| (2) AGO2.ip | (2) B-CELL | (5) BRAIN | (3) BREAST | (18) CELL-LINE | (4) CERVIX | (1) HEART | (2) LIVER | (2) OTHER | (11) SKIN |
| TTTCCTCACTCTTTTCATCAAAGATATTATCTCCTGGTCCTGAAATAGTAGTGAGTGAAGCATTGTTATTACATAGCTACCATTTATTAGTGCTTATTAGGAGCTGGATCTTATGTTTTTTATTTTATTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTATCACCTAGGCTGGAATGCAGTGGTGCCATCTCGGCTGACTGCAGCCTCCGACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGCA ..................................................(((((((.(((..(((....)))..)))..)))))))....((((.....))))...((((((........................))))))........................................................................................................... ..................................................51...........................................................................................144........................................................................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR330921(SRX091759) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR189784 | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR189782 | SRR390723(GSM850202) total small RNA. (cell line) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | GSM532877(GSM532877) G691N. (cervix) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR040010(GSM532895) G529N. (cervix) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | GSM532883(GSM532883) G871N. (cervix) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330910(SRX091748) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR039612(GSM531975) Human Normal Liver Tissue Sample 2. (liver) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM956925Ago2D5(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | DRR000559(DRX000317) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330894(SRX091732) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR033728(GSM497073) MALT (MALT413). (B cell) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | GSM532872(GSM532872) G652T. (cervix) |
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| ..............................................................................................................TTATGTTTTTTATTTTATGGT....................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..........................................................................................................................................................................................................................CAAGTGATTCTCCTGCCTAAAA.......... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGGGC. | 30 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................GGCTGGAATGCAGTGGTGCCATCTCGG........................................................... | 27 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................TTTTTTATTTTATTTTATTTTTCAG.............................................................................................................. | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................TGAGTGAAGCATTGTAGTT.................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TTTCCTCACTCTTTTCATCAAAGATATTATCTCCTGGTCCTGAAATAGTAGTGAGTGAAGCATTGTTATTACATAGCTACCATTTATTAGTGCTTATTAGGAGCTGGATCTTATGTTTTTTATTTTATTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTATCACCTAGGCTGGAATGCAGTGGTGCCATCTCGGCTGACTGCAGCCTCCGACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGCA ..................................................(((((((.(((..(((....)))..)))..)))))))....((((.....))))...((((((........................))))))........................................................................................................... ..................................................51...........................................................................................144........................................................................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR330921(SRX091759) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR189784 | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR189782 | SRR390723(GSM850202) total small RNA. (cell line) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | GSM532877(GSM532877) G691N. (cervix) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR040010(GSM532895) G529N. (cervix) | SRR039625(GSM531988) HBV(-) HCV(-) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | GSM532883(GSM532883) G871N. (cervix) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330910(SRX091748) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR039612(GSM531975) Human Normal Liver Tissue Sample 2. (liver) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM956925Ago2D5(GSM956925) "cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip. (ago2 cell line) | DRR000559(DRX000317) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | SRR037940(GSM510478) 293cand5_rep2. (cell line) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330894(SRX091732) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR033728(GSM497073) MALT (MALT413). (B cell) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | GSM532872(GSM532872) G652T. (cervix) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ................................................................................................................................................GAGTCTCGTTCTATCTGG........................................................................................ | 18 | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................TTATTTTTTGAGATGGAGTCG.................................................................................................... | 21 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................TTTTGAGATGGAGTCTCGTTCA.............................................................................................. | 22 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGCGTGG | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGCCC | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGCCTCAGCCTCCAGCACG | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTGGAGGCTGAGGCAGGAG | 23 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................TTCTCCTGCCTCAGCCTCCAACGG. | 24 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................TTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGAGGG | 27 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................CAGCCTCCGACTCCCAGGTAA............................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................GCAGCCTCCGACTCCCAGGTTTG.............................. | 23 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGCGT | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................CCTCCGACTCCCAGGTTCAGTGC.......................... | 23 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTGCCTCAGCCTCCAGT... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCAGCCTCCAGAGCTAG | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................CCTCCGACTCCCAGGTTCAAGTTCGC....................... | 26 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................CTATTTCAGGACCAGGAG.......................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGCCTCAGCCTCCAGCGTT | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................CCCAGGTTCAAGTGATTCTCCCTT................ | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................TGGAGTCTCGTTCTATCAAA........................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................TTTTTGAGATGGAGTCTCGTTCTATGAAC........................................................................................ | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................CCCAGGTTCAAGTGATTCTCTAA................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................TTCTCCTGCCTCAGCCTCCAAGGG. | 24 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................TTTATTTTTTGAGATGGAGTCAAG.................................................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................CCTCCGACTCCCAGGTTCAAGTAT......................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................CCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTCGAA.............. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................CCGACTCCCAGGTTCAAGTGAT........................ | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |