTTTTGGGAGCTGGAGCACTGCAGCCCTTTGGAGTGTTACTGTCTTGCCTCCTCTCCCTCAGGCTGAAGTTAAATAGCAAGAGGAACCAGCTGGTGCGAGAACTGGAGGAAG ...............................................................................................................................................(((((..((((((..((((...............))))..))).))).)))))...................................................... .......................................................................................................................................136.............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR042480(GSM539872) mouse kidney tissue [09-002]. (kidney) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042477(GSM539869) mouse brain tissue [09-002]. (brain) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR077866(GSM637803) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042478(GSM539870) mouse lung tissue [09-002]. (lung) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR065049(SRR065049) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042481(GSM539873) mouse pancreatic tissue [09-002]. (pancreas) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR042462(GSM539854) mouse macrophages [09-002]. (bone marrow) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | RuiDGCR8WT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | SRR065053(SRR065053) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | GSM510454(GSM510454) newborn_rep10. (total RNA) | GSM640581(GSM640581) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306538(GSM750581) 19-24nt. (ago2 brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................GAGCGCGTTGTTACGACCCAGTTCCTGTG...................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................CTGTGCGCCTGGGCTCGGC.................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................CAGTCTGTGCCTATCCAC.......................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |