| (6) AGO2.ip | (21) BRAIN | (4) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (17) EMBRYO | (3) ESC | (8) FIBROBLAST | (1) HEART | (10) LIVER | (4) OTHER | (12) OTHER.mut | (2) PANCREAS | (3) PIWI.ip | (23) TESTES | (2) TOTAL-RNA |
| AGCTGTTGTAAGGTAAGAGCTCCCGGCGGCAAAGCTGCCAACTGGGAGTCAAAGGCCAGCTCAGGCATCGCTTTCAACCCAAGACCAGGCTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGTCTCTGCCTTCTGCTTTCATCACAAATACCCGACCCCCACTGCACCCCCTGCCCTGTGA ..................................................((((..(((((((((.((.(((((.((........)).))))).)).))))))).)).))))........................................................ ....................................................53.................................................................120................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM416732(GSM416732) MEF. (cell line) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR065046(SRR065046) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM261957(GSM261957) oocytesmallRNA-19to24. (oocyte) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR037919(GSM510457) e12p5_rep1. (embryo) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR065054(SRR065054) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR037927(GSM510465) e7p5_rep1. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037922(GSM510460) e12p5_rep4. (embryo) | SRR037909(GSM510446) newborn_rep2. (total RNA) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR042475(GSM539867) mouse embryonic fibroblast cells [09-002]. (fibroblast) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR095855BC2(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM640581(GSM640581) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGT.......................................................... | 23 | 1 | 273.00 | 273.00 | 27.00 | - | 15.00 | 21.00 | 6.00 | 14.00 | 5.00 | 10.00 | 14.00 | - | 10.00 | 10.00 | 11.00 | 7.00 | 5.00 | 8.00 | 2.00 | 5.00 | 5.00 | 5.00 | 6.00 | 5.00 | - | 1.00 | 5.00 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | - | 3.00 | 4.00 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAG........................................................... | 22 | 1 | 79.00 | 79.00 | 3.00 | 31.00 | 7.00 | 1.00 | 13.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - |
| .........AAGGTAAGAGCTCCCaat............................................................................................................................................... | 18 | AAT | 13.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 13.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................TGAAAATGTTGCCTGAAGCAGT.......................................................... | 22 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 6.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGC............................................................. | 20 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCA............................................................ | 21 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGTa......................................................... | 24 | A | 4.00 | 273.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAG.............................................................. | 19 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| .........................................................AGCTCAGGCATCGCTTTCAACC........................................................................................... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGTt......................................................... | 24 | T | 2.00 | 273.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAtt.......................................................... | 23 | TT | 2.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GCTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGT.......................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GCTGAAAATGTTGCCTGAAGCAG........................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGa.......................................................... | 23 | A | 2.00 | 79.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGaagt.......................................................... | 23 | AAGT | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................TGAAAATGTTGCCTGAAGCAG........................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGc.......................................................... | 23 | C | 1.00 | 79.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAg............................................................... | 18 | G | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................AAGGCCAGCTCAGGCAcgca................................................................................................... | 20 | CGCA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGaag........................................................... | 22 | AAG | 1.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGgagt.......................................................... | 23 | GAGT | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................GGCGGCAAAGCTGCCAc................................................................................................................................. | 17 | C | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAt........................................................... | 22 | T | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................AAAGGCCAGCTCAGGgtga..................................................................................................... | 19 | GTGA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................TGAAAATGTTGCCTGAAGCAGTt......................................................... | 23 | T | 1.00 | 12.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................AGCTCAGGCATCGCTTTCAA............................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAccag........................................................... | 22 | CCAG | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................AGGCTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGTCTCTG..................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................CTGAAAATGTTGCCTGAAGCAct.......................................................... | 23 | CT | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................AGCTCAGGCATCGCTTTC............................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GCTGAAAATGTTGCCTGAAGC............................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| AGCTGTTGTAAGGTAAGAGCTCCCGGCGGCAAAGCTGCCAACTGGGAGTCAAAGGCCAGCTCAGGCATCGCTTTCAACCCAAGACCAGGCTGAAAATGTTGCCTGAAGCAGTCTCTGCCTTCTGCTTTCATCACAAATACCCGACCCCCACTGCACCCCCTGCCCTGTGA ..................................................((((..(((((((((.((.(((((.((........)).))))).)).))))))).)).))))........................................................ ....................................................53.................................................................120................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM416732(GSM416732) MEF. (cell line) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR065046(SRR065046) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM261957(GSM261957) oocytesmallRNA-19to24. (oocyte) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR037919(GSM510457) e12p5_rep1. (embryo) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR065054(SRR065054) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR037927(GSM510465) e7p5_rep1. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037922(GSM510460) e12p5_rep4. (embryo) | SRR037909(GSM510446) newborn_rep2. (total RNA) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR042475(GSM539867) mouse embryonic fibroblast cells [09-002]. (fibroblast) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR095855BC2(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM640581(GSM640581) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .........................................................................................................accgAGTCTCTGCCTTCTGCT............................................ | 21 | accg | 5.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................tccgAGTCTCTGCCTTCTGCT............................................ | 21 | tccg | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ..........................................................................................................tcgAGTCTCTGCCTTCTGCT............................................ | 20 | tcg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................tccgAGTCTCTGCCTTCTGC............................................. | 20 | tccg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................cgctGGAGTCAAAGGCCAG............................................................................................................... | 19 | cgct | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................ccagAGTCTCTGCCTTCTGCT............................................ | 21 | ccag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................accgAGTCTCTGCCTTCTGCTT........................................... | 22 | accg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................aACTGCACCCCCTGCCCTGTGA | 22 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................ttcgAGTCTCTGCCTTCTGC............................................. | 20 | ttcg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................agagCCCACTGCACCCCCT......... | 19 | agag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................cgGTTGCCTGAAGCAGTCT........................................................ | 19 | cg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................acgAGTCTCTGCCTTCTGC............................................. | 19 | acg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................cctgAGTCTCTGCCTTCTGCT............................................ | 21 | cctg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................acgAGTCTCTGCCTTCTGCT............................................ | 20 | acg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................atgAGTCTCTGCCTTCTGCT............................................ | 20 | atg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................caaGCACCCCCTGCCCTGTGA | 21 | caa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |