| (1) AGO2.ip | (15) B-CELL | (2) BRAIN | (10) BREAST | (32) CELL-LINE | (4) HELA | (2) LIVER | (1) OTHER | (1) PLACENTA | (1) RRP40.ip | (5) SKIN | (1) TESTES | (1) XRN.ip |
| AATTAACACATGAAGACTGCAGTGATATGCAGGACAATAGCTAGTCCTTGAAAAAACAACATACTTAGTGCATACCCATATAATATTAGGGGTGGTCTGTTGTTGTTTTTCTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTCTTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAA ...................................................((((((((((....(((.((.(((((.((......)).)))))))))).)))))))))).................................................... ..................................................51...........................................................112................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell) | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR191607(GSM715717) 192genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR326282(GSM769512) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, to. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR033718(GSM497063) Multiple Myeloma (U266). (B cell) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR033721(GSM497066) Ly3 cell line (Ly3). (B cell) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR033713(GSM497058) Burkitt Lymphoma (BL115). (B cell) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR015448(SRR015448) cytoplasmic small RNAs. (breast) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR033711(GSM497056) GCB DLBCL (GCB110). (B cell) | DRR001488(DRX001042) Hela short nuclear cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR189787 | SRR326281(GSM769511) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, cy. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR033719(GSM497064) 6hr Activated B cell line (ABC158). (B cell) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR191555(GSM715665) 195genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR191586(GSM715696) 197genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR189782 | SRR033716(GSM497061) Mentle Cell Lymphoma (MCL114). (B cell) | SRR191610(GSM715720) 195genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR033720(GSM497065) EBV activated B cell line (EBV159). (B cell) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR189784 | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191529(GSM715639) 131genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR330907(SRX091745) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | SRR191608(GSM715718) 193genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR139200(SRX050639) FLASHPage purified small RNA (~15-40nt) from . (placenta) | SRR015358(GSM380323) Naïve B Cell (Naive39). (B cell) | SRR189785 | SRR029128(GSM416757) H520. (cell line) | SRR033725(GSM497070) Unmutated CLL (CLLU626). (B cell) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR038858(GSM458541) MEL202. (cell line) | SRR139209(SRX050635) FLASHPage purified small RNA (~15-40nt) from . (testes) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR038854(GSM458537) MM653. (cell line) | SRR033732(GSM497077) bjab cell line (bjab103). (B cell) | DRR001486(DRX001040) Hela long cytoplasmic cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR015365(GSM380330) Memory B cells (MM139). (B cell) | SRR189786 | SRR330894(SRX091732) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR060986(GSM569190) Human memory B cell [09-001]. (cell line) | DRR001485(DRX001039) Hela long total cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR060984(GSM569188) Human plasma cell [09-001]. (cell line) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTtt........................................................ | 18 | TT | 1007.00 | 6.00 | 570.00 | 204.00 | 42.00 | 15.00 | 11.00 | 21.00 | - | - | - | 16.00 | 13.00 | 3.00 | - | 12.00 | 10.00 | 10.00 | 8.00 | 5.00 | 6.00 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 4.00 | - | 3.00 | 5.00 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTt......................................................... | 17 | T | 73.00 | 6.00 | - | - | - | 21.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | 9.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTta........................................................ | 18 | TA | 51.00 | 6.00 | 24.00 | 17.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTtta....................................................... | 19 | TTA | 17.00 | 6.00 | 7.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTtaa....................................................... | 19 | TAA | 17.00 | 6.00 | 11.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTttt....................................................... | 19 | TTT | 9.00 | 6.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTT.......................................................... | 16 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TCTTCCAGGCTGGAGTGCAGcgac.... | 24 | CGAC | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTtg........................................................ | 18 | TG | 4.00 | 6.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTtaaa...................................................... | 20 | TAAA | 4.00 | 6.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTttaa...................................................... | 20 | TTAA | 4.00 | 6.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TGTTGTTGTTTTTCTTTTGttc........................................... | 22 | TTC | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTtc........................................................ | 18 | TC | 3.00 | 6.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTGT........................................................ | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAgcgg | 25 | GCGG | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGTGCAGTGcagg.. | 23 | CAGG | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................AGGGGTGGTCTGTTGTTt......................................................... | 18 | T | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................GTTGTTGTTTTTCTTaggc............................................. | 19 | AGGC | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTa......................................................... | 17 | A | 2.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTaaa....................................................... | 19 | AAA | 2.00 | 6.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGTGCAcggc..... | 20 | CGGC | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AGGCTGGAGTGCAGTGGTGCtggt | 24 | TGGT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................AGACAGGGTCTCGCTCccc........................... | 19 | CCC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................AGGGGTGGTCTGTTGTTtt........................................................ | 19 | TT | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGTGCAGTGacgg.. | 23 | ACGG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TCTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCcgtc.......................... | 27 | CGTC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................AGTGCAGTGGTGCAAcccg | 19 | CCCG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGTGCAGTGcgcc.. | 23 | CGCC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................TGAGACAGGGTCTCGCTCcgcc.......................... | 22 | CGCC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TCTTCCAGGCTGGAGTGCAGggtg.... | 24 | GGTG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................AGGGGTGGTCTGTTGTTta........................................................ | 19 | TA | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTGg........................................................ | 18 | G | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TCTGTTGTTGTTTTTgaac................................................ | 19 | GAAC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ACAGGGTCTCGCTCTaaa.......................... | 18 | AAA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TCTTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGgg. | 27 | GG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTttc....................................................... | 19 | TTC | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................TTGTTTTTCTTTTGAGAgtc........................................ | 20 | GTC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TTGTTGTTTTTCTTTTGAag........................................... | 20 | AG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TGTTGTTTTTCTTTTGAtct.......................................... | 20 | TCT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................TGCAGGACAATAGCTct...................................................................................................................... | 17 | CT | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTaa........................................................ | 18 | AA | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGTGCAGTGGgcgg. | 24 | GCGG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TTTTTCTTTTGAGACAGGGctg................................... | 22 | CTG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTGTTggg.................................................... | 22 | GGG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGTGCAGcgca.... | 21 | CGCA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................TTCCAGGCTGGAGTGCAGTGaac... | 23 | AAC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TGTTGTTGTTTTTCTTTTGtgc........................................... | 22 | TGC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTTct........................................................ | 18 | CT | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................TCTCGCTCTGTCTTCCAGGCTGGAGa............ | 26 | A | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TCTGTTGTTGTTTTTCTTTTcgag........................................... | 24 | CGAG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTctt........................................................ | 18 | CTT | 0.67 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AGGCTGGAGTGCAGTGGTcgg. | 21 | CGG | 0.50 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................CTGTTGTTGTTTTTCTTT................................................ | 18 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AGGCTGGAGTGCAGTGGTGggta | 23 | GGTA | 0.33 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTctg........................................................ | 18 | CTG | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGaaca | 25 | AACA | 0.33 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTgtta....................................................... | 19 | GTTA | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGTcgt........................................................ | 18 | CGT | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GGGGTGGTCTGTTGT........................................................... | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCAGGCTGGAGTGCAGTcgac... | 21 | CGAC | 0.17 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCAGGCTGGAGTGCAGTtaga... | 21 | TAGA | 0.17 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CAGGCTGGAGTGCAGTattt... | 20 | ATTT | 0.14 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - |
| ...........................................................................................................................................CAGGCTGGAGTGCAGTctac... | 20 | CTAC | 0.14 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 |
| AATTAACACATGAAGACTGCAGTGATATGCAGGACAATAGCTAGTCCTTGAAAAAACAACATACTTAGTGCATACCCATATAATATTAGGGGTGGTCTGTTGTTGTTTTTCTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTCTTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAA ...................................................((((((((((....(((.((.(((((.((......)).)))))))))).)))))))))).................................................... ..................................................51...........................................................112................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell) | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR191607(GSM715717) 192genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR326282(GSM769512) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, to. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR033718(GSM497063) Multiple Myeloma (U266). (B cell) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR033721(GSM497066) Ly3 cell line (Ly3). (B cell) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR033713(GSM497058) Burkitt Lymphoma (BL115). (B cell) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR015448(SRR015448) cytoplasmic small RNAs. (breast) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR033711(GSM497056) GCB DLBCL (GCB110). (B cell) | DRR001488(DRX001042) Hela short nuclear cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR189787 | SRR326281(GSM769511) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, cy. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR033719(GSM497064) 6hr Activated B cell line (ABC158). (B cell) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR191555(GSM715665) 195genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR191586(GSM715696) 197genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR189782 | SRR033716(GSM497061) Mentle Cell Lymphoma (MCL114). (B cell) | SRR191610(GSM715720) 195genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR033720(GSM497065) EBV activated B cell line (EBV159). (B cell) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR189784 | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191529(GSM715639) 131genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR330907(SRX091745) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | SRR191608(GSM715718) 193genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR139200(SRX050639) FLASHPage purified small RNA (~15-40nt) from . (placenta) | SRR015358(GSM380323) Naïve B Cell (Naive39). (B cell) | SRR189785 | SRR029128(GSM416757) H520. (cell line) | SRR033725(GSM497070) Unmutated CLL (CLLU626). (B cell) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR038858(GSM458541) MEL202. (cell line) | SRR139209(SRX050635) FLASHPage purified small RNA (~15-40nt) from . (testes) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR038854(GSM458537) MM653. (cell line) | SRR033732(GSM497077) bjab cell line (bjab103). (B cell) | DRR001486(DRX001040) Hela long cytoplasmic cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR015365(GSM380330) Memory B cells (MM139). (B cell) | SRR189786 | SRR330894(SRX091732) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR060986(GSM569190) Human memory B cell [09-001]. (cell line) | DRR001485(DRX001039) Hela long total cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR060984(GSM569188) Human plasma cell [09-001]. (cell line) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................tccgAAAAACAACATACTT................................................................................................ | 19 | tccg | 21.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................gctcGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAA | 25 | gctc | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................gtccGGCTGGAGTGCAGTGGTGCA. | 24 | gtcc | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................ccgAAAAACAACATACTT................................................................................................ | 18 | ccg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................gtccGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAA | 25 | gtcc | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................tgccGGCTGGAGTGCAGTGGTGCA. | 24 | tgcc | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................tcccTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGT........................... | 26 | tccc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................ccGGGTGGTCTGTTGTTGT........................................................ | 19 | cc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................atggCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCA. | 26 | atgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................gctcGGCTGGAGTGCAGTGGTGCA. | 24 | gctc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................agcaGCAGGACAATAGCTA....................................................................................................................... | 19 | agca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................tgtgGGCTGGAGTGCAGTGGTGC.. | 23 | tgtg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................cggGACAGGGTCTCGCTCTGT........................... | 21 | cgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................gatcGGCTGGAGTGCAGTGGTGCA. | 24 | gatc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................ctatAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCA. | 25 | ctat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................CAGGGTCTCGCTCTGTCTTCCAGGCT................. | 26 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |