| (2) AGO1.ip | (4) AGO2.ip | (1) B-CELL | (1) BRAIN | (3) BREAST | (21) CELL-LINE | (1) CERVIX | (2) HEART | (2) HELA | (2) LIVER | (2) OTHER | (4) SKIN | (1) TESTES | (1) UTERUS |
| CAACCTCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGCATTTTTGTTAGAGATGGGATTTTGCCATGTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGGCCTCAAGTGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCTGGCCTACATTGAAGTTTTTAATCCATATTTTG ..................................................((((((((......(((....)))......)))))))).((((.(((....))).))))..((((((..(((.((.....))))).))))))............................................................................................................ ..................................................51...............................................................................................148.................................................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189786 | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | GSM1105748AGO1(GSM1105748) small RNA sequencing data. (ago1 hela) | SRR189787 | SRR390723(GSM850202) total small RNA. (cell line) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | GSM956925Ago2PAZ(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | SRR189784 | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | GSM1105753INPUT(GSM1105753) small RNA sequencing data. (hela) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | DRR000561(DRX000319) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago2 cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR040009(GSM532894) G727T. (cervix) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR191600(GSM715710) 90genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes) | GSM956925Ago2(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | GSM956925Paz8D5(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (cell line) | SRR330876(SRX091714) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR191479(GSM715589) 31genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) |
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| CAACCTCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGCATTTTTGTTAGAGATGGGATTTTGCCATGTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGGCCTCAAGTGATCCACGTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCTGGCCTACATTGAAGTTTTTAATCCATATTTTG ..................................................((((((((......(((....)))......)))))))).((((.(((....))).))))..((((((..(((.((.....))))).))))))............................................................................................................ ..................................................51...............................................................................................148.................................................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189786 | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | GSM1105748AGO1(GSM1105748) small RNA sequencing data. (ago1 hela) | SRR189787 | SRR390723(GSM850202) total small RNA. (cell line) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | GSM956925Ago2PAZ(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | SRR189784 | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | GSM1105753INPUT(GSM1105753) small RNA sequencing data. (hela) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | DRR000561(DRX000319) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago2 cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR040009(GSM532894) G727T. (cervix) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR191600(GSM715710) 90genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes) | GSM956925Ago2(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | GSM956925Paz8D5(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (cell line) | SRR330876(SRX091714) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR191479(GSM715589) 31genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) |
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| .............................CTCATGCCTCAGCCTTCAT.......................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .......................................................................................................................................TGGTCTCGAACTGCTGGCCTCACCC.......................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................CCACCACACCCAGCTAATTTTTGCATTTT..................................................................................................................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ............................................................................................................................GTTGATCAGGCTGGTCTCGAGGTG...................................................................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................CGTGCCTCAGCCTCCCACATC............................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................TGATTCTCATGCCTCAGCCTCTATCG........................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |