| (1) AGO.mut | (14) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (28) BRAIN | (5) CELL-LINE | (2) DCR.mut | (6) EMBRYO | (4) FIBROBLAST | (1) HEART | (14) LIVER | (8) OTHER | (4) OTHER.mut | (1) PIWI.ip | (1) SKIN | (1) SPLEEN | (14) TESTES | (3) TOTAL-RNA | (1) UTERUS |
| CACCCAGCCCTTCGACCTGCAGGTGTATCACCCTTCCCGGCAGCCCATGGGTAAGGGGCCTTCAGGCGACTGAAGAGGAGCCACCAGCCCTTGGATGGGCGTGGGGGAGGTGCTGGGATAATGGGGTGTGAGGAGGGGATGAGACCTGGGTGAGAAGGGCCAGGGAGGGATCAACACATCCCAGGATGCTCTTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGCTCCAAACCCATGTGAGGCCAATGGCGGCCGGGGCCCCTGTTCCCATCTG ............................................................................................................................................................((.(((((((((((.(((..((((....))))...)))..))).)))))))).)).................................................... ......................................................................................................................................................151...........................................................213................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR394083(GSM855969) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (cell line) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR065047(SRR065047) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR065049(SRR065049) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR525237(SRA056111/SRX170313) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (Blood) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR553604(SRX182810) source: Spermatocytes. (Spermatocytes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR095855BC5(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR037919(GSM510457) e12p5_rep1. (embryo) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR077865(GSM637802) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR065048(SRR065048) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGT................................................. | 23 | 1 | 82.00 | 26.00 | 4.00 | 9.00 | 7.00 | 2.00 | - | 5.00 | 5.00 | - | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGA................................................. | 23 | 1 | 28.00 | 26.00 | 4.00 | 3.00 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAG.................................................. | 22 | 1 | 26.00 | 26.00 | - | 1.00 | - | 4.00 | - | - | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGAA................................................ | 24 | 1 | 10.00 | 26.00 | 8.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGTA................................................ | 24 | 1 | 7.00 | 26.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGAAT............................................... | 25 | 1 | 5.00 | 26.00 | - | - | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGC..................................................... | 19 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGGCCAGGGAGGGATCAAC........................................................................................ | 20 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGGCCAGGGAGGGATCAACA....................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGTT................................................ | 24 | 1 | 3.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCA................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGTTT............................................... | 25 | 1 | 2.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................CTTCCTCTCTCTGGGCCAGAAAA.............................................. | 23 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................................CTTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAG.................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....AGCCCTTCGACCTGCAG................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................AAGGGCCAGGGAGGGATCAAC........................................................................................ | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................TCCTCTCTCTGGGCCAGT................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGTG................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................TGGGATAATGGGGTGTGTGGG................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGCAAT.............................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGCAGGTGTATCACCCTTCCCGGCA............................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGTTAT.............................................. | 26 | 1 | 1.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AGCCCTTGGATGGGCGAC................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................AGCCCTTGGATGGGCGACC............................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGTGT............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGAAG............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGGATGGGCGTGGGGGC........................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................................................ATGTGAGGCCAATGGCGGCCGGGGCC.............. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................CTTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGT................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCC.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTAAGGGGCCTTCAGGCGACTGAAGAGGAG....................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GCCCTTCGACCTGCAGG................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCATAG................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................TGGGGTGTGAGGAGGGGGGCT......................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGATG............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 26.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................TGGGGTGTGAGGAGGGGGTTG......................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| ............................CACCCTTCCCGGCAGCCCATGGCTCC................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCATA................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................TGGGGTGTGAGGAGGTGA............................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................GTGTGAGGAGGGGATGAGACCTGGGTG............................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................GGCGACTGAAGAGGAT....................................................................................................................................................................................... | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGC................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCACCAT............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGG................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAAA................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGGCCAGGGAGGGATCAACAAA..................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGCAGGTGTATCACCCTTCCCGGCAG............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................CTTCCCGGCAGCCCATGGCTC.................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCAAGT................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................CTTCCTCTCTCTGGGCCAGACAA.............................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................GGGCCAGGGAGGGATCCCGG....................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
| ............................................................................................GGATGGGCGTGGGGGAGGTGCTGGGAT................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TCTTGCTTCCTCTCTCTGGGCCT................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGAT................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TCTTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGT................................................. | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................GCGTGGGGGAGGTGCTG.................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGTAT............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGGCCAGGGAGGGATCAACT....................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................AAGGGCCAGGGAGGGATCA.......................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................GGATGGGCGTGGGGG............................................................................................................................................................ | 15 | 9 | 0.22 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.22 |
| ............................................................................................GGATGGGCGTGGGGGCTG......................................................................................................................................................... | 18 | 9 | 0.11 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 |
| ............................................................................................GGATGGGCGTGGGGGCTC......................................................................................................................................................... | 18 | 9 | 0.11 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 |
| CACCCAGCCCTTCGACCTGCAGGTGTATCACCCTTCCCGGCAGCCCATGGGTAAGGGGCCTTCAGGCGACTGAAGAGGAGCCACCAGCCCTTGGATGGGCGTGGGGGAGGTGCTGGGATAATGGGGTGTGAGGAGGGGATGAGACCTGGGTGAGAAGGGCCAGGGAGGGATCAACACATCCCAGGATGCTCTTGCTTCCTCTCTCTGGGCCAGCTCCAAACCCATGTGAGGCCAATGGCGGCCGGGGCCCCTGTTCCCATCTG ............................................................................................................................................................((.(((((((((((.(((..((((....))))...)))..))).)))))))).)).................................................... ......................................................................................................................................................151...........................................................213................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR394083(GSM855969) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (cell line) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR065047(SRR065047) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR065049(SRR065049) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR525237(SRA056111/SRX170313) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (Blood) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR553604(SRX182810) source: Spermatocytes. (Spermatocytes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR095855BC5(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR037919(GSM510457) e12p5_rep1. (embryo) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR077865(GSM637802) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR065048(SRR065048) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................................................................................................................................................ATGGCGGCCGGGGCCCCGA.......... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | |
| .ACCCAGCCCTTCGACCTGCAGG................................................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................GCCAGCTCCAAACCCATGTGAGGCCAA............................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TGCTCTTGCTTCCTCGGCG.......................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................CTTCCTCTCTCTGGGCCAGCTCCAA............................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................GCCGGGGCCCCTGTTC....... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CCTCTCTCTGGGCCATTGA............................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................CTTCCTCTCTCTGGGCCAGCTCCA............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....CAGCCCTTCGACCT..................................................................................................................................................................................................................................................... | 14 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |