| (1) AGO2.ip | (3) B-CELL | (7) CELL-LINE | (14) EMBRYO | (13) ESC | (6) FIBROBLAST | (2) LIVER | (2) LYMPH | (4) OTHER | (8) OTHER.mut | (3) PIWI.ip | (6) SPLEEN | (24) TESTES | (4) THYMUS | (1) TOTAL-RNA |
| TTCATGAGCAGTTAGAGATCATCCTGGAATAATGTGATGGCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGCGTAAGTGCCTGCATGTATATGCGTGTATATTTTATGCATATACATACACACACCTACACACACATGCACACAGACATGCGGGAATGGCACTCACGGATCCATTTGAATGATATGTGACCT ..................................................(((.(((.(((..((.(((((((((((((.......))))))))))))).))..))).))).))).................................................... ...........................................................60................................................................126....................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR023847(GSM307156) mESv6.5smallrna_rep1. (cell line) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR037923(GSM510461) e9p5_rep1. (embryo) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR037926(GSM510464) e9p5_rep4. (embryo) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR037927(GSM510465) e7p5_rep1. (embryo) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042470(GSM539862) mouse Th17 cells [09-002]. (lymph) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (blood) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | GSM314558(GSM314558) ESC wild type (454). (ESC) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042451(GSM539843) mouse B cells activated in vitro with LPS/aIgD-Dextran [09-002]. (b cell) | SRR037919(GSM510457) e12p5_rep1. (embryo) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 19 | 7 | 661.86 | 661.86 | 203.71 | 71.14 | 73.29 | 75.86 | 69.71 | 49.43 | 22.14 | 19.71 | 1.86 | 11.00 | 11.86 | 9.71 | 8.71 | 5.14 | - | 4.14 | - | 3.71 | 1.43 | 2.43 | 2.14 | 0.71 | 1.14 | 0.29 | - | 0.43 | 1.00 | - | 0.86 | 0.57 | 0.14 | 0.57 | 0.57 | 0.71 | 0.43 | 0.57 | 0.57 | 0.14 | - | 0.43 | 0.43 | 0.43 | 0.14 | 0.29 | 0.14 | - | 0.14 | 0.43 | 0.29 | - | - | - | 0.29 | 0.29 | - | 0.29 | 0.14 | 0.29 | 0.14 | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 20 | 7 | 135.57 | 135.57 | 45.86 | 13.43 | 19.29 | 11.14 | 12.00 | 10.43 | 2.86 | 2.14 | 1.29 | 3.14 | 1.71 | 1.29 | 2.43 | 1.71 | - | 1.00 | - | 0.29 | 0.71 | 0.14 | 0.14 | 0.43 | - | 0.43 | - | 0.43 | 0.14 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | 0.29 | 0.14 | 0.29 | 0.14 | 0.29 | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 20 | 9 | 85.44 | 85.44 | 22.67 | 14.78 | 8.44 | 10.22 | 13.22 | 7.22 | 0.44 | 1.44 | 0.78 | 0.78 | 0.67 | 0.33 | 0.44 | 0.44 | - | - | - | - | - | - | - | 0.22 | 0.56 | 0.11 | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.11 | 0.11 | 0.11 | - | 0.11 | 0.11 | - | 0.22 | 0.33 | - | 0.11 | 0.11 | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | 0.11 | 0.11 | 0.11 | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGA..................................... | 25 | 10 | 15.80 | 15.80 | 0.20 | - | - | 0.40 | 0.10 | - | - | - | 7.90 | - | 0.20 | 0.10 | - | - | 4.60 | - | 1.80 | - | 0.10 | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 21 | 7 | 12.00 | 12.00 | 1.43 | 1.57 | 1.86 | 1.29 | 1.57 | 1.86 | 0.29 | - | - | 0.29 | 0.57 | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | 0.57 | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................CCTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 21 | 9 | 10.56 | 10.56 | 2.33 | 1.89 | 0.56 | 1.00 | 2.89 | 0.67 | - | 0.22 | 0.22 | - | - | - | - | 0.11 | - | 0.44 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAA.................................... | 26 | 10 | 6.60 | 6.60 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 0.10 | 0.10 | - | 0.90 | - | 1.60 | - | 0.40 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................CCCTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 22 | 9 | 4.00 | 4.00 | 1.11 | 0.44 | 0.56 | 0.22 | 0.67 | 0.44 | - | - | 0.22 | - | - | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAATGG................................. | 29 | 8 | 2.62 | 2.62 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.38 | - | 0.25 | 0.12 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................CCCCTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 23 | 8 | 2.50 | 2.50 | 0.50 | - | - | 0.62 | 0.12 | 0.12 | - | 0.12 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.38 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTGCGT...................................................................................................................... | 20 | 7 | 1.43 | 1.43 | 0.57 | - | - | - | 0.29 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGggcg....................................................................................................................... | 19 | GGCG | 1.20 | 0.00 | 0.50 | - | - | 0.20 | 0.40 | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGG...................................... | 24 | 10 | 1.20 | 1.20 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | 0.40 | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................CCTATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 22 | 7 | 1.14 | 1.14 | 0.14 | 0.29 | - | 0.29 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................CCCCTATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 24 | 7 | 1.14 | 1.14 | 0.29 | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAATGGCACaa............................ | 34 | AA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAATGGCA............................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................CCCTATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 23 | 7 | 1.00 | 1.00 | 0.14 | - | - | 0.29 | - | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGcgcg....................................................................................................................... | 19 | CGCG | 0.90 | 0.00 | 0.20 | - | - | 0.10 | 0.20 | 0.20 | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGagcg....................................................................................................................... | 19 | AGCG | 0.80 | 0.00 | 0.30 | - | - | - | 0.30 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................GCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 24 | 8 | 0.62 | 0.62 | 0.12 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGggcg....................................................................................................................... | 20 | GGCG | 0.56 | 0.00 | 0.44 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGTGCGTt..................................................................................................................... | 22 | T | 0.43 | 0.14 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTGCGa...................................................................................................................... | 20 | A | 0.43 | 661.86 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTGCc....................................................................................................................... | 19 | C | 0.38 | 0.00 | 0.12 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAATGGC................................ | 30 | 8 | 0.38 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTGggc........................................................................................................................ | 20 | GGC | 0.33 | 0.00 | 0.11 | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGTtcg....................................................................................................................... | 20 | TCG | 0.33 | 0.00 | 0.22 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGcgc........................................................................................................................ | 19 | CGC | 0.33 | 0.00 | 0.11 | - | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTtcg....................................................................................................................... | 19 | TCG | 0.30 | 0.00 | - | - | 0.10 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAAa................................... | 27 | A | 0.30 | 6.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTacg....................................................................................................................... | 19 | ACG | 0.30 | 0.00 | - | - | 0.10 | - | - | - | 0.10 | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGggca....................................................................................................................... | 19 | GGCA | 0.30 | 0.00 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................GCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 25 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAATGGa................................ | 30 | A | 0.25 | 2.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAATGGaa............................... | 31 | AA | 0.25 | 2.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................ATGGCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 27 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTGcgc........................................................................................................................ | 20 | CGC | 0.22 | 0.00 | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTGTac........................................................................................................................ | 20 | AC | 0.22 | 0.00 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGcgca....................................................................................................................... | 19 | CGCA | 0.20 | 0.00 | 0.10 | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................ACACATGCACACAGACATGCGGGAAa................................... | 26 | A | 0.20 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................TGTATGTGCCTGTGTGCGa...................................................................................................................... | 19 | A | 0.17 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTGCGgc..................................................................................................................... | 21 | GC | 0.14 | 661.86 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGTGCGcacg................................................................................................................... | 24 | CACG | 0.14 | 135.57 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTGCGTAA.................................................................................................................... | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGTGCGT...................................................................................................................... | 21 | 7 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................GGCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGCG....................................................................................................................... | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................GGCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 25 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGTGCc....................................................................................................................... | 20 | C | 0.12 | 0.00 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGGCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGC........................................................................................................................ | 26 | 8 | 0.12 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................GCACACAGACATGCGGGAATGGa................................ | 23 | A | 0.12 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTtcgc........................................................................................................................ | 19 | TCGC | 0.11 | 0.00 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGagcg....................................................................................................................... | 20 | AGCG | 0.11 | 0.00 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTGTGg........................................................................................................................ | 20 | G | 0.11 | 0.00 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTGagcg....................................................................................................................... | 21 | AGCG | 0.11 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CTATGTATGTGCCTGTttgc........................................................................................................................ | 20 | TTGC | 0.11 | 0.00 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGagc........................................................................................................................ | 19 | AGC | 0.11 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................CCTATGTATGTGCCTGTGTtc........................................................................................................................ | 21 | TC | 0.11 | 0.00 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTttgc........................................................................................................................ | 19 | TTGC | 0.11 | 0.00 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGCACACAGACATGCGGGAATGG................................. | 23 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGcgcg....................................................................................................................... | 20 | CGCG | 0.11 | 0.00 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGggca....................................................................................................................... | 20 | GGCA | 0.11 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................CCTATGTATGTGCCTGTGggc........................................................................................................................ | 21 | GGC | 0.11 | 0.00 | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TATGTATGTGCCTGTGTacg....................................................................................................................... | 20 | ACG | 0.11 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGt..................................... | 25 | T | 0.10 | 1.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAAT................................... | 27 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAt.................................... | 26 | T | 0.10 | 15.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTtgcg...................................................................................................................... | 20 | TGCG | 0.10 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGTccg....................................................................................................................... | 19 | CCG | 0.10 | 0.00 | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................ATGTATGTGCCTGTGctcc....................................................................................................................... | 19 | CTCC | 0.10 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAAaa.................................. | 28 | AA | 0.10 | 6.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CACACATGCACACAGACATGCGGGAc.................................... | 26 | C | 0.10 | 15.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TTCATGAGCAGTTAGAGATCATCCTGGAATAATGTGATGGCCCCTATGTATGTGCCTGTGTGCGTAAGTGCCTGCATGTATATGCGTGTATATTTTATGCATATACATACACACACCTACACACACATGCACACAGACATGCGGGAATGGCACTCACGGATCCATTTGAATGATATGTGACCT ..................................................(((.(((.(((..((.(((((((((((((.......))))))))))))).))..))).))).))).................................................... ...........................................................60................................................................126....................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR023847(GSM307156) mESv6.5smallrna_rep1. (cell line) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR037923(GSM510461) e9p5_rep1. (embryo) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR037926(GSM510464) e9p5_rep4. (embryo) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR037927(GSM510465) e7p5_rep1. (embryo) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042470(GSM539862) mouse Th17 cells [09-002]. (lymph) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (blood) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | GSM314558(GSM314558) ESC wild type (454). (ESC) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042451(GSM539843) mouse B cells activated in vitro with LPS/aIgD-Dextran [09-002]. (b cell) | SRR037919(GSM510457) e12p5_rep1. (embryo) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................................................................................acaATGCGGGAATGGCAC.............................. | 18 | aca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |