| (7) AGO2.ip | (16) BRAIN | (7) CELL-LINE | (1) DGCR8.mut | (17) EMBRYO | (12) ESC | (8) FIBROBLAST | (3) LIVER | (1) LYMPH | (5) OTHER | (11) OTHER.mut | (3) PIWI.ip | (2) PIWI.mut | (4) SPLEEN | (27) TESTES | (3) THYMUS | (3) TOTAL-RNA | (1) TRIM32.ip |
| GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGGTGTGTATATACATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATGTACATGTGAGTATGTGTGTGTATATGTTTGTACATGTGCATGTGTGTGAGTATGTGAATATATGTGTATATGTGTGCATGTGCATGTGTGTGTATGGTGAGTAGGTGTTACTAATTGTGACTCCGATGGCTGTGTCTCC ..................................................(((..((..((((((((((((((((((..(((((((((.((((((((..(((((......)))))..)))))))).)))))))))..))))))))))))))))))..))..))).................................................. ................................................................65...............................................................................................................178.......................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR023847(GSM307156) mESv6.5smallrna_rep1. (cell line) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037923(GSM510461) e9p5_rep1. (embryo) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR059770(GSM562832) Treg_Dicer. (spleen) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM314558(GSM314558) ESC wild type (454). (ESC) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037926(GSM510464) e9p5_rep4. (embryo) | GSM361408(GSM361408) WholeCerebellum_P6_wt_rep1. (brain) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM361407(GSM361407) CGNP_P6_Ptc+-_Ink4c--_rep5. (brain) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | GSM361398(GSM361398) CGNP_P6_p53--_Ink4c--_rep1. (brain) | GSM361415(GSM361415) WholeCerebellum_P6_p53--_Ink4c--_rep4. (brain) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM361395(GSM361395) CGNP_P6_wt_rep2. (brain) | GSM361402(GSM361402) CGNP_P6_p53--_Ink4c--_rep5. (brain) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | GSM416732(GSM416732) MEF. (cell line) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR065053(SRR065053) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR037927(GSM510465) e7p5_rep1. (embryo) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR077865(GSM637802) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR014237(GSM319961) 10 dpp MILI-KO total. (mili testes) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | GSM261957(GSM261957) oocytesmallRNA-19to24. (oocyte) | SRR037919(GSM510457) e12p5_rep1. (embryo) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | GSM566419(GSM566419) Endougenous small RNA from mouse NIH3T3 cells, without MHV-68 infection. (fibroblast) | GSM317181(GSM317181) total small RNAs from mouse brain. (brain) | GSM317184(GSM317184) TRIM32 IP small RNAs from mouse brain. (trim32 brain) | GSM317182(GSM317182) control IP small RNAs from mouse brain. (brain) |
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| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAa................................................................................................................................. | 24 | A | 20.33 | 343.00 | 3.00 | 2.33 | 1.33 | - | 1.00 | 0.33 | - | - | 0.67 | 1.33 | 0.33 | 1.00 | - | 0.67 | - | 2.00 | 0.67 | - | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAt................................................................................................................................. | 24 | T | 10.33 | 343.00 | 2.33 | 2.00 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.33 | - | 0.67 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAaa................................................................................................................................ | 25 | AA | 6.67 | 343.00 | - | - | - | 0.67 | - | - | 0.33 | - | 1.00 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAac................................................................................................................................ | 25 | AC | 4.67 | 343.00 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAc................................................................................................................................. | 24 | C | 3.67 | 343.00 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAat................................................................................................................................ | 25 | AT | 3.00 | 343.00 | - | - | - | 1.00 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................GTGTACATGTACATGTGAaa................................................................................................................................ | 20 | AA | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATATGTGTGCATGTGCATGTtat................................................. | 23 | TAT | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................GTGTGTGTACATGTACATGTGA.................................................................................................................................. | 22 | 3 | 1.33 | 1.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................GTGTGTGTGTACATGTACcagt.................................................................................................................................... | 22 | CAGT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAca................................................................................................................................ | 25 | CA | 1.00 | 343.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................TGTGTGTGTATGGTGAGTtagg................................. | 22 | TAGG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................CGATGGCTGTGTCTCgtgt | 19 | GTGT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAaaa............................................................................................................................... | 26 | AAA | 1.00 | 343.00 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GTATATGTGTGCATGTGCATGaa................................................... | 23 | AA | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................GTGTGTGCAGGTGTGaggc................................................................................................................................................................................. | 19 | AGGC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAact............................................................................................................................... | 26 | ACT | 1.00 | 343.00 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................TGTGTGTGTATGGTGAagcc................................... | 20 | AGCC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................ATATGTGTGCATGTGCATGTaa.................................................. | 22 | AA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................TATATGTTTGTACATGTacct.................................................................................................. | 21 | ACCT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................TATGTGTGTGTATATGgata............................................................................................................. | 20 | GATA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGcg................................................................................................................................... | 22 | CG | 0.80 | 0.00 | - | - | - | 0.10 | - | 0.10 | - | 0.20 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAtt................................................................................................................................ | 25 | TT | 0.67 | 343.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAaga............................................................................................................................... | 26 | AGA | 0.67 | 343.00 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAag................................................................................................................................ | 25 | AG | 0.67 | 343.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAaaaa.............................................................................................................................. | 27 | AAAA | 0.67 | 343.00 | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................ATATATATGTGTGTGTGTGTGaaat..................................................................................................................................................... | 25 | AAAT | 0.50 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TATATATGTGTGTGTGTGTGataa..................................................................................................................................................... | 24 | ATAA | 0.50 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................GTGTGTGTGTACATGTACATGTGA.................................................................................................................................. | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAGT................................................................................................................................ | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTag.................................................................................................................................. | 23 | AG | 0.50 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | 0.10 | - | 0.10 |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGga................................................................................................................................. | 24 | GA | 0.44 | 0.00 | - | 0.11 | - | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGggt.................................................................................................................................. | 23 | GGT | 0.40 | 0.00 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAta................................................................................................................................ | 25 | TA | 0.33 | 343.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAtaaa.............................................................................................................................. | 27 | TAAA | 0.33 | 343.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAGat............................................................................................................................... | 26 | AT | 0.33 | 4.00 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAGgaa.............................................................................................................................. | 27 | GAA | 0.33 | 4.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAaaga.............................................................................................................................. | 27 | AAGA | 0.33 | 343.00 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGTGAtaa............................................................................................................................... | 26 | TAA | 0.33 | 343.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................GTGTGTGTACATGTACATGTGAa................................................................................................................................. | 23 | A | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................................TGTGTATATGTGTGCATGTGCATG..................................................... | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGgt................................................................................................................................... | 22 | GT | 0.10 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTGTGTACATGTACATGcga.................................................................................................................................. | 23 | CGA | 0.10 | 0.00 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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