| (2) B-CELL | (2) BRAIN | (16) BREAST | (11) CELL-LINE | (2) CERVIX | (2) HEART | (1) HELA | (1) KIDNEY | (3) LIVER | (2) OTHER | (1) RRP40.ip | (4) SKIN | (1) UTERUS |
| CTTCATGTCCCAAGAGCAAGGGGTGCCCATTTCTGAAGTGGCCGAGTCAGGTAGGTGCCACTTTGCTGTCTGGGGCCTGAGGGGAAGGAGAGTCAGAGAACACACTTCTCTCTTGCTGAAAGGCATGAGTCCCAGAAGATGGGCAATATGATTTATTTATGGGTAGTAGGTTTTAATTTTAGCATCTGGGGCAGCGCTTAGCACAAAGCAGGGCTTCCATGGATGGATGAATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTAGATGGATGGATGGATGGATGAATGGTATGCTTCCCAGGCCTGGAAAGAGAAGAACAGTGGATGGAATCACCCTTTCCTCTTAAAGTGTGTGCACAGGTACACACACACACAGTGCTTAGAGAGACGCCTCTTCCCCAAGGGCAGCACACGCCCTGGAGCCTCCCTGACTGTGCTGTGTACCTGGCAGGTCCTGGGCTGGCCTTCATCGCCTTCCCCAAGGCTGTGACTATGATGCCC ..........................................................................................................................................................((((((..((.((..((((..((((...((((((...((..(((..((.....))..))).(((((..((......))..)))))................................................................................))..))))))...))))....))))..))..))..)))))).......................................................................................................................................................................................................................................... ..........................................................................................................................................................155............................................................................................................................................................................................................362...................................................................................................................................................................................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189782 | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR390724(GSM850203) small rna immunoprecipitated. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577588(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330890(SRX091728) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330864(SRX091702) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR040022(GSM532907) G575N. (cervix) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR191585(GSM715695) 196genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040035(GSM532920) G001T. (cervix) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR189785 | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGATGGATGGATGGATGGCCGT............................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 26.00 | 0.00 | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATGGATGGATGGATGGATGGCAA................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 26.00 | 0.00 | - | 26.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGATGGATGGATGGATGGATGGAA.................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 25.00 | 0.00 | - | - | - | 25.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATTGAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 35 | 23.00 | 0.00 | - | - | 23.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGTTA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 36 | 0 | 12.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 34 | 0 | 7.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TGGGTAGTAGGTTTTATAGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 6.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 34 | 6.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGAGGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 34 | 4.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATTGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 34 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAACAGTGGATGGAATCA........................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGTATA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 36 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATATT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 34 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGTTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 36 | 0 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGGATGGATGGATGGAT.......................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGTTTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 36 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGATGGATGGATGCATA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGCTAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAATCACCCTTTCCTCTTGG.......................................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 33 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................ATGGGTAGTAGGTTTTATATC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGTGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 35 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 37 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATCGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 34 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................TGGGTAGTAGGTTTTATGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................GTCCCAGAAGATGGGCAATATGATTTATTTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATTGGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 35 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................TGGGTAGTAGGTTTTGTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................TGGGTAGTAGGTTTTGTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATTGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 34 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGCTA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 36 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................GGTGCCCATTTCTGAAGTGGCC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGGATGGATGGATGGAAAAA....................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................ATGAGTCCCAGAAGATT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATTT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGTATA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGCCTCCCTGACTGTACC............................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGGAAAGAGAAGAACTC.................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGATGGAATCACCCTTTTAT............................................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACAGTGCTTAGAGAGCAG............................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................CAGAAGATGGGCAATATGATT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGATGAATGGTAGAAA.............................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................TGAAGTGGCCGAGTCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................GCTGTCTGGGGCCTGGGTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATGGATGGGTAGAAAAA....................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................................GAATGGATGGATGGAAGGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................GTAGTAGGTTTTAATAGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCACAGGTACACACACACACA.............................................................................................................................. | 22 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TGGGTAGTAGGTTTTATAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCTGGAAAGAGAAGAACAGTGGATA.............................................................................................................................................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................AATGGATGGATGGATGGATGGATGGGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................GATGAATGGATGGATGGATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................TGAAGTGGCCGAGTCTAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACAGGTACACACACACACAG............................................................................................................................. | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGTCCTGGGCTGGC..................................... | 16 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGTCCTGGGCTGGCC.................................... | 16 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................CATGGATGGATGAATGGATGGATGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 |
| CTTCATGTCCCAAGAGCAAGGGGTGCCCATTTCTGAAGTGGCCGAGTCAGGTAGGTGCCACTTTGCTGTCTGGGGCCTGAGGGGAAGGAGAGTCAGAGAACACACTTCTCTCTTGCTGAAAGGCATGAGTCCCAGAAGATGGGCAATATGATTTATTTATGGGTAGTAGGTTTTAATTTTAGCATCTGGGGCAGCGCTTAGCACAAAGCAGGGCTTCCATGGATGGATGAATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTAGATGGATGGATGGATGGATGAATGGTATGCTTCCCAGGCCTGGAAAGAGAAGAACAGTGGATGGAATCACCCTTTCCTCTTAAAGTGTGTGCACAGGTACACACACACACAGTGCTTAGAGAGACGCCTCTTCCCCAAGGGCAGCACACGCCCTGGAGCCTCCCTGACTGTGCTGTGTACCTGGCAGGTCCTGGGCTGGCCTTCATCGCCTTCCCCAAGGCTGTGACTATGATGCCC ..........................................................................................................................................................((((((..((.((..((((..((((...((((((...((..(((..((.....))..))).(((((..((......))..)))))................................................................................))..))))))...))))....))))..))..))..)))))).......................................................................................................................................................................................................................................... ..........................................................................................................................................................155............................................................................................................................................................................................................362...................................................................................................................................................................................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | TAX577739(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577453(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189782 | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | TAX577579(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR390724(GSM850203) small rna immunoprecipitated. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577588(Rovira) total RNA. (breast) | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330890(SRX091728) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330864(SRX091702) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR040022(GSM532907) G575N. (cervix) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR191585(GSM715695) 196genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | SRR015360(GSM380325) Plasma B cells (PC137). (B cell) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040035(GSM532920) G001T. (cervix) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR189785 | DRR001488(DRX001042) "Hela short nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTACACAGCACAGTCAGGGAGGC........................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................GAATGGATGGATGGATGGATGGATGGACTTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCATCGCCTTCCCCAAAAG................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGGCTGGCCTTCACAG............................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................GCCGAGTCAGGTAGGGTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAGGTACACACACACATG.............................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................................................................................................ATGGATGGATGAATGGATGGATGGATGTTCC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCACCCTTTCCTCTTAAAAA....................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTGA............................................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................AACACACTTCTCTCTTGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................CCTCAGGCCCCAGACAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................TTCTGGGACTCATGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 8 | 0.12 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |