| (8) BRAIN | (9) CELL-LINE | (8) EMBRYO | (5) ESC | (2) LIVER | (2) LYMPH | (5) OTHER | (4) OTHER.mut | (1) PIWI.ip | (1) SPLEEN | (14) TESTES | (1) THYMUS | (3) TOTAL-RNA |
| CGCCCGCCACGCTGTAGAAGGACAGGCAGCCAGTCCTGAAGTCCAGCGCCACGCCGAGCGTGTGGTGGTAGGATCCGTGTAGCACCGTCTGTGTGTTGTTGTGCCACACAGAGAACTTGAGCGAATCCCACTCCAGACACCATGAGTAGGGGTTGCGGCCCAGCAGGTAGACGATGTTGCGACGGGGGCGACCGCTCAGC ..................................................((((...)))).(((.(((.((((.(((....((...(((.(((((.((...)).))))).)))...)).))).)))).))))))....((.......)).................................................. ..................................................51.................................................................................................150................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037922(GSM510460) e12p5_rep4. (embryo) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR037907(GSM510443) brain_rep4. (brain) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR039152(GSM471929) HL1_siNon_smallRNAseq. (muscle) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR037927(GSM510465) e7p5_rep1. (embryo) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR037911(GSM510448) newborn_rep4. (total RNA) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACACCA.......................................................... | 18 | 1 | 82.00 | 82.00 | 11.00 | - | 10.00 | 7.00 | 6.00 | - | 5.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | 3.00 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - |
| ...........................................................................................................................AATCCCACTCCAGACACCA.......................................................... | 19 | 1 | 15.00 | 15.00 | - | 8.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TCCCACTCCAGACACCA.......................................................... | 17 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................TGCGGCCCAGCAGGTAGACGAT......................... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................AGACACCATGAGTAGGGG................................................ | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACACaa.......................................................... | 18 | AA | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACACCATt........................................................ | 20 | T | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GAATCCCACTCCAGACACCA.......................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................AATCCCACTCCAGACACCct......................................................... | 20 | CT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TAGCACCGTCTGTGTtcgg...................................................................................................... | 19 | TCGG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CCAGCAGGTAGACGATGT....................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TGAGTAGGGGTTGCGGCCCAGCAGG................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GAATCCCACTCCAGACccca.......................................................... | 20 | CCCA | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TCCCACTCCAGACACCtat........................................................ | 19 | TAT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TAGCACCGTCTGTGTttg....................................................................................................... | 18 | TTG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACAaca.......................................................... | 18 | ACA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACACta.......................................................... | 18 | TA | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACAgca.......................................................... | 18 | GCA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................AACTTGAGCGAATCCCACTCC.................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................CGCCACGCCGAGCGTcgcc....................................................................................................................................... | 19 | CGCC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACACCAT......................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................AATCCCACTCCAGACACCc.......................................................... | 19 | C | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................AATCCCACTCCAGACccca.......................................................... | 19 | CCCA | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CGAATCCCACTCCAGACACCA.......................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................AGCAGGTAGACGATG........................ | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACACCt.......................................................... | 18 | T | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ATCCCACTCCAGACACC........................................................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
| CGCCCGCCACGCTGTAGAAGGACAGGCAGCCAGTCCTGAAGTCCAGCGCCACGCCGAGCGTGTGGTGGTAGGATCCGTGTAGCACCGTCTGTGTGTTGTTGTGCCACACAGAGAACTTGAGCGAATCCCACTCCAGACACCATGAGTAGGGGTTGCGGCCCAGCAGGTAGACGATGTTGCGACGGGGGCGACCGCTCAGC ..................................................((((...)))).(((.(((.((((.(((....((...(((.(((((.((...)).))))).)))...)).))).)))).))))))....((.......)).................................................. ..................................................51.................................................................................................150................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037922(GSM510460) e12p5_rep4. (embryo) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR037907(GSM510443) brain_rep4. (brain) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR039152(GSM471929) HL1_siNon_smallRNAseq. (muscle) | SRR037905(GSM510441) brain_rep2. (brain) | SRR037927(GSM510465) e7p5_rep1. (embryo) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR037911(GSM510448) newborn_rep4. (total RNA) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................................................................GCGGCCCAGCAGGTAGA............................. | 17 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGCCAGTCCTGAAGTCCAG.......................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GGGTTGCGGCCCAGCAGGTAGACG........................... | 24 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GAATCCCACTCCAGACACCATGAGTA.................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................CCAGTCCTGAAGTCCAGC......................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................GCCACACAGAGAACTTGAGCGAATCCCA...................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................ACAGGCAGCCAGTCCTGAAGTCCA........................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................ccatTTGAGCGAATCCCAC..................................................................... | 19 | ccat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................GACAGGCAGCCAGTCCTGAAGTCCA........................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................cgtGTCCTGAAGTCCAGC......................................................................................................................................................... | 18 | cgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAGCGAATCCCACTCCAGACACCA.......................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CGAATCCCACTCCAGACACCATGAGTA.................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................gcTCCAGCGCCACGCCGA............................................................................................................................................... | 18 | gc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...........................tgaCAGTCCTGAAGTCCA........................................................................................................................................................... | 18 | tga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGCCAGTCCTGAAGTCCA........................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
| ............................GCCAGTCCTGAAGTCCA........................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |