| (2) AGO2.ip | (4) B-CELL | (2) BRAIN | (2) BREAST | (16) CELL-LINE | (1) HEART | (1) HELA | (4) LIVER | (2) OTHER | (11) SKIN | (1) UTERUS | (1) XRN.ip |
| GAGCCCAGTGACCTAGAGGCTTCCTTCTAAACTGGACTGTTAGTAGGGAATCTGGTTGATATGAGTTTGGGGCCTAGAGAATACTTTTATACTTTTTTTTTTCTTTAAACATTAGTCAACTGTAGTAGTAAGGAGGAGAGAAAGATTAGAACAAGGAGTTTAAGCACTTAAAAAATCCCAACTCTATCCTTTCTCTGCAGCACCCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACA ....................................................................................(((((..((((((((((((((((.....(((....)))......))))))))))))))))..)))))................................................................................................... ...................................................................................84.........................................................................159......................................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR189784 | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR189782 | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330865(SRX091703) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039621(GSM531984) HBV(+) HCC Tissue Sample 2. (liver) | SRR060983(GSM569187) Human pre-germinal center B cell [09-001]. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330888(SRX091726) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR094132(GSM651908) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR330899(SRX091737) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR033715(GSM497060) Mantle Cell Lymphoma (Mino122). (B cell) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | DRR001487(DRX001041) "Hela long nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR330879(SRX091717) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) |
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| ........................................................................................................................................AGAGAAAGATTAGAACAAGGA............................................................................................. | 21 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................................................................................................................GAGAGAAAGATTAGAACAAGGA............................................................................................. | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................TTATACTTTTTTTTTTCTTTAACTG........................................................................................................................................... | 25 | 2.00 | 0.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................ATACTTTTATACTTTTCTG....................................................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................TACTTTTTTTTTTCTTTAATTG........................................................................................................................................... | 22 | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................................GGATTCTCAGAGTCTGGCATGAC. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................ATACTTTTATACTTTTTTTTTTCTTTAAAAAC.......................................................................................................................................... | 32 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTCGC.............................................................................................................................................. | 20 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ......................................................................................TTATACTTTTTTTTTTCTTTAACTA........................................................................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................................ACATGTGTGGATTCTGGG...................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........ACCTAGAGGCTTCCTTCTAAACTGG....................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................ACTTTTTTTTTTCTTTAAACTCAT........................................................................................................................................ | 24 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .....................................................................................................................................AGGAGAGAAAGATTAGATCA................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTCG............................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ......................................................................................TTATACTTTTTTTTTTCTTAG............................................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .........................................................................................TACTTTTTTTTTTCTTTAAACATG......................................................................................................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTCAGG............................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTGGAG............................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................TTTTATACTTTTTTTCTTG................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTTCTTTAAC............................................................................................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..........................................................................................ACTTTTTTTTTTCTTTATCAG........................................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTCGGG............................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................TACTTTTATACTTTTTTTTTTATAG................................................................................................................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................TATACTTTTTTTTTTCTTTTCG............................................................................................................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTTACTG................................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................ATACTTTTATACTTTTTTTTTTTTG................................................................................................................................................. | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTTAATT................................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................ACTTTTTTTTTTCTTTAACTTG.......................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................TACTTTTTTTTTTCTTTAAACAAG......................................................................................................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................CTTTTATACTTTTTTTCGTG................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTTCTTTAACCAA.......................................................................................................................................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................CTTTTTTTTTTCTTTAAACCTAG........................................................................................................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................TACTTTTTTTTTTCTTTAAGAG........................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTATTG................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................ATATGAGTTTGGGGCCTAGAGAA......................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................TATACTTTTTTTTTTCTTTTCTG............................................................................................................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................TCTAAACTGGACTGTTAGTAGGGAAT....................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TACTTTTTTTTTTCTTTATTG............................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTAACG............................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................TAAACATTAGTCAACTTCCG............................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTTAAACATTAT....................................................................................................................................... | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTTATAG............................................................................................................................................ | 22 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................AAGGAGGAGAGAAAGATTAGAACAAGGA............................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................TATACTTTTTTTTTTCTTTTGGG............................................................................................................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTTAAACATTAG....................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTCTCAGAGTCTGGCA..... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................ACTTTTTTTTTTCTTTAATTTG.......................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................AGGCTTCCTTCTAAACTGGACTG................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTTTAG.............................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTGGC............................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................TATACTTTTTTTTTTCTTTAAT............................................................................................................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................ATACTTTTTTTTTTCTGGCC.............................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................TACTTTTTTTTTTCTTTAAACAATAG....................................................................................................................................... | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................CTTTTATACTTTTTTTTTTAAT................................................................................................................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................CTTTTATACTTTTTTTTTTTCT................................................................................................................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................AGGAGAGAAAGATTAGAACAAGGA............................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................TTATACTTTTTTTTTTCTTTAATAG........................................................................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTTCTTTTCA............................................................................................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................TTTTATACTTTTTTTTTTCTTTTCA............................................................................................................................................. | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................TATACTTTTTTTTTTCCTAG............................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTTCTTTTAAC............................................................................................................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................AGGAGAGAAAGATTAGAACAAGG.............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GATTCTCAGAGTCTGGCA..... | 18 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TTTATACTTTTTTTTTTCTTAACT............................................................................................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................TTATACTTTTTTTTTTCCG................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................TTTTATACTTTTTTTTTTCTTTTTTG............................................................................................................................................ | 26 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................ATACTTTTATACTTTTTTTTTTCTTTAAACATTAG....................................................................................................................................... | 35 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................ACATGTGTGGATTCTGGGA..................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................ACTTTTTTTTTTCTTTAACA............................................................................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................GAGAGAAAGATTAGAACAAGGAA............................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TTTTTTCTTTAAACATTAGTCAACTGTAGTAGTAAGGAGGAGAGAAAGATTAGAACAAGGAGTTTAAGCAC................................................................................... | 71 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GATTCTCAGAGTCTGGCATG... | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGAGTCTGGCATGA.. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................GTGTGGATTCTGGGATT................... | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 |
| GAGCCCAGTGACCTAGAGGCTTCCTTCTAAACTGGACTGTTAGTAGGGAATCTGGTTGATATGAGTTTGGGGCCTAGAGAATACTTTTATACTTTTTTTTTTCTTTAAACATTAGTCAACTGTAGTAGTAAGGAGGAGAGAAAGATTAGAACAAGGAGTTTAAGCACTTAAAAAATCCCAACTCTATCCTTTCTCTGCAGCACCCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACA ....................................................................................(((((..((((((((((((((((.....(((....)))......))))))))))))))))..)))))................................................................................................... ...................................................................................84.........................................................................159......................................................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR189784 | SRR039620(GSM531983) HBV(+) Adjacent Tissue Sample 2. (liver) | SRR189782 | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330865(SRX091703) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039621(GSM531984) HBV(+) HCC Tissue Sample 2. (liver) | SRR060983(GSM569187) Human pre-germinal center B cell [09-001]. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR330908(SRX091746) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330888(SRX091726) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR094132(GSM651908) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR330899(SRX091737) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR033715(GSM497060) Mantle Cell Lymphoma (Mino122). (B cell) | SRR330901(SRX091739) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | TAX577589(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | DRR001487(DRX001041) "Hela long nuclear cell fraction, LNA(+)". (hela) | SRR330879(SRX091717) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330870(SRX091708) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) |
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| .......................................................................................................................................................................TTAAAAAATCCCAACCC.................................................................. | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................TTAAAAAATCCCAACCA.................................................................. | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................AAGGATAGAGTTGGGATT........................................................... | 18 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |