| (2)  B-CELL  | (3)  BRAIN  | (2)  BREAST  | (13)  CELL-LINE  | (3)  CERVIX  | (1)  HELA  | (1)  KIDNEY  | (2)  LIVER  | (2)  OTHER  | (14)  SKIN  | (1)  TESTES  | 
| CTACTACTCTTCTTGGTCAGTTTCTGGAAGACATGGAAGCATATGCTGAGGTGAGTATATAGAAAGCTGTTTCTTAAAATTTTGGTTAAGAAAAAATCTTAAATTGTGCTAGATTTATTTTAAAATGGCTCAGACCTCCTGACATTTAAGCAGAAATTACATGCCCATTGCAATATTTTAAACATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGGTC .....................................................((((((....(((...((((((((........))))))))....)))....))))))...((((((((((((....((((.....))))..........(((((....(((.....)))..)))))..................))))))))))))......................................... ..................................................51............................................................................................................................................................209.......................................  | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)  | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)  | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes)  | SRR189784 | SRR189782 | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver)  | SRR343334 | SRR189785 | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line)  | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell)  | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver)  | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR040018(GSM532903) G701N. (cervix)  | SRR330873(SRX091711) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330900(SRX091738) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR040010(GSM532895) G529N. (cervix)  | SRR330907(SRX091745) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood)  | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line)  | SRR330922(SRX091760) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum)  | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line)  | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR040025(GSM532910) G613T. (cervix)  | SRR015447(SRR015447) nuclear small RNAs. (breast)  | SRR390723(GSM850202) total small RNA. (cell line)  | DRR000559(DRX000317) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line)  | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line)  | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell)  | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR330897(SRX091735) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney)  | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela)  | SRR330890(SRX091728) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330859(SRX091697) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | 
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| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTATT.............................................. | 23 | 5.00 | 0.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTACTC............................................. | 24 | 5.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ........................................................................................................................................................................TGCAATATTTTAAACTGT................................................................ | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTATTT............................................. | 24 | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTACCC............................................. | 24 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTATAG............................................. | 24 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTATCG............................................. | 24 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................AACATTTTTTTTTTTTTTTTTAAT.............................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .........................................................................................................................................CCTGACATTTAAGCAGAAATTACATGCC..................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................AAACATTTTTTTTTTTTTTTATTT............................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................TGGAAGACATGGAAGCATA............................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGAG......................................... | 28 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .................................................................................................................................................................TGCCCATTGCAATATTTTA...................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................GTATATAGAAAGCTGGCC.................................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................CTGGAAGACATGGAAGCATATGCTGAG........................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTATA.............................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ....................................................................................................................................................................................AACATTTTTTTTTTTTTTTTCGCT.............................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ................................................................................................................................................................................TTTAAACATTTTTTTTTTTCTT.................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............GGTCAGTTTCTGGAAGACATGGAAG................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....ACTCTTCTTGGTCAGTTTCTGGAAGA........................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTACAC............................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................TCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGGCCTC | 32 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................TTGAGATGGAGTCTCGCTCTGA............................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............GTCAGTTTCTGGAAGACATGG...................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TTAAACATTTTTTTTTTTTCTCT.................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................CTGGAAGACATGGAAGCATATGCTGAGGA...................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .......................................................................................................TTGTGCTAGATTTATTCAT................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................................................................ACCCAGGCTGGAGTGCAATGGA...... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................AGACATGGAAGCATATGCTGAGGACC.................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................TGGAAGACATGGAAGCATATGCTGAGGT...................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................ATTTTTTTTTTTTTTTTTGATCGC........................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..ACTACTCTTCTTGGTCAG...................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................TTCTGGAAGACATGGAAGCATATG............................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................AACATTTTTTTTTTTTTTTTCCTA.............................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................GAAGACATGGAAGCATATGCTGAGGACC.................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................TAAACATTTTTTTTTTTTTTTTTTAAG............................................. | 27 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................TGGAAGACATGGAAGCATATGCTGA......................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TAAACATTTTTTTTTTTTTTTTAAG............................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................TCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGGTCCC | 32 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................TGGAAGACATGGAAGCATATG............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTATAT............................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............GTCAGTTTCTGGAAGACATGGAAGAAGC............................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................CAATATTTTAAACATTTCTGT........................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................CTGGAAGACATGGAAGCA................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TAAACATTTTTTTTTTTTTTTTTCTG.............................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................AAGACATGGAAGCATATGCTGAGGACC.................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................ACATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGG.......................................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................CTGGAAGACATGGAAGCATATG............................................................................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................TTTCTGGAAGACATGGAAGCA................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TTGTGCTAGATTTATCTAG................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................CAATATTTTAAACATTTTTTTTTTTTTTTG.................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGGAGTGCAATGGCACGGTCACAG | 28 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................ATGGCTCAGACCTCCTGAC........................................................................................................... | 19 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TTAAACATTTTTTTTTTTTTTTTTG................................................ | 25 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................TTTCTGGAAGACATGGA..................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................AAAAAATCTTAAATTGTGCTAGA......................................................................................................................................... | 23 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................AGACCTCCTGACATTTAAGCAGA................................................................................................ | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | 
| ................................ATGGAAGCATATGCTGA......................................................................................................................................................................................................... | 17 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | 
| ..........................GAAGACATGGAAGCATATGCTGAG........................................................................................................................................................................................................ | 24 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................AAGCTGTTTCTTAAAATTTTGG..................................................................................................................................................................... | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................CCTCCTGACATTTAAGCAGAAATT............................................................................................ | 24 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | 
| .........................................TATGCTGAGGTGAGTATATAGAAAGC....................................................................................................................................................................................... | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TGGCTCAGACCTCCTGACATTTAAGC................................................................................................... | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................GAGGTGAGTATATAGAAAGCTG..................................................................................................................................................................................... | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................CAGACCTCCTGACATTTAAGCAGAA............................................................................................... | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | 
| ......................................................GTATATAGAAAGCTGTTT.................................................................................................................................................................................. | 18 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 
| CTACTACTCTTCTTGGTCAGTTTCTGGAAGACATGGAAGCATATGCTGAGGTGAGTATATAGAAAGCTGTTTCTTAAAATTTTGGTTAAGAAAAAATCTTAAATTGTGCTAGATTTATTTTAAAATGGCTCAGACCTCCTGACATTTAAGCAGAAATTACATGCCCATTGCAATATTTTAAACATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGGTC .....................................................((((((....(((...((((((((........))))))))....)))....))))))...((((((((((((....((((.....))))..........(((((....(((.....)))..)))))..................))))))))))))......................................... ..................................................51............................................................................................................................................................209.......................................  | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)  | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)  | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes)  | SRR189784 | SRR189782 | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver)  | SRR343334 | SRR189785 | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line)  | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell)  | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver)  | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR040018(GSM532903) G701N. (cervix)  | SRR330873(SRX091711) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330900(SRX091738) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR040010(GSM532895) G529N. (cervix)  | SRR330907(SRX091745) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood)  | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line)  | SRR330922(SRX091760) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum)  | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line)  | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR040025(GSM532910) G613T. (cervix)  | SRR015447(SRR015447) nuclear small RNAs. (breast)  | SRR390723(GSM850202) total small RNA. (cell line)  | DRR000559(DRX000317) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line)  | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line)  | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell)  | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR330897(SRX091735) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney)  | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela)  | SRR330890(SRX091728) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330859(SRX091697) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................TTGGTTAAGAAAAAATGCTG..................................................................................................................................................... | 20 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................TGAGGTGAGTATATACAAG......................................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGAGTGCAATGGCACGGTGGGG | 26 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGAGTGCAATGGCACGGTAGCG | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................ATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGCAA.............. | 32 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGAGTGCAATGGCACGGTGAG | 25 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGAGTGCAATGGCACGGGGGC | 25 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGAGTGCAATGGCACGGTGGGC | 26 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................AATATTTTAAACATTTACCT........................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............TTGGTCAGTTTCTGGAATC........................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGAGTGCAATGGCACGGTAC | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................TTTTGGTTAAGAAAAAATACA...................................................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................GTCACCCAGGCTGGAGTGCAAC......... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................TACTCACCTCAGCATATGCTTCC................................................................................................................................................................................................. | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |