| (2) AGO1.ip | (2) AGO2.ip | (2) B-CELL | (5) BRAIN | (1) BREAST | (14) CELL-LINE | (3) CERVIX | (1) FIBROBLAST | (1) HEART | (2) HELA | (3) LIVER | (3) OTHER | (3) SKIN | (1) XRN.ip |
| AGCCAGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGACCCTGCCATTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACGAACAAACAGAAACAACGGTTAACACATGTTCTTTTTCAATAGGGTGATTCTGAAGAGGGTCTGGAGGAGCCTTCTCAAGAACAGAGGTAAGG ..................................................(((((.....)))))((.(((((((....((((...((((((.((.........)))))))).))))..)))))))..))........................................................................................................................ ..................................................51..............................................................................131..................................................................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR207119(GSM721081) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | GSM1105748AGO1(GSM1105748) small RNA sequencing data. (ago1 hela) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR039614(GSM531977) HBV-infected Liver Tissue. (liver) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | GSM956925PAZD5 | SRR189782 | SRR040023(GSM532908) G575T. (cervix) | SRR060982(GSM569186) Human centrocyte [09-001]. (cell line) | SRR033726(GSM497071) Mututated CLL (CLLM633). (B cell) | SRR363675(GSM830252) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR095854(SRX039177) "miRNA were isolated from FirstChoice Human B. (brain) | SRR040039(GSM532924) G531T. (cervix) | DRR000559(DRX000317) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | DRR001483(DRX001037) "Hela long cytoplasmic cell fraction, control. (hela) | SRR189786 | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR040035(GSM532920) G001T. (cervix) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................TTGTACTCCAGCCTGTGCC........................................................................................................................... | 19 | 20.00 | 0.00 | - | - | 20.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................CGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGACCCCAA................................................................................................................................................ | 28 | 3.00 | 0.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..........................AGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGCCGG............................................................................................................................................................................................... | 33 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................TACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTGCCC.......................................................................................................... | 33 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ............................................................TTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGTTCG................................................................................................................................................................... | 27 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ............................................................TTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTAA................................................................................................................................................................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ........................ATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCGAG........................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................TTGTACTCCAGCCTGTTG............................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................ACCCTGCCATTGTACTCCAGCCT................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................AGACCCTGCCATTGTACTCCAGCCTGG.............................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................ACTCTGTCTCAAAAACAAACGAACAAACAGAAACAACGGTTAACACATGTTCTTTTTCAATAG.................................................. | 63 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GGGTGATTCTGAAGAATGT................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................CTATAGTCCCAGCTACTTGGATTG............................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...CAGGTGTGGTGGCATGTGC.................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................ATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGACC................................................................................................................................................................ | 31 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................AGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGATGT..................................................................................................................................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................GCGAGACTCTGTCTCAAAAACAACAGA........................................................................................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................TTGTACTCCAGCCTGTGGC........................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................AGGTTGCAGTGAGCCGAGACCCCATC............................................................................................................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................AGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGATG...................................................................................................................................................................... | 31 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................ATTCTGAAGAGGGTCTGGAGGAG....................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................TGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGGCTG.................................................................................................................................................................. | 27 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................AGGAGAATTGCTTGAACCCATTC.............................................................................................................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................GGAGAATTGCTTGAACCCAGGCGAT........................................................................................................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | |
| ...................................................................AACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTCT............................................................................................................................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
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| ................................................................................................................................................................................................................TGAAGAGGGTCTGGAGGAGC...................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................GAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGC............................................................................................................................................................. | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................TCTCAAAAACAAACGAACAAACAGGG................................................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................AAACAAACGAACAAAAGTT.................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................AAAACAAACGAACAAACAGACGAG.............................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................GGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGGG.................................................................................................................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................AACAAACGAACAAACAGACG................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....GGTGTGGTGGCATGTGCCTAGGC.............................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................GGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAAGGG.................................................................................................................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................AACAAACGAACAAACAGG.................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................TAGCTGGGACTATAGGCACA..................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GTTTCTGTTTGTTCGTTTGTTTTTG............................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GAGGTTGCAGTGAGCCGAGACGC................................................................................................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................AACAAACGAACAAACCGG.................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .....................................................................................................................................................AAACAAACGAACAAACAGAAACTTG............................................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .....................................................................................................................................................AAACAAACGAACAAACACC.................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |