| (1) AGO1.ip | (1) AGO1.ip OTHER.mut | (4) B-CELL | (1) BRAIN | (7) BREAST | (30) CELL-LINE | (7) CERVIX | (2) HEART | (2) HELA | (1) KIDNEY | (8) LIVER | (1) OTHER | (1) RRP40.ip | (1) SKIN | (4) UTERUS |
| CCAATGACAAAAAAGTAGTTGGCTGCCTAATTGCGGAACATATCCAATGGGTAAGTGATAAAAGAGTGTTCTTAAGTAATTTGGTGTTTAATGAGTTTACAACGTAATCCCAAATAACATAAATCCTGATAAATTTGTCTCCATTTCATGTAAAGATCAGTTTTAATGCAAGAATTCCCATGTGTGAGTCTTCACCATAGTGGAATAATGGTTATGCATGGGAATTAGTTTCTCAAGTCAGTAAGATAAA ...................................................((((.((((......)))))))).((.((((((..((...((......))....))..)))))).)).................................................................................................................................... ..................................................51.....................................................................122.............................................................................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR094129(GSM651905) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR037932(GSM510470) 293cand4_rep1. (cell line) | SRR094132(GSM651908) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR040042(GSM532927) G428N. (cervix) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR040043(GSM532928) G428T. (cervix) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR189785 | SRR189784 | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR189782 | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR343334 | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039618(GSM531981) HBV(+) Side Tissue Sample 1. (liver) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | GSM532878(GSM532878) G691T. (cervix) | SRR107297(GSM677704) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR040029(GSM532914) G026T. (cervix) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR189787 | SRR040021(GSM532906) G761T_2. (cervix) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR060984(GSM569188) Human plasma cell [09-001]. (cell line) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR015364(GSM380329) Plasma B cells (PC44). (B cell) | SRR444048(SRX128896) Sample 8cDNABarcode: AF-PP-333: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR191523(GSM715633) 107genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR207114(GSM721076) "IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown". (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | GSM450610(GSM450610) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039193(GSM494812) HL60 cell line is derived from acute promyelo. (cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR029132(GSM416761) MB-MDA231. (cell line) | SRR033728(GSM497073) MALT (MALT413). (B cell) | SRR040024(GSM532909) G613N. (cervix) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR033729(GSM497074) splenic MZL (Splenic414). (B cell) | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line) | SRR039624(GSM531987) HBV(-) HCV(-) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR040027(GSM532912) G220T. (cervix) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ..................................................GTAAGTGATAAAAGAGAAA..................................................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAATCG.................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAAC...................................................................................................................................... | 17 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .....................................................................................................................CATAAATCCTGATAACC.................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................CGGAACATATCCAATGG........................................................................................................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAATTCAT................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............AAGTAGTTGGCTGCCTTT............................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............AGTAGTTGGCTGCCTAATCGCG....................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAATTA.................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAAGCG.................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAGCA..................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........AAAAAGTAGTTGGCTGCCTAAT........................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAACGCA.................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAATGAAG................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAATGCAG................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAAAAA.................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAAGGA.................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................TAGTGGAATAATGGTTAGAG................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................AACGTAATCCCAAATGTAG................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................ATAGTGGAATAATGGTTATGCATGGGA........................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAA....................................................................................................................................... | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAAAGCT.................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................CAACGTAATCCCAAACGGA.................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......CAAAAAAGTAGTTGGCTGCCTAATTG......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AAAAAGTAGTTGGCTGCCTAATT.......................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| CCAATGACAAAAAAGTAGTTGGCTGCCTAATTGCGGAACATATCCAATGGGTAAGTGATAAAAGAGTGTTCTTAAGTAATTTGGTGTTTAATGAGTTTACAACGTAATCCCAAATAACATAAATCCTGATAAATTTGTCTCCATTTCATGTAAAGATCAGTTTTAATGCAAGAATTCCCATGTGTGAGTCTTCACCATAGTGGAATAATGGTTATGCATGGGAATTAGTTTCTCAAGTCAGTAAGATAAA ...................................................((((.((((......)))))))).((.((((((..((...((......))....))..)))))).)).................................................................................................................................... ..................................................51.....................................................................122.............................................................................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR094129(GSM651905) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR037932(GSM510470) 293cand4_rep1. (cell line) | SRR094132(GSM651908) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR040042(GSM532927) G428N. (cervix) | SRR094131(GSM651907) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR040043(GSM532928) G428T. (cervix) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR039619(GSM531982) HBV(+) HCC Tissue Sample 1. (liver) | SRR189785 | SRR189784 | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR029127(GSM416756) A549. (cell line) | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | SRR029124(GSM416753) HeLa. (hela) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR189782 | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR037939(GSM510477) 293cand5_rep1. (cell line) | SRR343334 | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039618(GSM531981) HBV(+) Side Tissue Sample 1. (liver) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | GSM532878(GSM532878) G691T. (cervix) | SRR107297(GSM677704) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR040029(GSM532914) G026T. (cervix) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR189787 | SRR040021(GSM532906) G761T_2. (cervix) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR060984(GSM569188) Human plasma cell [09-001]. (cell line) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR015364(GSM380329) Plasma B cells (PC44). (B cell) | SRR444048(SRX128896) Sample 8cDNABarcode: AF-PP-333: ACG CTC TTC C. (skin) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR191523(GSM715633) 107genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR207114(GSM721076) "IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown". (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | GSM450610(GSM450610) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039193(GSM494812) HL60 cell line is derived from acute promyelo. (cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | SRR029132(GSM416761) MB-MDA231. (cell line) | SRR033728(GSM497073) MALT (MALT413). (B cell) | SRR040024(GSM532909) G613N. (cervix) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR033729(GSM497074) splenic MZL (Splenic414). (B cell) | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line) | SRR039624(GSM531987) HBV(-) HCV(-) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR040027(GSM532912) G220T. (cervix) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................TTTGGTGTTTAATGAGG.......................................................................................................................................................... | 17 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................TGCAAGAATTCCCATGGAA................................................................. | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................CATATCCAATGGGTAGGAG................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................GGAATTAGTTTCTCAAAAG........... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................TGCAAGAATTCCCATGGAT................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................TGCAAGAATTCCCATAAC.................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................TGCAAGAATTCCCATGGA.................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................ACAACGTAATCCCAAACC...................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................TGATAAAAGAGTGTTACTA................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |