| (1) AGO1.ip | (2) AGO2.ip | (3) B-CELL | (2) BRAIN | (10) BREAST | (30) CELL-LINE | (9) CERVIX | (1) FIBROBLAST | (2) HEART | (3) HELA | (1) LIVER | (1) OTHER | (1) RRP40.ip | (22) SKIN |
| GGATCCCGGCGGCCGCGTGCAGGGCACCCGCTGGCGCCACGGCCAGGACAGTGAGTGCGGGGCGGCGGGGGCCTGGGGTGGGGAGGCGGCGGGTGACGGCAACGCGGCCGCCGTCTTCACGGTGACCTGCGCCCGCGGGGGAGTCCCGGAGGCTCCTCTGTGCAGCCTCGGCCTCAGTTTCCGTGGTCTGTGAGATGGGTGCAGCCTGCCTGGTGGGAGGGTTGCACTGTTAAAGCGAAGGCTGCAGCGG .................................................................................(((((((((((.((.((....)))).))))))))))).......(((((....)))))((((((.....)))))).............................................................................................. ................................................................................81.........................................................................156............................................................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR095854(SRX039177) "miRNA were isolated from FirstChoice Human B. (brain) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | GSM532876(GSM532876) G547T. (cervix) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR444062(SRX128910) Sample 27_3cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR343335 | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | GSM956925Ago2PAZ(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR444055(SRX128903) Sample 27_2cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR189782 | SRR343334 | SRR330867(SRX091705) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR191574(GSM715684) 78genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189784 | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | GSM532877(GSM532877) G691N. (cervix) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | TAX577588(Rovira) total RNA. (breast) | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR040037(GSM532922) G243T. (cervix) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR343332(GSM796035) "KSHV (HHV8), EBV (HHV-4)". (cell line) | SRR040028(GSM532913) G026N. (cervix) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR040016(GSM532901) G645N. (cervix) | SRR330890(SRX091728) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR191492(GSM715602) 154genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR033710(GSM497055) GCB DLBCL (GCB385). (B cell) | SRR040009(GSM532894) G727T. (cervix) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040023(GSM532908) G575T. (cervix) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM956925PazD5(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (cell line) | SRR039617(GSM531980) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 1. (liver) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR191627(GSM715737) 45genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR191456(GSM715566) 182genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR029132(GSM416761) MB-MDA231. (cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330869(SRX091707) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330893(SRX091731) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM532886(GSM532886) G850T. (cervix) | SRR363674(GSM830251) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR037933(GSM510471) 293cand4_rep2. (cell line) | SRR553574(SRX182780) source: Heart. (Heart) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR330892(SRX091730) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR444046(SRX128894) Sample 7cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR444069(SRX128917) Sample 26cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC . (skin) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330895(SRX091733) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ....................................................................................................................................CCGCGGGGGAGTCCCGTCGG.................................................................................................. | 20 | 20.00 | 0.00 | 8.00 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................GCCCGCGGGGGAGTCCCGTCGG.................................................................................................. | 22 | 1 | 18.00 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGTCG................................................................................................... | 20 | 1 | 14.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGTC.................................................................................................... | 19 | 1 | 5.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................GCCCGCGGGGGAGTCCCGTCG................................................................................................... | 21 | 1 | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TGGGGAGGCGGCGGGA............................................................................................................................................................ | 16 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCG...................................................................................................... | 17 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................GCCCGCGGGGGAGTCCCGT..................................................................................................... | 19 | 1 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................CGCGGGGGAGTCCCGTCGG.................................................................................................. | 19 | 2 | 2.50 | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGT..................................................................................................... | 18 | 1 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................GCCCGCGGGGGAGTCCCGTC.................................................................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................CGCCCGCGGGGGAGTCCCGTCG................................................................................................... | 22 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................CGCGGGGGAGTCCCGTCG................................................................................................... | 18 | 2 | 1.50 | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................CCGCGGGGGAGTCCCGTCGA.................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................GCGGCGGGTGACGGCCCA................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................CTGTTAAAGCGAAGGCTGC..... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................GCGGCGGGGGCCTGGGCCGC......................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................CGGCGGGGGCCTGGGGGT.......................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................CGTGGTCTGTGAGATGGGTGC................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................GCGGGGCGGCGGGGGG.................................................................................................................................................................................. | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................TGGGGAGGCGGCGGGTT........................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................................................................GAGGGTTGCACTGTTAAAGC.............. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................GCGGGGCGGCGGGGGC.................................................................................................................................................................................. | 16 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGTCGC.................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................GAGTCCCGGAGGCTCCACCA.......................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................CGCCCGCGGGGGAGTCCC....................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................GGCAACGCGGCCGCCGACC...................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................GGGGGCCTGGGGTGGGGAGGCTT................................................................................................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGTCGA.................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................CTGTTAAAGCGAAGGCA....... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................GCCCGCGGGGGAGTC......................................................................................................... | 15 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGCCGG.................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................GGGGAGGCGGCGGGTTGGA........................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................CGGGGGCCTGGGGTGGATCG..................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................GCGGGGCGGCGGGGGTA................................................................................................................................................................................. | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGTGGTCTGTGAGATGGGTGCAGCC............................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................CCGCGGGGGAGTCCCGTCG................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................GGCGGCGGGGGCCTGGGA............................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................CTGTTAAAGCGAAGGCAAA..... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................TGGGGAGGCGGCGGGTTG.......................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................GCCCGCGGGGGAGTCCCG...................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........GCGGCCGCGTGCAGGG.................................................................................................................................................................................................................................. | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................CGCGGGGGAGTCCCGTA.................................................................................................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................GCCCGCGGGGGAGTCC........................................................................................................ | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................GTTTCCGTGGTCTGT........................................................... | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................CGCGGGGGAGTCCCG...................................................................................................... | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................CGCGGGGGAGTCCCGT..................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCC........................................................................................................ | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCT....................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGGTCTGTGAGATGGG................................................... | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................GGCGGCGGGGGCCTGGACCG.......................................................................................................................................................................... | 20 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................GGCGGCGGGGGCCTGG.............................................................................................................................................................................. | 16 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GGATCCCGGCGGCCGCGTGCAGGGCACCCGCTGGCGCCACGGCCAGGACAGTGAGTGCGGGGCGGCGGGGGCCTGGGGTGGGGAGGCGGCGGGTGACGGCAACGCGGCCGCCGTCTTCACGGTGACCTGCGCCCGCGGGGGAGTCCCGGAGGCTCCTCTGTGCAGCCTCGGCCTCAGTTTCCGTGGTCTGTGAGATGGGTGCAGCCTGCCTGGTGGGAGGGTTGCACTGTTAAAGCGAAGGCTGCAGCGG .................................................................................(((((((((((.((.((....)))).))))))))))).......(((((....)))))((((((.....)))))).............................................................................................. ................................................................................81.........................................................................156............................................................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR095854(SRX039177) "miRNA were isolated from FirstChoice Human B. (brain) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | GSM532876(GSM532876) G547T. (cervix) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR444062(SRX128910) Sample 27_3cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR343335 | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | GSM956925Ago2PAZ(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR444055(SRX128903) Sample 27_2cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR189782 | SRR343334 | SRR330867(SRX091705) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR191574(GSM715684) 78genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189784 | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | GSM532877(GSM532877) G691N. (cervix) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | TAX577588(Rovira) total RNA. (breast) | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR040037(GSM532922) G243T. (cervix) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR343332(GSM796035) "KSHV (HHV8), EBV (HHV-4)". (cell line) | SRR040028(GSM532913) G026N. (cervix) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR040016(GSM532901) G645N. (cervix) | SRR330890(SRX091728) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR191492(GSM715602) 154genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR033710(GSM497055) GCB DLBCL (GCB385). (B cell) | SRR040009(GSM532894) G727T. (cervix) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040023(GSM532908) G575T. (cervix) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM956925PazD5(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (cell line) | SRR039617(GSM531980) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 1. (liver) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR191627(GSM715737) 45genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR191456(GSM715566) 182genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR029132(GSM416761) MB-MDA231. (cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330869(SRX091707) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330893(SRX091731) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM532886(GSM532886) G850T. (cervix) | SRR363674(GSM830251) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR037933(GSM510471) 293cand4_rep2. (cell line) | SRR553574(SRX182780) source: Heart. (Heart) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR330892(SRX091730) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR444046(SRX128894) Sample 7cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR444069(SRX128917) Sample 26cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC . (skin) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330895(SRX091733) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGGCG................................................................................................... | 20 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................CGGAAACTGAGGCCGAGGCTGCA................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......GGCGGCCGCGTGCAGGGCCGC.............................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................CCCGCGGGGGAGTCCCGG..................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................GACCACGGAAACTGAGGCCGAGGCTGCACAGAGG.............................................................. | 34 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................GGGCACCCGCTGGCGCCCCG................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................GCGCCCGCGGGGGAGGCGC....................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................GGGGCGGCGGGGGCCTCCC............................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................AGGCCCCCGCCGCCCCG................................................................................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................GGGGCGGCGGGGGCCTCC.............................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................GGGACTCCCCCGCGG....................................................................................................... | 15 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................GGGGCGGCGGGGGCCTCCCG............................................................................................................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................CCACGGAAACTGAGGCCGAGGC................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................CCGCCGTCTTCACGGTAG............................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................ACGGAAACTGAGGCCGAGGCTG.................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |