| (1) AGO1.ip OTHER.mut | (5) B-CELL | (3) BRAIN | (21) BREAST | (40) CELL-LINE | (9) CERVIX | (2) FIBROBLAST | (3) HEART | (1) HELA | (5) LIVER | (1) OTHER | (34) SKIN | (1) UTERUS |
| CCCTGTTCTGTAAAATAGAGGTAATAATCCCAGTCCTGCTCACTGTGTAGATTTGTGAGGCCCAAATGAGAGAAAAAAGACTCGAGAAACCCTTGTGAACTAGAACGTGCAGAAAGCAAAGGGGTAAGACATCAGACTCTTCCCTAAACGTGCTCTCTGGGCACCCCTGAACTTGCTCATCCGGGTTCCCCCTCCCACAGCACTTTCTGCAGCTAGAGCTGATTAATGGGCGCTTGAGTGCCTCCTTGCT .............................................................................................((((.........((.((((.((((..((((.((((........)))))))).....)))).)))).))......(((((((......))))))).......))))................................................... .........................................................................................90............................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR330875(SRX091713) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR040042(GSM532927) G428N. (cervix) | SRR189782 | SRR037932(GSM510470) 293cand4_rep1. (cell line) | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR444055(SRX128903) Sample 27_2cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR040043(GSM532928) G428T. (cervix) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR189784 | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR444052(SRX128900) Sample 12cDNABarcode: AF-PP-340: ACG CTC TTC . (skin) | SRR444046(SRX128894) Sample 7cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC C. (skin) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR444062(SRX128910) Sample 27_3cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM532880(GSM532880) G659T. (cervix) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR191449(GSM715559) 144genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR037876(GSM522374) fibroblasts_cell_culture. (fibroblast) | SRR060982(GSM569186) Human centrocyte [09-001]. (cell line) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191551(GSM715661) 32genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR033732(GSM497077) bjab cell line (bjab103). (B cell) | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR444047(SRX128895) Sample 27_1cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR444061(SRX128909) Sample 19cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (skin) | SRR330904(SRX091742) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR343334 | SRR330906(SRX091744) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR444053(SRX128901) Sample 13cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (skin) | SRR343335 | SRR330867(SRX091705) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR330879(SRX091717) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | SRR040028(GSM532913) G026N. (cervix) | SRR191607(GSM715717) 192genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR444059(SRX128907) Sample 17cDNABarcode: AF-PP-339: ACG CTC TTC . (skin) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR343333(GSM796036) KSHV (HHV8). (cell line) | SRR191467(GSM715577) 115genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR039617(GSM531980) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 1. (liver) | SRR189785 | SRR444048(SRX128896) Sample 8cDNABarcode: AF-PP-333: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191450(GSM715560) 145genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR191617(GSM715727) 104genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR040014(GSM532899) G623N. (cervix) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR039635(GSM518472) THP1_nuc_sRNAs. (cell line) | SRR040006(GSM532891) G601N. (cervix) | SRR191595(GSM715705) 72genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR038857(GSM458540) D20. (cell line) | SRR039613(GSM531976) Human Normal Liver Tissue Sample 3. (liver) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell) | SRR060986(GSM569190) Human memory B cell [09-001]. (cell line) | SRR040024(GSM532909) G613N. (cervix) | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR191497(GSM715607) 17genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR326281(GSM769511) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, c. (cell line) | SRR039624(GSM531987) HBV(-) HCV(-) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | GSM532872(GSM532872) G652T. (cervix) | SRR444068(SRX128916) Sample 25cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (cell line) | GSM532876(GSM532876) G547T. (cervix) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR444057(SRX128905) Sample 15cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC . (skin) | SRR444056(SRX128904) Sample 28cDNABarcode: AF-PP-333: ACG CTC TTC . (skin) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330857(SRX091695) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR191447(GSM715557) 142genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR444065(SRX128913) Sample 22cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (cell line) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330864(SRX091702) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191406(GSM715516) 67genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR444069(SRX128917) Sample 26cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC . (skin) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR207114(GSM721076) "IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown". (ago1/2 RRP40 cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191505(GSM715615) 139genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR363673(GSM830250) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR191571(GSM715681) 63genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR330865(SRX091703) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR444043(SRX128891) Sample 4cDNABarcode: AF-PP-339: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCA...................................................... | 17 | 3 | 15.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.33 | 0.33 | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.67 | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCC...................................................... | 17 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCC...................................................... | 18 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................CATCCGGGTTCCCCCTCCA...................................................... | 19 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................TCATCCGGGTTCCCCCTCCA...................................................... | 20 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................TGTGAACTAGAACGTGCAGAAAGCAAAG................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCATT.................................................... | 19 | 3 | 2.00 | 1.33 | 0.33 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCT...................................................... | 18 | 1 | 2.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCAAA.................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................GTGAACTAGAACGTGCAGAAAGCA.................................................................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTTCA...................................................... | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCATTT................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 7.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................CCGGGTTCCCCCTCCA...................................................... | 16 | 6 | 2.00 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | 0.17 | 0.17 | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCAA...................................................... | 18 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCC....................................................... | 16 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCAAAA.................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTGCA...................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................AGAGGTAATAATCCCCGC........................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCAA..................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................AGCAAAGGGGTAAGACATCA.................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................CATCCGGGTTCCCCCTCTTT..................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCAAAA................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................AGAAAAAAGACTCGAGAAAC................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................CCCCTCCCACAGCACGACC........................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCAAG.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................GCACCCCTGAACTTGCTCAT...................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCAT..................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCCA..................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCTTC.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................TCTGGGCACCCCTGAACTTTGG......................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................AAGACTCGAGAAACCCTTGTGAACTAGAACG............................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTACA...................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCT....................................................... | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCAATT................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCACT.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCAT..................................................... | 18 | 3 | 1.00 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................ATCCGGGTTCCCCCTCCATG.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TGAACTAGAACGTGCAGAA........................................................................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................ACAGCACTTTCTGCAGC..................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCTA...................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCATC.................................................... | 19 | 3 | 0.67 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCAAA.................................................... | 19 | 3 | 0.67 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCAAT.................................................... | 19 | 3 | 0.67 | 1.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................CCGGGTTCCCCCTCC....................................................... | 15 | 6 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCTAT.................................................... | 19 | 3 | 0.33 | 1.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCAGA.................................................... | 19 | 3 | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCATA.................................................... | 19 | 3 | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TCCGGGTTCCCCCTCCATTT................................................... | 20 | 3 | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........GTAAAATAGAGGTAATAAT.............................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 |
| CCCTGTTCTGTAAAATAGAGGTAATAATCCCAGTCCTGCTCACTGTGTAGATTTGTGAGGCCCAAATGAGAGAAAAAAGACTCGAGAAACCCTTGTGAACTAGAACGTGCAGAAAGCAAAGGGGTAAGACATCAGACTCTTCCCTAAACGTGCTCTCTGGGCACCCCTGAACTTGCTCATCCGGGTTCCCCCTCCCACAGCACTTTCTGCAGCTAGAGCTGATTAATGGGCGCTTGAGTGCCTCCTTGCT .............................................................................................((((.........((.((((.((((..((((.((((........)))))))).....)))).)))).))......(((((((......))))))).......))))................................................... .........................................................................................90............................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR330875(SRX091713) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR040042(GSM532927) G428N. (cervix) | SRR189782 | SRR037932(GSM510470) 293cand4_rep1. (cell line) | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR444055(SRX128903) Sample 27_2cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR040043(GSM532928) G428T. (cervix) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR189784 | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR444052(SRX128900) Sample 12cDNABarcode: AF-PP-340: ACG CTC TTC . (skin) | SRR444046(SRX128894) Sample 7cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC C. (skin) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR444062(SRX128910) Sample 27_3cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM532880(GSM532880) G659T. (cervix) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR191449(GSM715559) 144genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR037876(GSM522374) fibroblasts_cell_culture. (fibroblast) | SRR060982(GSM569186) Human centrocyte [09-001]. (cell line) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191551(GSM715661) 32genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR033732(GSM497077) bjab cell line (bjab103). (B cell) | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR444047(SRX128895) Sample 27_1cDNABarcode: AF-PP-343: ACG CTC TT. (skin) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR444061(SRX128909) Sample 19cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (skin) | SRR330904(SRX091742) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR343334 | SRR330906(SRX091744) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR444053(SRX128901) Sample 13cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (skin) | SRR343335 | SRR330867(SRX091705) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR330879(SRX091717) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | SRR040028(GSM532913) G026N. (cervix) | SRR191607(GSM715717) 192genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR444059(SRX128907) Sample 17cDNABarcode: AF-PP-339: ACG CTC TTC . (skin) | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR343333(GSM796036) KSHV (HHV8). (cell line) | SRR191467(GSM715577) 115genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR039617(GSM531980) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 1. (liver) | SRR189785 | SRR444048(SRX128896) Sample 8cDNABarcode: AF-PP-333: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191450(GSM715560) 145genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR191617(GSM715727) 104genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR040014(GSM532899) G623N. (cervix) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR039635(GSM518472) THP1_nuc_sRNAs. (cell line) | SRR040006(GSM532891) G601N. (cervix) | SRR191595(GSM715705) 72genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR038857(GSM458540) D20. (cell line) | SRR039613(GSM531976) Human Normal Liver Tissue Sample 3. (liver) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell) | SRR060986(GSM569190) Human memory B cell [09-001]. (cell line) | SRR040024(GSM532909) G613N. (cervix) | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR191497(GSM715607) 17genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR326281(GSM769511) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, c. (cell line) | SRR039624(GSM531987) HBV(-) HCV(-) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | GSM532872(GSM532872) G652T. (cervix) | SRR444068(SRX128916) Sample 25cDNABarcode: AF-PP-341: ACG CTC TTC . (cell line) | GSM532876(GSM532876) G547T. (cervix) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR444057(SRX128905) Sample 15cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC . (skin) | SRR444056(SRX128904) Sample 28cDNABarcode: AF-PP-333: ACG CTC TTC . (skin) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330857(SRX091695) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR191447(GSM715557) 142genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR444065(SRX128913) Sample 22cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (cell line) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330864(SRX091702) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR444049(SRX128897) Sample 9cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC C. (skin) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191406(GSM715516) 67genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR444069(SRX128917) Sample 26cDNABarcode: AF-PP-342: ACG CTC TTC . (skin) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR207114(GSM721076) "IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown". (ago1/2 RRP40 cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191505(GSM715615) 139genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR363673(GSM830250) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR191571(GSM715681) 63genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR330865(SRX091703) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR444043(SRX128891) Sample 4cDNABarcode: AF-PP-339: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ......................................................................................AAACCCTTGTGAACTGT................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................................CCCTCCCACAGCACTTG............................................ | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .................................................................AGTCTTTTTTCTCTCAT........................................................................................................................................................................ | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |