| (2) B-CELL | (1) BREAST | (8) CELL-LINE | (1) LIVER | (1) OTHER | (1) SKIN |
| ACATTAAGAAATTGAATATAAAATTGCAATGTAGTTGCATAAAGTTTCTCTTTAAAATTATAAATTTGAGAAGGATATCATTTAAGGACTCCTGATAAGAGAACATTTAAAATGATATGGAATTATCTGATGTTTTATTTCAATATACTAAAAAGATACTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATAGCCAGAACCACCAAAGAAACCATCTAATTGGAGAAGGAAACATGAAGAATT .................................................................((((((((((((((.((((((...((((....)).))...))))))..((((......)))).)))))))).)))))).....((((.(((((.....))))).))))............................................................................. ........................................................57...........................................................................................................................182.................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR189782 | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR033719(GSM497064) 6hr Activated B cell line (ABC158). (B cell) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR033720(GSM497065) EBV activated B cell line (EBV159). (B cell) | SRR189784 | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR330919(SRX091757) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR343337 | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR343334 | SRR343335 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATCATG........................................................ | 26 | 6.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATAAATG............................................... | 30 | 6.00 | 0.00 | 4.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTCG................................................ | 33 | 4.00 | 0.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCAG................................................. | 34 | 4.00 | 0.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCG................................................. | 32 | 4.00 | 0.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATCATG........................................................ | 28 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATCTCG........................................................ | 28 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCAG................................................. | 33 | 3.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTGC........................................................ | 29 | 3.00 | 0.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAACAG..................................................... | 35 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTAG........................................................ | 32 | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................AAACCATCTAATTGGAGAAGGA............. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................TGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTCAAG...................................................... | 33 | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTGC.................................................... | 31 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................TTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTCGAG.......................................................... | 31 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTCG.................................................... | 30 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTGC.................................................... | 30 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATATTAG............................................... | 34 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCGGT.................................................... | 30 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................TTGGAGAAGGAAACATGA...... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCG...................................................... | 32 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATAAATG............................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................ATACTGTTTGTTTATTTATTTTG........................................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATAAATA............................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATCAAG............................................................ | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................AAAGAAACCATCTAATTG..................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTCAG.................................................... | 34 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................CTGTTTGTTTATTTATTGAGG....................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................AAATTTGAGAAGGATGCT........................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATATACG............................................... | 35 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................TTAAGGACTCCTGATTCGC...................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTTATCTAG............................................................ | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTCTTG............................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..............................................................................................................................................................................................................................CTAATTGGAGAAGGAAACAT........ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
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| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCG................................................. | 33 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCAG................................................. | 35 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................TTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTGGG............................................................ | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................GTTTATTTATTTATTTATTTAACAG............................................................. | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATATTAG............................................... | 32 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................................................................AATTGGAGAAGGAAACATG....... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TTGCAATGTAGTTGCATTTCA.............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................GTTTGTTTATTTATTTATTTATTTAATG.............................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATATCG................................................ | 30 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................CTGTTTGTTTATTTATTTATCAAG.................................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCC................................................. | 33 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................GTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTCG............................................................ | 30 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATTTACAAG......................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATATTAG............................................... | 31 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCTG................................................ | 34 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................ATACTGTTTGTTTATTTATT........................................................................... | 20 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................ATACTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATT............................................................... | 32 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGGAGAAGGAAACATG....... | 16 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 0.12 |
| ACATTAAGAAATTGAATATAAAATTGCAATGTAGTTGCATAAAGTTTCTCTTTAAAATTATAAATTTGAGAAGGATATCATTTAAGGACTCCTGATAAGAGAACATTTAAAATGATATGGAATTATCTGATGTTTTATTTCAATATACTAAAAAGATACTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATAGCCAGAACCACCAAAGAAACCATCTAATTGGAGAAGGAAACATGAAGAATT .................................................................((((((((((((((.((((((...((((....)).))...))))))..((((......)))).)))))))).)))))).....((((.(((((.....))))).))))............................................................................. ........................................................57...........................................................................................................................182.................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR189782 | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR033719(GSM497064) 6hr Activated B cell line (ABC158). (B cell) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR033720(GSM497065) EBV activated B cell line (EBV159). (B cell) | SRR189784 | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR330919(SRX091757) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR343337 | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR343334 | SRR343335 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................................................................................................................................CCAAAGAAACCATCTGGC....................... | 18 | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................GTTTGTTTATTTATTTGATG...................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
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| .........................................................................................................................................................................................................CAGAACCACCAAAGATTG............................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................AGCCAGAACCACCAAAGAGG................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................ATTGGAGAAGGAAACGACC...... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................TTAAAATTATAAATTCCTT.................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |