| (2) AGO2.ip | (3) B-CELL | (5) BRAIN | (18) BREAST | (28) CELL-LINE | (10) CERVIX | (1) FIBROBLAST | (8) HEART | (1) HELA | (6) LIVER | (2) OTHER | (16) SKIN | (3) UTERUS | (1) XRN.ip |
| GCACTATAAGGATCAGGAGTATTATTAAGTGTTTTAAGGCCTTATTTCTTATACTACTGTACAGAGAATTGTTTAAACCATTTTTTTTAAAAAGAAAGCATCTCTTTTTATGTATTTCTTGTTTGGCCTTTTCTTTTTTTACAGTAATAAAGGGAAGGAAAATAGCTTATGCATTGTTTTTTTCCCTTGTCTGTGGCTAGGTCTTCTTGTCAAAAAGATGCTGTTGGAAGCCTCTACGAAGCCAGAAATG ..........................................................((((.((((((.((....)).))))))..((((((((.......)))))))).))))....................................................................................................................................... ........................................................57................................................................123............................................................................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR314796(SRX084354) "Total RNA, fractionated (15-30nt)". (cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR189786 | SRR189784 | SRR189785 | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR015447(SRR015447) nuclear small RNAs. (breast) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040018(GSM532903) G701N. (cervix) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | TAX577588(Rovira) total RNA. (breast) | SRR094129(GSM651905) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR040024(GSM532909) G613N. (cervix) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR444042(SRX128890) Sample 3cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR040028(GSM532913) G026N. (cervix) | SRR040011(GSM532896) G529T. (cervix) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR040016(GSM532901) G645N. (cervix) | SRR039618(GSM531981) HBV(+) Side Tissue Sample 1. (liver) | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR015359(GSM380324) Germinal Center B cell (GC136). (B cell) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR444062(SRX128910) Sample 27_3cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR191624(GSM715734) 31genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR040032(GSM532917) G603N. (cervix) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR040031(GSM532916) G013T. (cervix) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR444058(SRX128906) Sample 16cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (skin) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR189782 | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR040010(GSM532895) G529N. (cervix) | SRR033729(GSM497074) splenic MZL (Splenic414). (B cell) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR040030(GSM532915) G013N. (cervix) | SRR040036(GSM532921) G243N. (cervix) | SRR038858(GSM458541) MEL202. (cell line) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR038857(GSM458540) D20. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR015448(SRR015448) cytoplasmic small RNAs. (breast) | SRR029132(GSM416761) MB-MDA231. (cell line) | SRR363673(GSM830250) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR330895(SRX091733) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR444061(SRX128909) Sample 19cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (skin) | SRR444045(SRX128893) Sample 6cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | GSM450610(GSM450610) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) |
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| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAAC............................................................................................................................................................................ | 17 | 9 | 2.11 | 2.11 | - | - | 0.44 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.56 | - | - | - | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAACTTA.......................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAAAGA.......................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................ACAGAGAATTGTTTAAACTAGA........................................................................................................................................................................ | 22 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAAAG........................................................................................................................................................................... | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAAAGT.......................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAATTAG.......................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAGTT........................................................................................................................................................................... | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAGTTA.......................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................AGATGCTGTTGGAAGCTGG................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAGAA........................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAACGGA.......................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAAACA.......................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAACTC........................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..ACTATAAGGATCAGGAGA...................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................ACAGAGAATTGTTTACAT............................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAAAAG.......................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................CTGTTGGAAGCCTCTACGAAGCCAG..... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACCAGA........................................................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................AGAGAATTGTTTAAACTAGA........................................................................................................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................CTGTTGGAAGCCTCTACG............ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAACC............................................................................................................................................................................ | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAATCCC.......................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................GCCTTTTCTTTTTTTAGCC.......................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................GAGAATTGTTTAAACTAG......................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................CATCTCTTTTTATGTATTTGT................................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................AAACCATTTTTTTTACTTT............................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................GCTGTTGGAAGCCTCTACG............ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...CTATAAGGATCAGGAGACTG................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................TGGCCTTTTCTTTTTTTCTTT.......................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGCTGTTGGAAGCCTCTACGAAGCC....... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................AAGGGAAGGAAAATATCTG.................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................TGTGGCTAGGTCTTCT........................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAAAAT.......................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................CAAAAAGATGCTGTTGGA...................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................ACAGAGAATTGTTTAAATCAG......................................................................................................................................................................... | 21 | 5 | 0.80 | 13.80 | - | - | - | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACTAG......................................................................................................................................................................... | 20 | 9 | 0.78 | 2.11 | - | - | - | - | 0.22 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................CTTTTCTTTTTTTACAGT......................................................................................................... | 18 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................ACAGAGAATTGTTTAACCA........................................................................................................................................................................... | 19 | 8 | 0.25 | 2.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................ACAGAGAATTGTTTAAAGTAG......................................................................................................................................................................... | 21 | 5 | 0.20 | 13.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACC........................................................................................................................................................................... | 18 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACCCGGT....................................................................................................................................................................... | 22 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACTA.......................................................................................................................................................................... | 19 | 9 | 0.11 | 2.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACAAA......................................................................................................................................................................... | 20 | 9 | 0.11 | 2.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACGAGA........................................................................................................................................................................ | 21 | 9 | 0.11 | 2.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACGTCT........................................................................................................................................................................ | 21 | 9 | 0.11 | 2.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................CAGAGAATTGTTTAAACGACA........................................................................................................................................................................ | 21 | 9 | 0.11 | 2.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - |
| GCACTATAAGGATCAGGAGTATTATTAAGTGTTTTAAGGCCTTATTTCTTATACTACTGTACAGAGAATTGTTTAAACCATTTTTTTTAAAAAGAAAGCATCTCTTTTTATGTATTTCTTGTTTGGCCTTTTCTTTTTTTACAGTAATAAAGGGAAGGAAAATAGCTTATGCATTGTTTTTTTCCCTTGTCTGTGGCTAGGTCTTCTTGTCAAAAAGATGCTGTTGGAAGCCTCTACGAAGCCAGAAATG ..........................................................((((.((((((.((....)).))))))..((((((((.......)))))))).))))....................................................................................................................................... ........................................................57................................................................123............................................................................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR314796(SRX084354) "Total RNA, fractionated (15-30nt)". (cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR189786 | SRR189784 | SRR189785 | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR015447(SRR015447) nuclear small RNAs. (breast) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040018(GSM532903) G701N. (cervix) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | TAX577588(Rovira) total RNA. (breast) | SRR094129(GSM651905) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR040024(GSM532909) G613N. (cervix) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR444042(SRX128890) Sample 3cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR040028(GSM532913) G026N. (cervix) | SRR040011(GSM532896) G529T. (cervix) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR040016(GSM532901) G645N. (cervix) | SRR039618(GSM531981) HBV(+) Side Tissue Sample 1. (liver) | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR015359(GSM380324) Germinal Center B cell (GC136). (B cell) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR444062(SRX128910) Sample 27_3cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR191624(GSM715734) 31genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR040032(GSM532917) G603N. (cervix) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR040031(GSM532916) G013T. (cervix) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR444058(SRX128906) Sample 16cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (skin) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR189782 | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR040010(GSM532895) G529N. (cervix) | SRR033729(GSM497074) splenic MZL (Splenic414). (B cell) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR040030(GSM532915) G013N. (cervix) | SRR040036(GSM532921) G243N. (cervix) | SRR038858(GSM458541) MEL202. (cell line) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR038857(GSM458540) D20. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR015448(SRR015448) cytoplasmic small RNAs. (breast) | SRR029132(GSM416761) MB-MDA231. (cell line) | SRR363673(GSM830250) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR330895(SRX091733) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR444061(SRX128909) Sample 19cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (skin) | SRR444045(SRX128893) Sample 6cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | GSM450610(GSM450610) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) |
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