| (2) AGO1.ip | (18) AGO2.ip | (2) AGO3.ip | (39) BRAIN | (1) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (3) EMBRYO | (5) ESC | (1) HEART | (2) LIVER | (1) LUNG | (1) LYMPH | (4) OTHER | (6) OTHER.mut | (2) PANCREAS | (5) SKIN | (1) SPLEEN | (8) TESTES | (2) TOTAL-RNA | (1) UTERUS |
| CTTCTGACTTGTCACAGCTGAGCTATGTGCTCTTGGACCAGCCTCTGACCCTCTCTGGGTCTCCATCATGGAGATGATGGAATAGTTCAGACTCCCTAGGGTGTTGAGGGCCACAGGAATCCCTGTAATAGACACATGACCTTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTGACTCTCAGTGACACCCACTCCCTCCTTCACGCAGGCTGTCTTCTCGTCTGTGTTCTACTTTGCATCCGTTCCTCTCTACCAAGG ................................................................................................................................................((((((.((((...(((..((.((.....)).))...)))..)))).))))))..................................................... ........................................................................................................................................137............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR095853(SRX039174) "sequencing of miRNA from wild type and disea. (heart) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306538(GSM750581) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM361399(GSM361399) CGNP_P6_p53--_Ink4c--_rep2. (brain) | GSM261957(GSM261957) oocytesmallRNA-19to24. (oocyte) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR037907(GSM510443) brain_rep4. (brain) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR077865(GSM637802) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM361408(GSM361408) WholeCerebellum_P6_wt_rep1. (brain) | GSM361394(GSM361394) CGNP_P6_wt_rep1. (brain) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCAGT................................................. | 22 | 1 | 109.00 | 41.00 | 25.00 | 12.00 | 2.00 | 4.00 | 4.00 | 6.00 | 1.00 | 7.00 | 3.00 | 7.00 | 8.00 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCAG.................................................. | 21 | 1 | 41.00 | 41.00 | 1.00 | 5.00 | 5.00 | 5.00 | 6.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGT..................................................................................... | 23 | 1 | 11.00 | 11.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCAGA................................................. | 22 | 1 | 8.00 | 41.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCAT.................................................. | 21 | 1 | 5.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGC........................................................................................ | 21 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCA................................................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGC........................................................................................ | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTGT................................................................................... | 25 | 2.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTT.................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCCGT................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CCTGTGCCGTGACTCGGA............................................................................. | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGCAAA..................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTTT................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................CTGTCTTCTCGTCTGTGTTCTAC.......................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTA......................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................................................TTCTCGTCTGTGTTCTACTTTG...................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................ACGCAGGCTGTCTTCTTC...................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTG......................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCA...................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTG.................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................CTTTGCATCCGTTCCTCTCTACCAAG. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCAAT................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................CGTGGATGAGGCCTGTGC........................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................CTCGTCTGTGTTCTACTTTGCATCC................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTTCCGTGGATGAGGCCTGTA......................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTTTAT................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................ACTTTGCATCCGTTCCTCTCT....... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGCC....................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................ATGGAGATGATGGAACCT..................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCG...................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GGCTGTCTTCTCGTCTGTG................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGG..................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................CCACTCCCTCCTTCACGCAGT................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................CTTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGT..................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTAAT.................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTT.................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCATT................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................TGTCTTCTCGTCTGTGT............................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGC.................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TCTCGTCTGTGTTCTACTTTGCATCC................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................CGTGGATGAGGCCTGTGCCGTG.................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCTTCTCGTCTGT................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTGT................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTTT................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCCACTCCCTCCTTCACGCTT.................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................CCCTCCTTCACGCAG.................................................. | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................CCCTCCTTCACGCAGA................................................. | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |
| ..TCTGACTTGTCACAGC........................................................................................................................................................................................................................................ | 16 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 |
| CTTCTGACTTGTCACAGCTGAGCTATGTGCTCTTGGACCAGCCTCTGACCCTCTCTGGGTCTCCATCATGGAGATGATGGAATAGTTCAGACTCCCTAGGGTGTTGAGGGCCACAGGAATCCCTGTAATAGACACATGACCTTCCGTGGATGAGGCCTGTGCCGTGACTCTCAGTGACACCCACTCCCTCCTTCACGCAGGCTGTCTTCTCGTCTGTGTTCTACTTTGCATCCGTTCCTCTCTACCAAGG ................................................................................................................................................((((((.((((...(((..((.((.....)).))...)))..)))).))))))..................................................... ........................................................................................................................................137............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. 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(ago2 brain) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM361399(GSM361399) CGNP_P6_p53--_Ink4c--_rep2. (brain) | GSM261957(GSM261957) oocytesmallRNA-19to24. (oocyte) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR037907(GSM510443) brain_rep4. (brain) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR077865(GSM637802) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM361408(GSM361408) WholeCerebellum_P6_wt_rep1. (brain) | GSM361394(GSM361394) CGNP_P6_wt_rep1. (brain) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) |
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