| (1) AGO1.ip | (1) BREAST | (9) CELL-LINE | (1) HELA | (4) OTHER | (1) SKIN |
| AATTGGTCTTGTCTTAACCAGAATTCTATTTAATACACAACACCTTTAGTGAGCTGTTATGCATGTAATAGGTGTTTACTAAGTATTGGTTGAATAAATTCAAGAAATGCTTGCTATTTTTGTGCTAGCATTTAGCTTTTCTCTATAGTATATTATAATGGAATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTCGCCAGGTTGGAGTACAATGGCACGATCTTGGCTCA ......................................................................................................(((((.((((((((.........)))))...))).)))))....((((...((.((((((((........)))))))).))..))))............................................................. .............................................................................................94..............................................................................................190.......................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR343334 | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR343336 | GSM1105753INPUT(GSM1105753) small RNA sequencing data. (hela) | SRR189782 | SRR343335 | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTCTTG................................................................ | 25 | 41.00 | 0.00 | 15.00 | 7.00 | 14.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTG............................................................ | 29 | 15.00 | 0.00 | 4.00 | 3.00 | 7.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTATTTCG.............................................................. | 27 | 10.00 | 0.00 | 7.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATG............................................................. | 28 | 8.00 | 0.00 | 6.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTATTTTTTAACG..................................................... | 30 | 4.00 | 0.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................TTATTTTATTTTATTTTATTTAACTG........................................................... | 26 | 4.00 | 0.00 | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................TTTATTTTATTTTATTTATTTTTTATG...................................................... | 27 | 3.00 | 0.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTTTTTCAG...................................................... | 34 | 3.00 | 0.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTCTTT................................................................ | 25 | 3.00 | 0.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..........................................................................................................................................................................TTATTTTATTTTATTTATTTTTTGAGGCG................................................... | 29 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ...........................................................................................................................................................................TATTTTATTTTATTTATTTTCTTG....................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .........................................................................................................................................................................TTTATTTTATTTTATTTATTTTCGGG....................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATC............................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTATTATCT......................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ......................................................................................................................................................................TATTTTATTTTATTTTATTTATATAA.......................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTACG............................................................. | 27 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .........................................................................................................................................................................TTTATTTTATTTTATTTATTTCTCG........................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .......................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTATTTCTAG........................................................ | 27 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTAATG............................................................ | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTATTTTTCTAG...................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTCCTC................................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATCTGG.......................................................... | 30 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..................................................................................................TTCAAGAAATGCTTGTTAG..................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | |
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| .......................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTATTCTG.......................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTATTC......................................................... | 31 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................AATTTTATTTTATTTTATTTTATTTCTTG............................................................ | 29 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ........................................................................................................................................................................TTTTATTTTATTTTATTTATTTTTCCTG...................................................... | 28 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................TTATTTTATTTTATTTATTATAG......................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTACATG........................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................TTTATTTTATTTTATTTATTTTTTAACG..................................................... | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..................................................................................................................................................................ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATGC............................................................ | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................TTTATTTTATTTTATTTTATTTATTTTCTTG....................................................... | 31 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................TTTTATTTATTTTTTGAGACAGAGGG.............................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................TTTTGTGCTAGCATTATTG.................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
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| ..........................................................................................................................................................................TTATTTTATTTTATTTATTCTAG......................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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