| (1) BRAIN | (1) BREAST | (10) CELL-LINE | (1) CERVIX | (1) HEART | (1) HELA | (1) LIVER | (2) OTHER |
| TTATTTTATATACACAATTACCCCCAAGATATCTCCACTTGGAAGTTTTGTTGTCAACTCAAGTCTAAAAGAGAATTTATCACAACAAACCTCCATCCCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTAATATGATAACTTTTTAAAAAAACAGACTAAAACATTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTGAGACAGGGAATTGCTCTGTCACGCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCGGCTCA ......................................................................................................................((((((.((((((....))))))))))))..(((((((((((.(((.................))).)))).)))))))..................................................... ..........................................................................................91...........................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189782 | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189784 | SRR314796(SRX084354) "Total RNA, fractionated (15-30nt)". (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR039613(GSM531976) Human Normal Liver Tissue Sample 3. (liver) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR040035(GSM532920) G001T. (cervix) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .................................................................................................CCATTATTATTATTATTATTATTATTATTAG.......................................................................................................................... | 31 | 5.00 | 0.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..................................................................................................CATTATTATTATTATTATTATTATAAC............................................................................................................................. | 27 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................CCATTATTATTATTATTATTATTACTTG............................................................................................................................. | 28 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................CATTATTATTATTATTATTATTATTATCTTG......................................................................................................................... | 31 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................CATTATTATTATTATTATTATTACTG.............................................................................................................................. | 26 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ..................................................................................................CATTATTATTATTATTATTATTATTATTCG.......................................................................................................................... | 30 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| ......................CCCAAGATATCTCCACTTT................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................CATTATTATTATTATTATTATCTTG............................................................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .........................................................................................................................................................................ACATTTTTCTTTTCTTTTACTG........................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
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| .................................................................................................................................................................................................................................AGTGCAGTGGTGCCATCTCGGCCCTC | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................CATTATTATTATTATTATTATTATCATG............................................................................................................................ | 28 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................CATCCCATTATTATTATTATTTTTG.................................................................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................TTTTCTTTTCTTTTTTCGGTG........................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................ATCCCATTATTATTATTATT........................................................................................................................................ | 20 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................TTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTGAG...................................................... | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TTATTTTATATACACAATTACCCCCAAGATATCTCCACTTGGAAGTTTTGTTGTCAACTCAAGTCTAAAAGAGAATTTATCACAACAAACCTCCATCCCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTAATATGATAACTTTTTAAAAAAACAGACTAAAACATTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTGAGACAGGGAATTGCTCTGTCACGCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCGGCTCA ......................................................................................................................((((((.((((((....))))))))))))..(((((((((((.(((.................))).)))).)))))))..................................................... ..........................................................................................91...........................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189782 | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189784 | SRR314796(SRX084354) "Total RNA, fractionated (15-30nt)". (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | SRR039613(GSM531976) Human Normal Liver Tissue Sample 3. (liver) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR040035(GSM532920) G001T. (cervix) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................................................................................................GCTGGAGTGCAGTGGTGCCAATC....... | 23 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................TATTATTATTGTAATAGGG.......................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................AGTGCAGTGGTGCCATCTCGGAT.. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | |
| ...................................................................................TGGGATGGAGGTTTGTT...................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GGGAATTGCTCTGTCCT.................................. | 17 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................ACTCAAGTCTAAAAGGTTG............................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................ACAAACCTCCATCCCAACAG.................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................ACAAACCTCCATCCCAACGG.................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................ACAAACCTCCATCCCAACTG.................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................ACAAACCTCCATCCCAGCTG.................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |