| (1) AGO2.ip | (14) BRAIN | (5) CELL-LINE | (2) DCR.mut | (14) EMBRYO | (8) ESC | (1) FIBROBLAST | (4) LIVER | (1) OTHER | (5) OTHER.mut | (2) PIWI.ip | (1) SKIN | (10) TESTES | (1) THYMUS | (6) TOTAL-RNA | (1) UTERUS |
| ATCCACAGGGCTCAAGCCCCCCGGTCGGCGTCTCTTTCAGCCCAACTCCTGCCCCAGCTTCCCCAGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGTGAAGTTAGGTTCACCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGGGGAGGTGTGCCTCCTCTTCCCCCTGCATCTGCAGAAGTCTGATTTATGGCTGGAGGGGTT ..................................................(((((..((((((((((((((.(((((............))))))))))..))).))))))..)))))................................................... ...........................................................60..................................................................128...................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR037933(GSM510471) 293cand4_rep2. (cell line) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR037922(GSM510460) e12p5_rep4. (embryo) | SRR037923(GSM510461) e9p5_rep1. (embryo) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR042475(GSM539867) mouse embryonic fibroblast cells [09-002]. (fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR032477(GSM485235) sRNA_activation_deep_sequencing. (uterus) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | GSM361408(GSM361408) WholeCerebellum_P6_wt_rep1. (brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037910(GSM510447) newborn_rep3. (total RNA) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGT................................................................................................. | 23 | 1 | 42.00 | 42.00 | - | 5.00 | 3.00 | 4.00 | 1.00 | - | 1.00 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTG.................................................................................................. | 22 | 1 | 21.00 | 21.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGa................................................................................................. | 23 | A | 12.00 | 21.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .................................................................GTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGT................................................................................................. | 22 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGT................................................................................................... | 21 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGG.................................................................................................... | 20 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGaat.......................................................... | 26 | AAT | 6.00 | 2.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................GTTCTCAGGCCCGCTGTGGTG.................................................................................................. | 21 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGG............................................................ | 24 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGt............................................................ | 24 | T | 3.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................GTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGa................................................................................................. | 22 | A | 2.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGTat............................................................................................... | 25 | AT | 2.00 | 42.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............GCCCCCCGGTCGGCGTCc....................................................................................................................................................... | 18 | C | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGa............................................................ | 24 | A | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGG............................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGA................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................CCCCCGGTCGGCGTCcc...................................................................................................................................................... | 17 | CC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................TTATGGCTGGAGGGGgtat | 19 | GTAT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................CTCAGGCCCGCTGTGGTG.................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................GTTCTCAGGCCCGCTGTGGTaa................................................................................................. | 22 | AA | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTaag................................................................................................ | 24 | AAG | 1.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGa................................................................................................... | 21 | A | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGTaaa.............................................................................................. | 26 | AAA | 1.00 | 42.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAG.............................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGTt................................................................................................ | 24 | T | 1.00 | 42.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TCAGGCCCGCTGTGGTGg................................................................................................. | 18 | G | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGttt.......................................................... | 26 | TTT | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................TTCTCAGGCCCGCTGctc.................................................................................................... | 18 | CTC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................TTTATGGCTGGAGGGGggtg | 20 | GGTG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGa............................................................. | 23 | A | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGtaa.......................................................... | 26 | TAA | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................ACCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGG............................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGtt........................................................... | 25 | TT | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TCACCAAGCGGCTGCag...................................................................... | 17 | AG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGGaa.......................................................... | 26 | AA | 1.00 | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................GTTCTCAGGCCCGCTGTGGT................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................GTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGTa................................................................................................ | 23 | A | 1.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGTtaa.............................................................................................. | 26 | TAA | 1.00 | 42.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................TCTCAGGCCCGCTGTGGTGT................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................CCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGagt.......................................................... | 26 | AGT | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................ATGGCTGGAGGGGTTgtc | 18 | GTC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................ATGGCTGGAGGGGTTgca | 18 | GCA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTG....................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ATCCACAGGGCTCAAGCCCCCCGGTCGGCGTCTCTTTCAGCCCAACTCCTGCCCCAGCTTCCCCAGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGTGAAGTTAGGTTCACCAAGCGGCTGCCCTGGGAGAGGGGGAGGTGTGCCTCCTCTTCCCCCTGCATCTGCAGAAGTCTGATTTATGGCTGGAGGGGTT ..................................................(((((..((((((((((((((.(((((............))))))))))..))).))))))..)))))................................................... ...........................................................60..................................................................128...................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037921(GSM510459) e12p5_rep3. (embryo) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR037933(GSM510471) 293cand4_rep2. (cell line) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR037922(GSM510460) e12p5_rep4. (embryo) | SRR037923(GSM510461) e9p5_rep1. (embryo) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR037924(GSM510462) e9p5_rep2. (embryo) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR042475(GSM539867) mouse embryonic fibroblast cells [09-002]. (fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR032477(GSM485235) sRNA_activation_deep_sequencing. (uterus) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | GSM361408(GSM361408) WholeCerebellum_P6_wt_rep1. (brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037910(GSM510447) newborn_rep3. (total RNA) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR059766(GSM562828) DN3_Drosha. (thymus) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................................TTTCAGCCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................cacaCCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 20 | caca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................CCAGTTCTCAGGCCCG.......................................................................................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................accaTCCCCAGTTCTCAGGC............................................................................................................. | 20 | acca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................actaCTCTTTCAGCCCAAC.......................................................................................................................................... | 19 | acta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................gaaCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 18 | gaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ataGCCTCCTCTTCCCCC..................................... | 18 | ata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ................................................................AGTTCTCAGGCCCGCTGTGGTGT................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................gcaCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 18 | gca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................taaaCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 19 | taaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................aactCCTCCTCTTCCCCCT.................................... | 19 | aact | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................ggcGCCCCAGCTTCCCCA....................................................................................................................... | 18 | ggc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................tggaCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 19 | tgga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............tAGCCCCCCGGTCGGCG.......................................................................................................................................................... | 17 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................GCCCAACTCCTGCCCCAGCTT............................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TCAGGCCCGCTGTGGTGTGAAG............................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................acaCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 18 | aca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................ttgtCCAACTCCTGCCCCA................................................................................................................................ | 19 | ttgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ...................................................................................................................................TGCCTCCTCTTCCCCCT.................................... | 17 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 |