| (2) AGO1.ip | (10) AGO2.ip | (2) AGO3.ip | (8) B-CELL | (29) BRAIN | (4) CELL-LINE | (2) DCR.mut | (1) DGCR8.mut | (8) EMBRYO | (5) ESC | (3) FIBROBLAST | (1) HEART | (2) LIVER | (5) LYMPH | (8) OTHER | (1) OTHER.mut | (1) PIWI.ip | (6) SKIN | (10) SPLEEN | (9) TESTES | (3) THYMUS |
| GCTACTTCACCTAGTTTTGAGCTGTTGATTAAACCTGGGGTTTCATGCATGCTAGCCATATCTGAAGTTCAACACGCCCTCCCCTCTTCCTATACGTCTATGGAGGATTTACCTCCATATACCTTGAGAGATGAGGTAGTAGTTAGAACTTTCATGGAGCAAAAAGCATTTCTCAATTAACATTTGCATGCAGGTGAGGTGGGGACGGCCAT ...................................................((((((((((((..((((..(((((.......((.((((((((.....)))))))).))...)))))..))))..)).))).)))))))............................................................ ..............................................................63.................................................................................................162................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042468(GSM539860) mouse Th1 cells [09-002]. (lymph) | SRR042470(GSM539862) mouse Th17 cells [09-002]. (lymph) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042455(GSM539847) mouse plasma cells [09-002]. (blood) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | SRR042466(GSM539858) mouse CD8+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042465(GSM539857) mouse CD4+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR037907(GSM510443) brain_rep4. (brain) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | SRR042443(GSM539835) mouse pro B cells [09-002]. (b cell) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM261957(GSM261957) oocytesmallRNA-19to24. (oocyte) | SRR059773(GSM562835) CD4_Dicer. (spleen) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR345206(SRX097267) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042483(GSM539875) mouse muscle tissue [09-002]. (muscle) | SRR095855BC7(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR065053(SRR065053) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042444(GSM539836) mouse pre B cells [09-002]. (b cell) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM416732(GSM416732) MEF. (cell line) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgct.............................................................. | 19 | TGCT | 142.00 | 0.50 | 4.00 | 7.00 | 17.50 | 3.50 | 5.00 | 3.50 | 13.50 | 12.50 | 10.00 | 6.00 | 5.00 | 4.50 | 5.00 | 5.50 | 4.50 | 4.50 | - | - | 4.00 | - | 3.00 | - | 3.00 | 3.00 | - | 2.50 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtaca.............................................................. | 19 | TACA | 25.00 | 0.50 | 3.00 | 5.00 | - | 1.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACagtt........................................................... | 22 | AGTT | 17.00 | 0.00 | 3.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................CGCCCTCCCCTCTTCCccgc...................................................................................................................... | 20 | CCGC | 13.00 | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.67 | 0.67 | 1.33 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgc............................................................... | 18 | TGC | 11.50 | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.50 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACagt............................................................ | 21 | AGT | 8.00 | 0.00 | 4.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACag............................................................. | 20 | AG | 7.00 | 0.00 | 1.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................CGCCCTCCCCTCTTCCccg....................................................................................................................... | 19 | CCG | 6.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACaga............................................................ | 21 | AGA | 6.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtac............................................................... | 18 | TAC | 5.00 | 0.50 | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGta................................................................ | 17 | TA | 4.00 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAgtt.............................................................. | 19 | GTT | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtat............................................................... | 18 | TAT | 3.50 | 0.50 | 1.00 | - | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACagat........................................................... | 22 | AGAT | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACagtc........................................................... | 22 | AGTC | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAgct.............................................................. | 19 | GCT | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACaggt........................................................... | 22 | AGGT | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGcgct.............................................................. | 19 | CGCT | 2.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgca.............................................................. | 19 | TGCA | 2.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACaatc........................................................... | 22 | AATC | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................ATTTGCATGCAGGTGAGGT............ | 19 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGttct.............................................................. | 19 | TTCT | 2.00 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACagc............................................................ | 21 | AGC | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAgctg............................................................. | 20 | GCTG | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtata.............................................................. | 19 | TATA | 1.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgat.............................................................. | 19 | TGAT | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................CGCCCTCCCCTCTTCCcc........................................................................................................................ | 18 | CC | 1.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACggtt........................................................... | 22 | GGTT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACaatt........................................................... | 22 | AATT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................CGCCCTCCCCTCTTCCc......................................................................................................................... | 17 | C | 1.00 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAAtagc............................................................ | 21 | TAGC | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................ACGCCCTCCCCTCTTCCccgc...................................................................................................................... | 21 | CCGC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgtc.............................................................. | 19 | TGTC | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtg................................................................ | 17 | TG | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAAtggt............................................................ | 21 | TGGT | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACggt............................................................ | 21 | GGT | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAAaa.............................................................. | 19 | AA | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAcctg............................................................. | 20 | CCTG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGttt............................................................... | 18 | TTT | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACgtt............................................................ | 21 | GTT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGttca.............................................................. | 19 | TTCA | 1.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgcg.............................................................. | 19 | TGCG | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................CACGCCCTCCCCTCTT............................................................................................................................ | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtcca.............................................................. | 19 | TCCA | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtatg.............................................................. | 19 | TATG | 1.00 | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................GTTCAACACGCCCTCgccg............................................................................................................................... | 19 | GCCG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................GCCCTCCCCTCTTCCTccc...................................................................................................................... | 19 | CCC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................CACGCCCTCCCCTCTTCC.......................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACagtg........................................................... | 22 | AGTG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................AGCAAAAAGCATTTCTtaat................................... | 20 | TAAT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACT.............................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAAa............................................................... | 18 | A | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAgtcg............................................................. | 20 | GTCG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACTgt............................................................ | 21 | GT | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGttc............................................................... | 18 | TTC | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAACTg............................................................. | 20 | G | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGAAtaa............................................................. | 20 | TAA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................CGCCCTCCCCTCTTCC.......................................................................................................................... | 16 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtcct.............................................................. | 19 | TCCT | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGttcg.............................................................. | 19 | TTCG | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAG.................................................................. | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGt................................................................. | 16 | T | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGggcg.............................................................. | 19 | GGCG | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGcaga.............................................................. | 19 | CAGA | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgaa.............................................................. | 19 | TGAA | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGga................................................................ | 17 | GA | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgcc.............................................................. | 19 | TGCC | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtaaa.............................................................. | 19 | TAAA | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGggca.............................................................. | 19 | GGCA | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGc................................................................. | 16 | C | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtgta.............................................................. | 19 | TGTA | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGggct.............................................................. | 19 | GGCT | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtact.............................................................. | 19 | TACT | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGtggt.............................................................. | 19 | TGGT | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TGAGGTAGTAGTTAGttta.............................................................. | 19 | TTTA | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................CGCCCTCCCCTCTTCCcagc...................................................................................................................... | 20 | CAGC | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GCTACTTCACCTAGTTTTGAGCTGTTGATTAAACCTGGGGTTTCATGCATGCTAGCCATATCTGAAGTTCAACACGCCCTCCCCTCTTCCTATACGTCTATGGAGGATTTACCTCCATATACCTTGAGAGATGAGGTAGTAGTTAGAACTTTCATGGAGCAAAAAGCATTTCTCAATTAACATTTGCATGCAGGTGAGGTGGGGACGGCCAT ...................................................((((((((((((..((((..(((((.......((.((((((((.....)))))))).))...)))))..))))..)).))).)))))))............................................................ ..............................................................63.................................................................................................162................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042468(GSM539860) mouse Th1 cells [09-002]. (lymph) | SRR042470(GSM539862) mouse Th17 cells [09-002]. (lymph) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | SRR042464(GSM539856) mouse CD4+CD8+ T cells (thymus) [09-002]. (thymus) | SRR042455(GSM539847) mouse plasma cells [09-002]. (blood) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | SRR042466(GSM539858) mouse CD8+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR042473(GSM539865) mouse nTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042465(GSM539857) mouse CD4+ T cells (spleen) [09-002]. (spleen) | SRR037907(GSM510443) brain_rep4. (brain) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (gland) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | SRR042443(GSM539835) mouse pro B cells [09-002]. (b cell) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM261957(GSM261957) oocytesmallRNA-19to24. (oocyte) | SRR059773(GSM562835) CD4_Dicer. (spleen) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR345206(SRX097267) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042483(GSM539875) mouse muscle tissue [09-002]. (muscle) | SRR095855BC7(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (liver) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR065053(SRR065053) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042444(GSM539836) mouse pre B cells [09-002]. (b cell) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | SRR306527(GSM750570) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM416732(GSM416732) MEF. (cell line) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR038740(GSM527275) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042448(GSM539840) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 1 [09-002]. (b cell) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................................taccAGAGATGAGGTAGTAG...................................................................... | 20 | tacc | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................cgccCAACACGCCCTCCCC................................................................................................................................ | 19 | cgcc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................CCTCCCCTCTTCCTATACGTCTAT............................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................CATGCTAGCCATATCTGAAGTTCAACA.......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |