| (8)  B-CELL  | (5)  BRAIN  | (6)  BREAST  | (14)  CELL-LINE  | (1)  CERVIX  | (4)  HEART  | (1)  HELA  | (3)  LIVER  | (1)  OTHER  | (1)  RRP40.ip  | (18)  SKIN  | (1)  TESTES  | (1)  UTERUS  | (2)  XRN.ip  | 
| GGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAGGTGGGTGTGCCGCGGAGGGCCAGGTCGGGGTCAGGGGTCAGAGGTCAGGTGGCCGCGTTGGCCTCCTGGGCTGCGGGTGGAGTCGGGGGTCTGGAGAGGGCAACTTGGACTCTGAGGAGACTGCTGGATGGTGTGACGGGCGTTGGGGGGCTCGGAGGTCGGAGCGTGGGGTCTGGGGGTGACAGTGGCTGCACGTAGGA ........................................................................................................................................((((((....(((....)))))))))..((....)).((.((((..........)))).))..................................................... ........................................................................................................................................137............................................................200................................................  | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line)  | SRR189785 | SRR343337 | SRR015363(GSM380328) Germinal Center B cell (GC40). (B cell)  | SRR343336 | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line)  | SRR343335 | SRR343334 | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line)  | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell)  | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR033726(GSM497071) Mututated CLL (CLLM633). (B cell)  | SRR330919(SRX091757) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR191548(GSM715658) 101genomic small RNA (size selected RNA from . (breast)  | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex)  | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell)  | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart)  | SRR033719(GSM497064) 6hr Activated B cell line (ABC158). (B cell)  | SRR189784 | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line)  | SRR033718(GSM497063) Multiple Myeloma (U266). (B cell)  | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela)  | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus)  | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line)  | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR189783 | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330922(SRX091760) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart)  | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell)  | SRR189782 | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line)  | SRR330897(SRX091735) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR060982(GSM569186) Human centrocyte [09-001]. (cell line)  | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix)  | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR444052(SRX128900) Sample 12cDNABarcode: AF-PP-340: ACG CTC TTC . (skin)  | SRR033720(GSM497065) EBV activated B cell line (EBV159). (B cell)  | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart)  | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes)  | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line)  | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR191561(GSM715671) 80genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast)  | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver)  | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR330893(SRX091731) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver)  | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line)  | SRR191550(GSM715660) 27genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast)  | SRR039624(GSM531987) HBV(-) HCV(-) Adjacent Tissue Sample. (liver)  | SRR207119(GSM721081) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line)  | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line)  | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin)  | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart)  | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line)  | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330859(SRX091697) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330904(SRX091742) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................................................................................................................................TGGAGAGGGCAACTTTGG........................................................................................... | 18 | 16.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | 9.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................AACTTGGACTCTGAGGAGAC............................................................................... | 20 | 1 | 13.00 | 13.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................TTGGACTCTGAGGAGACTGC............................................................................ | 20 | 1 | 6.00 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................GCTGGATGGTGTGACGGG............................................................ | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................GCGTTGGGGGGCTCGTGG........................................... | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................GAGGAGACTGCTGGATGGTG................................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................GGCAACTTGGACTCTGAGGAGAC............................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............ATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCT................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................AAGCTCCCGGGCAGGTGGGTG................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................CGCGGAGGGCCAGGTTGG............................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................GAGACTGCTGGATGGTGTGA................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................GGGTCTGGAGAGGGCAACTTGGACT......................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................ACTCTGAGGAGACTGCC........................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................................CGGGCGTTGGGGGGCTCGGAGGTCGGGGG................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................CTGGAAGCGCAGCAACAGC...................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................AGAGGGCAACTTGGATG......................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................CTGCTGGATGGTGTGACGGG............................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................AACTTGGACTCTGAGGAGACTGCT........................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................CTGGAAGCGCAGCAACA........................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................GACTCTGAGGAGACTGCTGGATG...................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................GGGGGTCTGGAGAGGGCAA................................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................AACTTGGACTCTGAGGAG................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................CAACTTGGACTCTGAGGAGAC............................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................TGGAGAGGGCAACTTGGACTCTGAGGAGACTGCTG.......................................................................... | 35 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................TGGACTCTGAGGAGACTGCT........................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....CAGGAAGCAATTCTGGAAGCGC............................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................AGGAGACTGCTGGATGGTGTGACGGGCGC......................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................AGGAGACTGCTGGATGGTGTG................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................AGACTGCTGGATGGTGAAAA............................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................TGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAG........................................................................................................................................................................................................ | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................GCTGGATGGTGTGACGGAAG.......................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................CTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGC.......................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................TCGGGGTCAGGGGTCAGAGGTCAGGTG..................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............AATTCTGGAAGCGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................CTGGGCTGCGGGTGGAGTCGGGGA............................................................................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................GAGTCGGGGGTCTGGAGAG...................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......GGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACA........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................CGGAGCGTGGGGTCTGGGGGTG................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................TGGACTCTGAGGAGACTGCTGGATGGT.................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................GGCAACTTGGACTCTGAGGA.................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................TGCGGGTGGAGTCGGGGGTGTTT.......................................................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TGGAGAGGGCAACTTTGGG.......................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............TTCTGGAAGCGCAGCAACAGC...................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............ATTCTGGAAGCGCAGCAAC......................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................GAGGGCAACTTGGACTCTGAGG................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................GCTGCGGGTGGAGTCGGGGG............................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................AACTTGGACTCTGAGGAGACT.............................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................GGTGGAGTCGGGGGTTCA........................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................CTCCTGGGCTGCGGGTG......................................................................................................................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................AGACTGCTGGATGGTGTG................................................................. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............ATTCTGGAAGCGCAG............................................................................................................................................................................................................................. | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................TGGAGTCGGGGGTCT............................................................................................................ | 15 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | 
| ..............................................................................................................GCCTCCTGGGCTGCGGG........................................................................................................................... | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 
| ...............................................................................................................CCTCCTGGGCTGCGG............................................................................................................................ | 15 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | 
| .......................................................................................................................................GGGGTCTGGAGAGGGC................................................................................................... | 16 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 
| GGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAGGTGGGTGTGCCGCGGAGGGCCAGGTCGGGGTCAGGGGTCAGAGGTCAGGTGGCCGCGTTGGCCTCCTGGGCTGCGGGTGGAGTCGGGGGTCTGGAGAGGGCAACTTGGACTCTGAGGAGACTGCTGGATGGTGTGACGGGCGTTGGGGGGCTCGGAGGTCGGAGCGTGGGGTCTGGGGGTGACAGTGGCTGCACGTAGGA ........................................................................................................................................((((((....(((....)))))))))..((....)).((.((((..........)))).))..................................................... ........................................................................................................................................137............................................................200................................................  | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line)  | SRR189785 | SRR343337 | SRR015363(GSM380328) Germinal Center B cell (GC40). (B cell)  | SRR343336 | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line)  | SRR343335 | SRR343334 | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line)  | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell)  | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR033726(GSM497071) Mututated CLL (CLLM633). (B cell)  | SRR330919(SRX091757) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR191548(GSM715658) 101genomic small RNA (size selected RNA from . (breast)  | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex)  | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell)  | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart)  | SRR033719(GSM497064) 6hr Activated B cell line (ABC158). (B cell)  | SRR189784 | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line)  | SRR033718(GSM497063) Multiple Myeloma (U266). (B cell)  | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela)  | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus)  | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line)  | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR189783 | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330922(SRX091760) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart)  | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell)  | SRR189782 | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line)  | SRR330897(SRX091735) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR060982(GSM569186) Human centrocyte [09-001]. (cell line)  | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix)  | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR444052(SRX128900) Sample 12cDNABarcode: AF-PP-340: ACG CTC TTC . (skin)  | SRR033720(GSM497065) EBV activated B cell line (EBV159). (B cell)  | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart)  | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes)  | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line)  | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR191561(GSM715671) 80genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast)  | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver)  | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain)  | SRR330893(SRX091731) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin)  | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver)  | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line)  | SRR191550(GSM715660) 27genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast)  | SRR039624(GSM531987) HBV(-) HCV(-) Adjacent Tissue Sample. (liver)  | SRR207119(GSM721081) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line)  | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast)  | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line)  | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line)  | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin)  | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart)  | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line)  | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330859(SRX091697) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin)  | SRR330904(SRX091742) tissue: normal skindisease state: normal. (skin)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................................................................................................ATGGTGTGACGGGCGGGGA...................................................... | 19 | 19.00 | 0.00 | - | 10.00 | 1.00 | - | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................ATGGTGTGACGGGCGG......................................................... | 16 | 15.50 | 0.00 | - | - | 5.00 | - | 8.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................ATGGTGTGACGGGCGGG........................................................ | 17 | 9.00 | 0.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................ATGGTGTGACGGGCGGGG....................................................... | 18 | 6.00 | 0.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................ATGGTGTGACGGGCGGGAG...................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................CCCCCCAACGCCCGTCACACCATCCA.................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................AACGCGGCCACCTGAC............................................................................................................................................. | 16 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................AGGTGGCCGCGTTGGCCC........................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................GCCTCCTGGGCTGCGGTTC......................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................TGGTGTGACGGGCGTCG....................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................TGGACTCTGAGGAGACTGCCGA......................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................TCGGGGGTCTGGAGAGT..................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................ATGGTGTGACGGGCGGAG....................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................GATGGTGTGACGGGCAGAG....................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................CGCCCGTCACACCAT.......................................................... | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................AGACCCCCGACTCCAC............................................................................................................ | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - |