| (2) AGO1.ip | (23) AGO2.ip | (2) AGO3.ip | (2) B-CELL | (31) BRAIN | (2) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (11) EMBRYO | (5) ESC | (6) FIBROBLAST | (1) HEART | (10) LIVER | (3) LYMPH | (9) OTHER | (9) OTHER.mut | (4) PIWI.ip | (1) PIWI.mut | (6) SKIN | (4) SPLEEN | (19) TESTES | (4) THYMUS | (2) TOTAL-RNA |
| TGCTCCTCCTGCCCGCCCCCACACATGCCCCGTGCTCCGGCCATACCCAGCGCCTTGCAGTCTAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGGACATGCTGTTCCTTCTGCCTGGGATTTCCTTGTCTGCCTGGTGAACTCGTTCTGCAAGACTGCATTCAAACAGCACCTCCGAGAAGACTGCCCT .........................................................(((..((((((((..((((.((....((((.....)).))....)).)))).)))))))).))).......................................................... .........................................................58..............................................................122....................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR077866(GSM637803) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR306538(GSM750581) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR095853(SRX039174) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR077865(GSM637802) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR042479(GSM539871) mouse liver tissue [09-002]. (liver) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR042460(GSM539852) mouse neutrophil cells replicate 2 [09-002]. (blood) | GSM361408(GSM361408) WholeCerebellum_P6_wt_rep1. (brain) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042444(GSM539836) mouse pre B cells [09-002]. (b cell) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (blood) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR059774(GSM562836) MEF_control. (MEF) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | GSM640581(GSM640581) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042461(GSM539853) mouse dendritic cells [09-002]. (bone marrow) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGT............................................................. | 21 | 1 | 213.00 | 213.00 | 15.00 | 14.00 | 10.00 | 12.00 | 10.00 | 12.00 | 9.00 | - | 6.00 | 2.00 | 5.00 | 2.00 | 4.00 | 3.00 | 2.00 | 3.00 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | - | 4.00 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | 2.00 | 3.00 | - | 3.00 | 1.00 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | 2.00 | 2.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 3.00 | 1.00 | 3.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGG.............................................................................................. | 23 | 1 | 40.00 | 40.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGTt............................................................ | 22 | T | 14.00 | 213.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTTG............................................................................................... | 22 | 1 | 12.00 | 12.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................TCTGCCTGGGATTTCCTTGT............................................................. | 20 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTG.............................................................. | 20 | 1 | 7.00 | 7.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGa............................................................. | 21 | A | 5.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................GGATTTCCTTGTCTGCCTGGTGAACTCGTTCTG........................................ | 33 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGTa............................................................ | 22 | A | 4.00 | 213.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGt.............................................................................................. | 23 | T | 4.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGTtt........................................................... | 23 | TT | 4.00 | 213.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGGA............................................................................................. | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTT............................................................... | 19 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTT................................................................................................ | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................TGAACTCGTTCTGCAAGACTGCATTCAA......................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGc............................................................. | 21 | C | 2.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................TGAACTCGTTCTGCAAGACTGCATTCAAAC....................... | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................ATTTCCTTGTCTGCCTGGTGAA................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGTat........................................................... | 23 | AT | 2.00 | 213.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGa.............................................................................................. | 23 | A | 1.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................AAGGAGAGCCCCATGCCTTTGGAC............................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TCGTTCTGCAAGACTGCAT............................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................GGTGAACTCGTTCTGCAAGACTGCA.............................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GATTTCCTTGTCTGCCTGG..................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CTAAGGAGAGCCCCATGCCTTT................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGGt............................................................................................. | 24 | T | 1.00 | 40.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTa.............................................................. | 20 | A | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................AACTCGTTCTGCAAGACTGCATTCAAACA...................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................TTCAAACAGCACCTCCGAGAAGACT..... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................CTTCTGCCTGGGATTTCCTTGT............................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGTta........................................................... | 23 | TA | 1.00 | 213.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................GGTGAACTCGTTCTGCAAGACTGC............................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CTAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGGttat.......................................................................................... | 28 | TTAT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................GCCTGGTGAACTCGTTCTGCAAGACTGCA.............................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................GAACTCGTTCTGCAAGACTGCAT............................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................GGTGAACTCGTTCTGCAAGACTGCAT............................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................GCAGTCTAAGGAGAGCCCCA....................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCgtgg............................................................. | 21 | GTGG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCC................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TGCCTGGTGAACTCGc............................................ | 16 | C | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCgtgt............................................................. | 21 | GTGT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCg................................................................ | 18 | G | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TTCTGCCTGGGATTTCCTTGTaa........................................................... | 23 | AA | 1.00 | 213.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................TGGTGAACTCGTTCTGCAAGACTGC............................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TCAAACAGCACCTCCGAGAcg........ | 21 | CG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................TGAACTCGTTCTGCAAGACTGCATTC........................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TGCTCCTCCTGCCCGCCCCCACACATGCCCCGTGCTCCGGCCATACCCAGCGCCTTGCAGTCTAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGGACATGCTGTTCCTTCTGCCTGGGATTTCCTTGTCTGCCTGGTGAACTCGTTCTGCAAGACTGCATTCAAACAGCACCTCCGAGAAGACTGCCCT .........................................................(((..((((((((..((((.((....((((.....)).))....)).)))).)))))))).))).......................................................... .........................................................58..............................................................122....................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR077866(GSM637803) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR306538(GSM750581) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR095853(SRX039174) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR077865(GSM637802) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR042479(GSM539871) mouse liver tissue [09-002]. (liver) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR042460(GSM539852) mouse neutrophil cells replicate 2 [09-002]. (blood) | GSM361408(GSM361408) WholeCerebellum_P6_wt_rep1. (brain) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042444(GSM539836) mouse pre B cells [09-002]. (b cell) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (blood) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR059774(GSM562836) MEF_control. (MEF) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | GSM640581(GSM640581) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042461(GSM539853) mouse dendritic cells [09-002]. (bone marrow) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................CCAGCGCCTTGCAGTCTAAGGAGAG............................................................................................................ | 25 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................GTCTGCCTGGTGAACTCGTTCTGCAA..................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................cctaCTGTTCCTTCTGCCT.......................................................................... | 19 | ccta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TAAGGAGAGCCCCATGCCTTTGG.............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................tctCATACCCAGCGCCTT........................................................................................................................... | 18 | tct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TTTGGACATGCTGTTCCTTCTGCCTG......................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................cacaAAACAGCACCTCCGA............ | 19 | caca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................CATGCTGTTCCTTCTGCCT.......................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................caacGTTCCTTCTGCCTGG........................................................................ | 19 | caac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................ggtcCTGTTCCTTCTGCCT.......................................................................... | 19 | ggtc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |