| (1) AGO1.ip | (1) AGO1.ip OTHER.mut | (3) BRAIN | (6) BREAST | (24) CELL-LINE | (4) CERVIX | (1) FIBROBLAST | (5) HEART | (3) HELA | (2) LIVER | (1) OTHER | (1) RRP40.ip | (2) SKIN | (1) XRN.ip |
| ACAGAACAGGCATTGCCCTAAGTATTTGGGGGTATGAAAGAAGCTGATGTGGATGTGTTCCTGTCCCAGAAGGAGCTGATGGTTGTATCTATGAAGGTAAGCATTTTTGTAGATACGAGCACCAGCCACCCTAAGCAAAGGCAGAGAATGCTTAGGCCAGACAGAGGGCTAGGGCACTTGAATAGAAAGAGAGCAATTCTTGGG .....................................................(((.((((.((.(((((((((..(((((....)))))..))))))))).)).))))...))).................................................... ...................................................................68................................................................134.................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR207114(GSM721076) IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown. (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR314796(SRX084354) Total RNA, fractionated (15-30nt). (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | DRR001488(DRX001042) Hela short nuclear cell fraction, LNA(+). (hela) | DRR001489(DRX001043) Hela short nuclear cell fraction, control. (hela) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR038855(GSM458538) D10. (cell line) | SRR038854(GSM458537) MM653. (cell line) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | DRR001486(DRX001040) Hela long cytoplasmic cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR038857(GSM458540) D20. (cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR139168(SRX050648) FLASHPage purified small RNA (~15-40nt) from . (brain) | SRR040018(GSM532903) G701N. (cervix) | SRR107297(GSM677704) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR039614(GSM531977) HBV-infected Liver Tissue. (liver) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR040023(GSM532908) G575T. (cervix) | SRR363675(GSM830252) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040039(GSM532924) G531T. (cervix) | SRR015447(SRR015447) nuclear small RNAs. (breast) | SRR040022(GSM532907) G575N. (cervix) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line) | SRR189786 | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR038862(GSM458545) MM472. (cell line) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR326281(GSM769511) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, cy. (cell line) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACC.......................................................................... | 22 | 1 | 793.00 | 793.00 | 424.00 | 187.00 | 148.00 | 33.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAC........................................................................... | 21 | 1 | 208.00 | 208.00 | 68.00 | 49.00 | 83.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAC........................................................................... | 22 | 1 | 120.00 | 120.00 | 7.00 | 27.00 | 17.00 | 11.00 | 25.00 | 14.00 | - | 1.00 | - | - | 7.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCC......................................................................... | 23 | 1 | 103.00 | 103.00 | 54.00 | 33.00 | 12.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCA............................................................................ | 21 | 1 | 78.00 | 78.00 | 16.00 | - | 5.00 | 9.00 | 18.00 | 18.00 | 1.00 | - | - | - | 3.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACt.......................................................................... | 22 | T | 67.00 | 208.00 | 42.00 | 10.00 | 13.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACa.......................................................................... | 22 | A | 56.00 | 208.00 | 7.00 | 28.00 | 10.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCA............................................................................ | 20 | 1 | 48.00 | 48.00 | 5.00 | 17.00 | 11.00 | 14.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCC............................................................................. | 20 | 1 | 38.00 | 38.00 | 2.00 | 5.00 | - | 10.00 | 4.00 | 1.00 | 6.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGC.............................................................................. | 19 | 1 | 35.00 | 35.00 | 2.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | 1.00 | 7.00 | 14.00 | - | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAt........................................................................... | 22 | T | 32.00 | 78.00 | 6.00 | - | 8.00 | 7.00 | 7.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCa......................................................................... | 23 | A | 28.00 | 793.00 | 2.00 | 7.00 | 10.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACa.......................................................................... | 23 | A | 25.00 | 120.00 | 1.00 | - | 3.00 | 2.00 | 9.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAt........................................................................... | 21 | T | 24.00 | 48.00 | 11.00 | - | 10.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACC.......................................................................... | 23 | 1 | 20.00 | 20.00 | - | 2.00 | 9.00 | 5.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAG............................................................................... | 18 | 1 | 19.00 | 19.00 | - | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 8.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAa........................................................................... | 22 | A | 18.00 | 78.00 | - | 3.00 | 4.00 | - | 5.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACt.......................................................................... | 23 | T | 16.00 | 120.00 | 2.00 | - | 3.00 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGC.............................................................................. | 18 | 1 | 14.00 | 14.00 | 1.00 | 2.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCat........................................................................ | 24 | AT | 13.00 | 793.00 | 1.00 | 11.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCt......................................................................... | 23 | T | 13.00 | 793.00 | 10.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACaa......................................................................... | 23 | AA | 11.00 | 208.00 | - | 10.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCatc....................................................................... | 25 | ATC | 10.00 | 793.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACatc........................................................................ | 25 | ATC | 10.00 | 120.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACaga........................................................................ | 24 | AGA | 8.00 | 208.00 | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAag.......................................................................... | 22 | AG | 8.00 | 48.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAtt.......................................................................... | 23 | TT | 8.00 | 78.00 | 1.00 | - | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCaa........................................................................ | 24 | AA | 8.00 | 793.00 | 5.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCg......................................................................... | 23 | G | 8.00 | 793.00 | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACaa......................................................................... | 24 | AA | 7.00 | 120.00 | - | - | - | - | 4.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCCT........................................................................ | 24 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | 1.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCA................................................................................ | 17 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCCTt....................................................................... | 25 | T | 6.00 | 7.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACta......................................................................... | 23 | TA | 6.00 | 208.00 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAtt.......................................................................... | 22 | TT | 6.00 | 48.00 | - | - | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACaat........................................................................ | 24 | AAT | 6.00 | 208.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAta.......................................................................... | 23 | TA | 6.00 | 78.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACat......................................................................... | 24 | AT | 5.00 | 120.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAat.......................................................................... | 23 | AT | 5.00 | 78.00 | - | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCC............................................................................. | 19 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAaa.......................................................................... | 23 | AA | 4.00 | 78.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAga.......................................................................... | 22 | GA | 4.00 | 48.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACCt......................................................................... | 24 | T | 4.00 | 20.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAtat......................................................................... | 23 | TAT | 4.00 | 48.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACatc........................................................................ | 24 | ATC | 3.00 | 208.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACttt........................................................................ | 24 | TTT | 3.00 | 208.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAag.......................................................................... | 23 | AG | 3.00 | 78.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TAGATACGAGCACCAGCCACC.......................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCaacc.......................................................................... | 22 | AACC | 3.00 | 14.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAaa.......................................................................... | 22 | AA | 3.00 | 48.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCatt........................................................................... | 21 | ATT | 2.00 | 14.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACg.......................................................................... | 22 | G | 2.00 | 208.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAac.......................................................................... | 22 | AC | 2.00 | 48.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCg............................................................................ | 20 | G | 2.00 | 5.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCgcc.......................................................................... | 22 | GCC | 2.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACgatc....................................................................... | 25 | GATC | 2.00 | 208.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCtacc.......................................................................... | 22 | TACC | 2.00 | 14.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACat......................................................................... | 23 | AT | 2.00 | 208.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCt............................................................................ | 21 | T | 2.00 | 38.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAgc.......................................................................... | 22 | GC | 2.00 | 48.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAtaa......................................................................... | 24 | TAA | 1.00 | 78.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAaaa......................................................................... | 24 | AAA | 1.00 | 78.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAgat......................................................................... | 23 | GAT | 1.00 | 48.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................GTGTTCCTGTCCCAGAgaag.................................................................................................................................. | 20 | GAAG | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACCCT........................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACtaa........................................................................ | 24 | TAA | 1.00 | 208.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAaca......................................................................... | 23 | ACA | 1.00 | 48.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGtcac........................................................................... | 22 | TCAC | 1.00 | 19.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAa........................................................................... | 21 | A | 1.00 | 48.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCtt........................................................................... | 22 | TT | 1.00 | 38.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGacac........................................................................... | 22 | ACAC | 1.00 | 19.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCcc........................................................................... | 21 | CC | 1.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAG............................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TTTTGTAGATACGAGCACCAGCaa............................................................................ | 24 | AA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACaaa........................................................................ | 24 | AAA | 1.00 | 208.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACtg......................................................................... | 23 | TG | 1.00 | 208.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGacac........................................................................... | 21 | ACAC | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAtc.......................................................................... | 22 | TC | 1.00 | 48.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................CAAAGGCAGAGAATGtaa................................................... | 18 | TAA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCc............................................................................ | 21 | C | 1.00 | 38.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TAGATACGAGCACCAGCCACCC......................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACCaat....................................................................... | 25 | AAT | 1.00 | 793.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACCtc........................................................................ | 25 | TC | 1.00 | 20.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACtc......................................................................... | 23 | TC | 1.00 | 208.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCtccc.......................................................................... | 22 | TCCC | 1.00 | 14.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACCCatc...................................................................... | 27 | ATC | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAaga......................................................................... | 23 | AGA | 1.00 | 48.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................AAGCTGATGTGGATGggga................................................................................................................................................. | 19 | GGGA | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCACtt......................................................................... | 23 | TT | 1.00 | 208.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGaaat........................................................................... | 21 | AAAT | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACag......................................................................... | 24 | AG | 1.00 | 120.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................GAGCTGATGGTTGTATCTATGA.............................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAg........................................................................... | 22 | G | 1.00 | 78.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCaat........................................................................... | 21 | AAT | 1.00 | 14.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCc............................................................................ | 20 | C | 1.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCatc........................................................................... | 21 | ATC | 1.00 | 14.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................AAGGAGCTGATGGTTGTATCTATG............................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCt............................................................................ | 20 | T | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCCAacc......................................................................... | 23 | ACC | 1.00 | 48.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................AGGTAAGCATTTTTGgatc........................................................................................... | 19 | GATC | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGCtac........................................................................... | 21 | TAC | 1.00 | 14.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTAGATACGAGCACCAGtcac........................................................................... | 21 | TCAC | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAac.......................................................................... | 23 | AC | 1.00 | 78.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACg.......................................................................... | 23 | G | 1.00 | 120.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACaaa........................................................................ | 25 | AAA | 1.00 | 120.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAga.......................................................................... | 23 | GA | 1.00 | 78.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCttt.......................................................................... | 23 | TTT | 1.00 | 38.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCAaat......................................................................... | 24 | AAT | 1.00 | 78.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................AAGGAGCTGATGGTTGTATCTA................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TGTAGATACGAGCACCAGCCACCC......................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................TTTTTGTAGATACGAGCA................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| ...............................GTATGAAAGAAGCTGA............................................................................................................................................................. | 16 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - |
| .................................................................CCAGAAGGAGCTGATG........................................................................................................................... | 16 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 |
| ACAGAACAGGCATTGCCCTAAGTATTTGGGGGTATGAAAGAAGCTGATGTGGATGTGTTCCTGTCCCAGAAGGAGCTGATGGTTGTATCTATGAAGGTAAGCATTTTTGTAGATACGAGCACCAGCCACCCTAAGCAAAGGCAGAGAATGCTTAGGCCAGACAGAGGGCTAGGGCACTTGAATAGAAAGAGAGCAATTCTTGGG .....................................................(((.((((.((.(((((((((..(((((....)))))..))))))))).)).))))...))).................................................... ...................................................................68................................................................134.................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR207114(GSM721076) IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown. (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR314796(SRX084354) Total RNA, fractionated (15-30nt). (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | DRR001488(DRX001042) Hela short nuclear cell fraction, LNA(+). (hela) | DRR001489(DRX001043) Hela short nuclear cell fraction, control. (hela) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR038855(GSM458538) D10. (cell line) | SRR038854(GSM458537) MM653. (cell line) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | DRR001486(DRX001040) Hela long cytoplasmic cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR038857(GSM458540) D20. (cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR139168(SRX050648) FLASHPage purified small RNA (~15-40nt) from . (brain) | SRR040018(GSM532903) G701N. (cervix) | SRR107297(GSM677704) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR039614(GSM531977) HBV-infected Liver Tissue. (liver) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR040023(GSM532908) G575T. (cervix) | SRR363675(GSM830252) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040039(GSM532924) G531T. (cervix) | SRR015447(SRR015447) nuclear small RNAs. (breast) | SRR040022(GSM532907) G575N. (cervix) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line) | SRR189786 | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR038862(GSM458545) MM472. (cell line) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR326281(GSM769511) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, cy. (cell line) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................cacAAGGTAAGCATTTTT................................................................................................ | 18 | cac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| cccaAACAGGCATTGCCCTA........................................................................................................................................................................................ | 20 | ccca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................cagtGGGCTAGGGCACTTGA....................... | 20 | cagt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |