| (2) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (1) B-CELL | (1) BRAIN | (8) BREAST | (36) CELL-LINE | (3) CERVIX | (5) HEART | (2) HELA | (1) KIDNEY | (4) LIVER | (2) OTHER | (26) SKIN | (1) XRN.ip |
| AGACCCACGACCGCCTCTGCTTTGTCATGGAGTACGCCAACGGGGGCGAGGTAGGGGCTGGGGCTGCGGGGGATGGACTTCGCGGCCTGTGGGCCGCCCATGGTGGGGCCGGTCCTTCCCGGAGCCTCGGCTACTCTCCATGGCACCAGACGGTGCTCCCTGCTGGGTGGGTGGTGTGATGCCTGCCCAGGCAGCTGCCTGCTGTGGGGTGACTTGTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCTGAGACTTTCCAGGCCCCCGTGCCCTCTGGTGGCTGGTCCCTTCCCTGTGCAATGCCGAGACCCGGTCTGAGAAACCCCAGCCCTGCAGGCCATGGGGGCAGAGGCCCGAGCCACGGCTGTGCCTCAGGTTGCGCCTCCCGCAGCTGTTCTTCCACCTGTCCCGGGAGCGTGTGTTCTCCGAGGACCGGGCCCG ..........................................................................................................................................................................(((((......(((((.(((((....)))))..))))).((((((((....)).))))))((((((((............(((((((((.(((.(((.((((((....(((......((..((((.....)))).)).)))...))))))))).))).)))))))))))))))))..)))))............................................................................... ........................................................................................................................................................................169.....................................................................................................................................................................................353............................................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR343337 | SRR326281(GSM769511) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, c. (cell line) | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR033713(GSM497058) Burkitt Lymphoma (BL115). (B cell) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR343336 | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR037932(GSM510470) 293cand4_rep1. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR189786 | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330893(SRX091731) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM359208(GSM359208) hepg2_bindASP_hl_2. (cell line) | SRR330865(SRX091703) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR189784 | SRR207117(GSM721079) Whole cell RNA. (cell line) | SRR330900(SRX091738) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000562(DRX000320) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago3 cell line) | SRR330888(SRX091726) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330906(SRX091744) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR189787 | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330910(SRX091748) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330864(SRX091702) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM532874(GSM532874) G699T. (cervix) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR040036(GSM532921) G243N. (cervix) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR189785 | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | GSM359193(GSM359193) HepG2_3pM_7. (cell line) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR039635(GSM518472) THP1_nuc_sRNAs. (cell line) | SRR015448(SRR015448) cytoplasmic small RNAs. (breast) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | GSM359195(GSM359195) HepG2_TAP_depl. (cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330866(SRX091704) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330895(SRX091733) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330891(SRX091729) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR343335 | SRR330880(SRX091718) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................................................................................................................................................................GTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCTGAGA............................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 52.00 | 52.00 | 8.00 | 5.00 | 9.00 | 5.00 | - | - | 6.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................TGTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCTGAGA............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 40.00 | 40.00 | 6.00 | 9.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGGGGCAGAGGCCCGAGA.................................................................................. | 20 | 12.00 | 0.00 | - | - | - | - | 7.00 | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................GTGTGATGCCTGCCCGGT................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 7.00 | 0.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................GGCCGGTCCTTCCCGCCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 5.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................GTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCT................................................................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................GCTGAGTTAGGGCTTCTGA............................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................CGGTCCTTCCCGGAGTCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................GTGTGATGCCTGCCCGGTG............................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................GTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCTTAGA............................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................GTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCTGAG.............................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................GTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCTG................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................TGTTCCTGCTGAGTTAGGGCTT................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGCTTTGTCATGGAGTACGCCAACGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................GGCCGGTCCTTCCCGCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGCCCGAGCCACGGCTG.......................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCGAGGACCGGGCCCGCC | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTGTTCTCCGAGGACCG...... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................GTGATGCCTGCCCAGTGAC............................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTGTTCTCCGAGGACCGGGCCCGCG | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................AGTACGCCAACGGGGGCGAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................GGTGTGATGCCTGCCCGGG................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......ACGACCGCCTCTGCT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTGTTCTCCGAGGACCG...... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGTCTGAGAAACCCCAGCCCTGCAGGC....................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGTGTGTTCTCCGAGG.......... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCACCTGTCCCGGCCAC......................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................GTGGGGTGACTTGTTCCTGCT............................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGCAATGCCGAGACCCG................................................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTGTTCTCCGAGGA......... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGTTCTCCGAGGACCGGGCCCG | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTCTCCGAGGACCGGGCC.. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGGGGGCAGAGGCCCGAGCCAAAAT............................................................................ | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCACCTGTCCCGGGAA.......................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGGGGGCAGAGGCCCGAGCCTAAC............................................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................TTTGTCATGGAGTACGCCAACGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTGTCCCGGGAGCGTGTGTTCTCCGAG........... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................GGGGATGGACTTCGCGGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTTCTCCGAGGACCGGGC... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCTTCCACCTGTCTT............................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................GGTGTGATGCCTGCCCGGT................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........CGCCTCTGCTTTGTCATGGAGTACGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCAGGTTGCGCCTCCCGCAG.................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGGGGCAGAGGCCCGAGC.................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .GACCCACGACCGCCTCTGCTTTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGGGGGCAGAGGCCCGAGA.................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................GATGGACTTCGCGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCAGGTTGCGCCTCCCGCA................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATGGGGGCAGAGTGC....................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................CTCTCCATGGCACCAGACGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................CCTGCTGGGTGGGTGTAGG.............................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATGGGGGCAGAGGCCCGAGCCT................................................................................ | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................GGGCCGGTCCTTCCC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................CTTGTTCCTGCTGAGTTA......................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTTCCACCTGTCCCGG............................. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTTCTCCGAGGAC........ | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTTCCACCTGTCCCGGGAGCG........................ | 23 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................CCCGGAGCCTCGGCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - |
| .....................TTGTCATGGAGTACG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................TTGTCATGGAGTACGTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGAGCGTGTGTTCG................ | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGAGCGTGTGTTC................. | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGAGCGTGTGTTCGA............... | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCGAGGACCGGGC... | 15 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - |
| .....................................................GGGGCTGGGGCTGCGGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................AGGTAGGGGCTGGGGCT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 |
| AGACCCACGACCGCCTCTGCTTTGTCATGGAGTACGCCAACGGGGGCGAGGTAGGGGCTGGGGCTGCGGGGGATGGACTTCGCGGCCTGTGGGCCGCCCATGGTGGGGCCGGTCCTTCCCGGAGCCTCGGCTACTCTCCATGGCACCAGACGGTGCTCCCTGCTGGGTGGGTGGTGTGATGCCTGCCCAGGCAGCTGCCTGCTGTGGGGTGACTTGTTCCTGCTGAGTTAGGGCTTCTGAGACTTTCCAGGCCCCCGTGCCCTCTGGTGGCTGGTCCCTTCCCTGTGCAATGCCGAGACCCGGTCTGAGAAACCCCAGCCCTGCAGGCCATGGGGGCAGAGGCCCGAGCCACGGCTGTGCCTCAGGTTGCGCCTCCCGCAGCTGTTCTTCCACCTGTCCCGGGAGCGTGTGTTCTCCGAGGACCGGGCCCG ..........................................................................................................................................................................(((((......(((((.(((((....)))))..))))).((((((((....)).))))))((((((((............(((((((((.(((.(((.((((((....(((......((..((((.....)))).)).)))...))))))))).))).)))))))))))))))))..)))))............................................................................... ........................................................................................................................................................................169.....................................................................................................................................................................................353............................................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR343337 | SRR326281(GSM769511) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, c. (cell line) | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR033713(GSM497058) Burkitt Lymphoma (BL115). (B cell) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR343336 | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR037932(GSM510470) 293cand4_rep1. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR189786 | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330893(SRX091731) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM359208(GSM359208) hepg2_bindASP_hl_2. (cell line) | SRR330865(SRX091703) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR189784 | SRR207117(GSM721079) Whole cell RNA. (cell line) | SRR330900(SRX091738) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000562(DRX000320) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago3 cell line) | SRR330888(SRX091726) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330906(SRX091744) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR189787 | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330910(SRX091748) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330864(SRX091702) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM532874(GSM532874) G699T. (cervix) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR040036(GSM532921) G243N. (cervix) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR189785 | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | GSM359193(GSM359193) HepG2_3pM_7. (cell line) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR039635(GSM518472) THP1_nuc_sRNAs. (cell line) | SRR015448(SRR015448) cytoplasmic small RNAs. (breast) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | GSM359195(GSM359195) HepG2_TAP_depl. (cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330866(SRX091704) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330895(SRX091733) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330891(SRX091729) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR343335 | SRR330880(SRX091718) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................TGGGGCTGCGGGGGACCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTTTCTCAGACCGGGTCTCGGCATT..................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................GCTGCCTGCTGTGGGGAGGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................ACAGCAGGCAGCTGCCTGGGCAGGCATC.................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................TGTTCCTGCTGAGTTAG........................................................................................................................................................................................................ | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCCTTCCCTGTGCTTTT........................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCGAGACCCGGTCTCTG.......................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................GCTGGGGCTGCGGGGGAAAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCTGTGCAATGCAAGA...................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................AGGGGCTGGGGCTGCGGGGGACT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTCCCGCAGCTGTTCC........................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................GCCCCCGTGCCCTCTGAC................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........CCATGACAAAGCAGAGGCGGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCCTGTGCAATGCAAA....................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................GCCCCCGTGCCCTCTGGCG.................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................CAGCCCCAGCCCCTACCTCGCCCCCGTTGGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................ACTCAGCAGGAACAAG........................................................................................................................................................................................................... | 16 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................CCCCGCAGCCCCAGCCC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - |