uc004fus.2_intron_2_0_chrY_23749549

CTGGGTATGAAAGTTCTCACATTGGGAGTTTGCCAGAATGGCCCCAATTTGCACTCCAAATATTCTTTGCACGTTGAAATACTCCCACCTGAATTCTGGGCCATAGTGTGGACTGCTTTTGAAATTAAGGGAATGTTGGGATGGAGTTAGAAGCACCTTTTGTGTCATCTGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTTGCAGGTGAAGTTGCTGGAACCCATTCTCCATTCAGCAGATTGTATCCTCACCCC .............................................................................................................................((((.(((((...((((((((.((((.((((.....))))..)))).))))))))...))))).))))......................................................... .........................................................................................................................122...........................................................................200................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)	SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)	SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)	SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)	SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)	SRR343335	SRR343334	SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)	SRR189782	SRR189785	SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)	SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver)
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACAAG.....................................................	25		7.00	0.00	4.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTAG..................................................	28		6.00	0.00	3.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTG...................................................	28		4.00	0.00	-	1.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTCTTG..........................................................	20		3.00	0.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTAG.....................................................	26		3.00	0.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTCTTG...................................................	28		3.00	0.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTCATG.......................................................	23		3.00	0.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCTAG...................................................	27		2.00	0.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTTG..................................................	29		2.00	0.00	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTCTTG..........................................................	21		2.00	0.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCATG...................................................	27		2.00	0.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTCATG.......................................................	24		2.00	0.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCCG...................................................	27		2.00	0.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TCTGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTG......................................................	29		1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATAATA....................................................	26		1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATCAAG....................................................	26		1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATAAG.....................................................	25		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCTTG...................................................	27		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................ATATTCTTTGCACGTT...............................................................................................................................................................................	16	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTCATA...................................................	28		1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................TGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATC...................................................	30		1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACG.......................................................	23		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................CATTCAGCAGATTGTGCTC.......	19		1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATCTAG....................................................	26		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACTTG.....................................................	25		1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................CTGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTTG.....................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTCTAG.......................................................	23		1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATCTTG....................................................	27		1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTGCAGTCTG..............................................	28		1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTCTT....................................................	27		1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTGCGGAG................................................	24		1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCCG....................................................	26		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTAAG....................................................	27		1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTACCG..........................................................	21		1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCTG....................................................	26		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACAG......................................................	24		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTGCGAG.................................................	23		1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACTAT.....................................................	25		1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTTA..................................................	28		1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATCG......................................................	24		1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATATCG....................................................	26		1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCAAG..................................................	28		1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTCGAG.......................................................	23		1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................AAGGGAATGTTGGGATGGAGTT......................................................................................................	22	4	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50

CTGGGTATGAAAGTTCTCACATTGGGAGTTTGCCAGAATGGCCCCAATTTGCACTCCAAATATTCTTTGCACGTTGAAATACTCCCACCTGAATTCTGGGCCATAGTGTGGACTGCTTTTGAAATTAAGGGAATGTTGGGATGGAGTTAGAAGCACCTTTTGTGTCATCTGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTTGCAGGTGAAGTTGCTGGAACCCATTCTCCATTCAGCAGATTGTATCCTCACCCC
.............................................................................................................................((((.(((((...((((((((.((((.((((.....))))..)))).))))))))...))))).)))).........................................................
.........................................................................................................................122...........................................................................200................................................

Size

Perfect hit

Total Norm

Perfect Norm

SRR189778(GSM714638)
cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)

SRR189777(GSM714637)
cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)

SRR189776(GSM714636)
cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)

SRR189775(GSM714635)
cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line)

SRR189780(GSM714640)
cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)

SRR343335

SRR343334

SRR189781(GSM714641)
cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)

SRR189782

SRR189785

SRR189779(GSM714639)
cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)

SRR039616(GSM531979)
HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver)

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACAAG.....................................................

7.00

0.00

4.00

2.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTAG..................................................

6.00

0.00

3.00

2.00

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTG...................................................

4.00

0.00

1.00

2.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTCTTG..........................................................

3.00

0.00

2.00

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTAG.....................................................

3.00

0.00

3.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTCTTG...................................................

3.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTCATG.......................................................

3.00

0.00

3.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCTAG...................................................

2.00

0.00

2.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTTG..................................................

2.00

0.00

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTCTTG..........................................................

2.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCATG...................................................

2.00

0.00

2.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTCATG.......................................................

2.00

0.00

2.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCCG...................................................

2.00

0.00

2.00

.......................................................................................................................................................................TCTGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTG......................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATAATA....................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATCAAG....................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATAAG.....................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCTTG...................................................

1.00

0.00

1.00

...........................................................ATATTCTTTGCACGTT...............................................................................................................................................................................

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTCATA...................................................

1.00

0.00

1.00

.........................................................................................................................................................................TGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATC...................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACG.......................................................

1.00

0.00

1.00

................................................................................................................................................................................................................................CATTCAGCAGATTGTGCTC.......

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATCTAG....................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACTTG.....................................................

1.00

0.00

1.00

........................................................................................................................................................................CTGTCTTTATTTATTTATTTATTTATTTG.....................................................

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTCTAG.......................................................

1.00

0.00

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATCTTG....................................................

1.00

0.00

1.00

................................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTGCAGTCTG..............................................

1.00

0.00

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTCTT....................................................

1.00

0.00

1.00

..................................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTGCGGAG................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCCG....................................................

1.00

0.00

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTATTTATTAAG....................................................

1.00

0.00

1.00

...........................................................................................................................................................................TCTTTATTTATTTATTTACCG..........................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTCTG....................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACAG......................................................

1.00

0.00

1.00

..................................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTGCGAG.................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTACTAT.....................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCTTA..................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATCG......................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATATCG....................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTTATTTCAAG..................................................

1.00

0.00

1.00

............................................................................................................................................................................CTTTATTTATTTATTTATTCGAG.......................................................

1.00

0.00

1.00

..............................................................................................................................AAGGGAATGTTGGGATGGAGTT......................................................................................................

0.50