ID: dme-mir-961
chr2L:5641142-5641329 +
Display Libraries
(2)
1182-4H
(3)
2OME.ip
(6)
2OME_MUTANT.ip
(12)
AGO1.ip
(4)
AGO2.ip
(8)
AGO2.mut
(2)
AGO3.ip
(2)
ARMI.mut
(1)
AUB.ip
(12)
BODY
(2)
CME L1
(1)
CMEW1 Cl.8+ cell
(11)
DCR2.mut
(3)
DISC
(8)
EMBRYO
(1)
G2
(33)
HEAD
(1)
KC
(2)
LARVAE
(4)
LOQS.mut
(7)
ML_CELL_LINE
(1)
OSC
(5)
OSS
(4)
OTHER.ip
(16)
OTHER.mut
(75)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(4)
PUPAE
(7)
R2D2.mut
(2)
S1
(14)
S2
(6)
S2_NP
(2)
S2_R
(1)
S3
(5)
TESTES
(142)
TOTAL_RNA.ip
(9)
WHOLE
(1)
WING
(2)
ZUC.mut
(2)
mbn2
Showing top 212 reads
CATGGTATCAAATCAGATTCACCTAATAGAATCCGTAGTGAGCTCGTTATCAAGGGCCGAGTTACCTTTGATCACCAGTAACTGAGATTGTTTCTGATACGGTTTCGTTTTCTGGCAATCAAAAGAACTTGGACTCGACTTGAATTCAACTACTTCGATGGGGCACTCAGGCTATAAGGTAGAGAAAT
..................................................................((((((..((((.(((.((((((((.......)))))))))))..))))..)))))).................................................................
.............................................................62.................................................................129.........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR060652:GSM548591 IP:total RNA hs-Penelope_testes_total SRR060645:GSM548584 IP:total RNA yw67c23(2)_testes_total V091: IP:total RNA fGS/OSS total   SRR060643:GSM548582 IP:total RNA A2_testes_total SRR060650:GSM548589 IP:total RNA A1_testes_total V093: IP:total RNA MUT:loqs loqs-KO, 40A; loqs-PB rescue/TM3  male total RNA V090:GSM609234 IP:total RNA CS  male total RNA   V092: IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2[G31R] male total RNA   V0632: IP:ago1 wt ovary AGO1-IP, reseq V138: IP:total RNA Male cold body SRR317113:GSM767597 IP:total RNA 5-6 days old flies.. V144: IP:total RNA OSC GSM280085:GSM280085 IP:total RNA WT testes (18-24nt) SRR298537:GSM744630 MUT:Vret ret Mutant.. V097:GSE24545 IP:total RNA CS ovary total RNA V083:GSM609223 IP:total RNA male, one day SRR014278:GSM327632 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_Har(male)_F1 SRR317117:GSM767601 IP:total RNA ld flies.. SRR298712:GSM744620 MUT:Bam n: Bam Mutant.. SRR298536:GSM744629 IP:total RNA erozygote.. V0652: IP:ago1 MUT:dcr2 dcr2 ovary, AGO1-IP, reseq SRR317112:GSM767596 IP:total RNA old flies.. SRR032095:GSM442735 IP:ago1 MUT:dcr2 AGO1 IP dcr2 knockdown SRR317116:GSM767600 IP:total RNA 5-6 days old flies.. V136: IP:total RNA Male aged body SRR351332:GSM811191 IP:total RNA Nibbler ygenotype: control wild type (w, 5905).. V0642: IP:ago1 MUT:ago2 ago2 ovary, AGO1-IP, reseq V063:GSM609230 IP:ago1 CS,ovary,AGO1IP SRR317114:GSM767598 IP:total RNA om 5-6 days old flies.. V012: IP:total RNA Dcr2 male (Katsutomo, whole fly?) V098:GSE24544 IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2[L811fsX] ovary total RNA V015: IP:total RNA DreRFHV148h SRR317110:GSM767594 IP:total RNA ays old flies.. S24:GSM399107 IP:total RNA male body #2 V0882:GSM628271 IP:total RNA MUT:r2d2 r2d2[1] ovary total RNA ¬† SRR060644:GSM548583 IP:total RNA A2_ovaries_total V0662: IP:ago1 MUT:r2d2 r2d2 ovary, AGO1-IP, reseq V0892:GSM628272 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNA SRR014275:GSM327624 IP:total RNA Ovary_rep1_LK_P SRR317111:GSM767595 IP:total RNA : from 5-6 days old flies.. S21:GSM399105 IP:total RNA disk #2 S5:GSM275691 IP:total RNA imaginal disc V142: IP:total RNA Oxidation_female_body GSM379061: IP:total RNA Squ Heterozygote GSM379063: IP:total RNA Vasa Heterozygote SRR351333:GSM811192 IP:total RNA MUT:Nibbler ygenotype: nbr[f02257].. SRR014274:GSM327633 IP:total RNA Ovary_rep1_LK(fem)_x_Har(male)_F1 SRR014276:GSM327634 IP:total RNA Ovary_rep1_NA(fem)_x_Har(male)_F1 V089:GSM609237 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNA V141: IP:total RNA Heat_female_body GSM379051: MUT:armi Armi Mutant SRR060653:GSM548592 IP:total RNA hs-Penelope_ ovaries_total GSM379066: MUT:Zuc Zuc Mutant V088:GSM609232 IP:total RNA MUT:r2d2 r2d2[1] ovary total RNA ¬† V082:GSM609238 IP:total RNA embryo 14-24hr SRR065801:GSM593298 IP:total RNA zuc_het(H-Y)_ovaries GSM379057: MUT:Krimp Krimp Mutant SRR317115:GSM767599 IP:total RNA old flies.. V065:GSM609236 IP:ago1 MUT:dcr2 dcr-2[L811fsX], ovary, AGO1IP SRR014281:GSM327631 IP:total RNA Ovary_rep1_wK(fem)_x_w1118(male)_F1 V140: IP:total RNA Dessication_female_body M065: MUT:CG1091 ovary - sample C, homozygous mutant SRR014282:GSM327621 IP:total RNA Ovary_rep1_wK_P SRR014280:GSM327620 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118_P V064:GSM609231 IP:ago1 MUT:ago2 ago2[414], ovary, AGO1IP V139: IP:total RNA Cold_female_body SRR065800:GSM593297 IP:total RNA zuc_H-Y_ovaries SRR031697:GSM466490 IP:total RNA Total small RNAs from dcr-2 heterozygous flies GSM379065: IP:total RNA Zuc Heterozygote GSM379056: IP:total RNA Krimp Heterozygote SRR014277:GSM327623 IP:total RNA Ovary_rep1_NA_P SRR060646:GSM548585 IP:total RNA yw67c23(2)_ovaries_total V078: IP:total RNA Desiccation, female head GSM379064: MUT:Vasa Vasa Mutant V066:GSM609233 IP:ago1 MUT:r2d2 r2d2[1], ovary, AGO1IP GSM379062: MUT:Squ Squ Mutant SRR014279:GSM327630 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_wK(male)_F1 GSM379060: IP:total RNA SpnE Heterozygote SRR029033:GSM430035 MUT:lacZ lacZ knockdown SRR298711:GSM744619 SETDB1 Mutant.. GSM379053: MUT:armi Aub Mutant V137: IP:total RNA Male aged head SRR029030:GSM430032 MUT:dcr2 dcr-2 knockdown SRR032152:GSM466489 IP:ago1 Ago1-associated small RNAs from Oregon R GSM379059: MUT:piwi Piwi Mutant GSM379067: MUT:SpnE SpnE Mutant SRR032094:GSM442734 MUT:ago2 ago2 knockdown SRR031698:GSM466491 IP:2Ome flies.. V079: IP:2'Ome in mutant Oxidation, female head GSM379050: IP:total RNA Armi Heterozygote SRR014273:GSM327622 IP:total RNA Ovary_rep1_Har_P GSM379055: MUT:Flam Flam Mutant V077: IP:total RNA cold, female head V084:GSM609224 IP:total RNA female, one day SRR032092:GSM442732 IP:total RNA mock oxidized GSM379054: IP:total RNA Flam Heterozygote SRR031699:GSM466492 IP:total RNA Total small RNAs from dcr-2 homozygous flies S3:GSM286602 IP:total RNA male body SRR031704:GSM466497 IP:2'Ome in mutant MUT:r2d2 ies.. GSM313161: IP:2Ome dcr-2 heterozygous, oxidized GSM379052: IP:total RNA Aub Heterozygote GSM467729: IP:total RNA Dmel_wt_sRNAseq V147: IP:total RNA 1182-4H cell GSM180335: IP:total RNA imaginal discs S28:GSM360262 IP:total RNA 0-2d pupae GSM379058: IP:total RNA Piwi Heterozygote V002:GSM609240 IP:total RNA IR+ SRR031692:GSM466487 IP:total RNA Total small RNAs from Oregon R V086: IP:total RNA female body, aged SRR031703:GSM466496 IP:total RNA MUT:r2d2 Total small RNAs from r2d2 homozygous flies V146: IP:total RNA S1 cell OSS2:GSM385744 IP:total RNA OSS_s2 V006: IP:total RNA r2d2 female: possibly heterozygous V001:GSM609239 IP:total RNA MUT:IR IR- S35:GSM609244 IP:total RNA KC+48 #2 SRR060647:GSM548586 IP:ago2 A2_ovaries_FLAG-Ago2 S9:GSM286604 IP:total RNA 0-1h #3 (7) OSS7:GSM385821 IP:total RNA OSS_s7 SRR060648:GSM548587 IP:aub A2_ovaries_FLAG-Aub V096: MUT:loqs loqsKO/f00791 ovary SRR031701:GSM466494 IP:total RNA Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies SRR029028:GSM430030 IP:total RNA untreated (mock) SRR001664:GSM278703 IP:total RNA MUT:dcr2 homozygous_dcr-2_untreated SRR097867:GSM666013 IP:total RNA Drosophila S2-NP cells GSM280082:GSM280082 IP:total RNA WT ovaries (18-29nt) SRR029633: IP:total RNA total small RNAs from hen1 homozygous flies V132: IP:total RNA ML-DmD32 SRR029032:GSM430034 MUT:r2d2 r2d2 knockdown OSS6:GSM385748 IP:total RNA OSS_s6 V036: IP:total RNA ML-DmD20c5 cell V007:GSM609247 IP:total RNA heat female head SRR097866:GSM666012 IP:total RNA Drosophila S2-NP cells SRR031696:GSM466489 IP:ago1 Ago1-associated small RNAs from Oregon R S8:GSM272651 IP:total RNA S2-48,+48, KC-48, +48 mix SRR065804:GSM593301 IP:piwi MUT:zuc Piwi-IP_zuc_H-Y_ovaries SRR010954:SRX002239 IP:2'Ome in mutant Aub trans-heterozygotes, oxidized V085: IP:total RNA CME W2 wing disc SRR010959:SRX002244 IP:ago3 Ago3 IP in heterozygotes SRR032096:GSM442736 IP:ago2 MUT:dcr2 AGO2 IP dcr2 knockdown S20:GSM322338 IP:total RNA 2-4day pupae#2 S27:GSM360260 IP:total RNA 0-1d Pupae (w) GSM280083:GSM280083 MUT:dcr2 dcr-2-/- ovaries (18-29nt) V148: IP:total RNA mbn2 S23:GSM399106 IP:total RNA female body #2 V073: IP:total RNA mbn2 S22:GSM322533 IP:total RNA female head #1 SRR341116:GSM786605 IP:Luciferase MUT:Oxidized pe: Schneider 2 (S2) cellsoxidation.. SRR029608: IP:total RNA total small RNAs from hen1 heterozygous flies S19:GSM322219 IP:total RNA 2-4day pupae #1 SRR341115:GSM786604 IP:Nibbler MUT:Unoxidized Schneider 2 (S2) cellsoxidation.. SRR001345:GSM278708 IP:total RNA MUT:ago2 ago2_non-beta-eliminated S18:GSM322208 IP:total RNA 3rd inster #2 V022: IP:total RNA ML-DmD32 cell V026:GSM609221 IP:total RNA 1182-4H cell SRR060651:GSM548590 IP:ago3 A2_ovaries_Ago3 SRR010958:SRX002243 IP:piwi Piwi IP in Ago3 trans-heterozygotes SRR341118:GSM786607 IP:Luciferase MUT:Unoxidized pe: Schneider 2 (S2) cellsoxidation.. SRR097865:GSM666011 IP:total RNA Drosophila S2-NP cells SRR341117:GSM786606 IP:Nibbler MUT:Oxidized Schneider 2 (S2) cellsoxidation.. V128: IP:total RNA S3 OSS8:GSM385822 IP:total RNA OSS_s8 SRR029031:GSM430033 MUT:loqs loqs-ORF knockdown V080: IP:total RNA Starvation, female head GSM467731: MUT:loqs Dmel_loq_sRNAseq GSM280088:GSM280088 IP:ago1 S2cell (AGO1IP) SRR014268:GSM327627 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_HAR_0_2hr_Emb SRR060649:GSM548588 IP:piwi A2_ovaries_FLAG-Piwi SRR010953:SRX002238 IP:total RNA Aub heterozygotes, oxidized V081:GSM609229 IP:total RNA embryo 2-6hr SRR001347:GSM278704 IP:total RNA MUT:ago2 ago2_untreated SRR001349:GSM278705 IP:total RNA heterozygous_dcr-2_untreated V023: IP:total RNA Dcr2 female head SRR065152:GSM577959 IP:piwi .. V032: IP:total RNA S1 cell SRR065155:GSM577962 IP:piwi ies.. V126: IP:total RNA CME L1 SRR001341:GSM278695 IP:total RNA WT_males_non-beta-eliminated V013:GSM609251 IP:total RNA aged female head S32:GSM609242 IP:total RNA s2+48 #2 V010:GSM609217 IP:total RNA MLDmD20c5 V127: IP:total RNA G2 GSM313163: IP:total RNA dcr-2 heterozygous, untreated V014: IP:total RNA DTT 8h GSM313162: IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2 homozygous, untreated SRR001339:GSM278706 IP:total RNA WT_females_non-beta-eliminated SRR014270:GSM327628 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_NA_0_2hr_Emb S2:GSM240749 IP:total RNA female head S17:GSM322245 IP:total RNA 3rd inster #1 GSM313164: IP:2'Ome in mutant MUT:ago2 .. V009:GSM609235 IP:total RNA CMEL1 SRR014269:GSM327629 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_LK_0_2hr_Emb SRR010960:SRX002245 IP:2'Ome in mutant wt, oxidized SRR031702:GSM466495 IP:2Ome flies.. V028:GSM609226 IP:total RNA CMEW1 Cl.8+ cell V035:GSM609250 IP:total RNA ML-DmD32 cell V129: IP:total RNA ML-DmBG1-c1 SRR001344:GSM278692 IP:2'Ome in mutant MUT:dcr2 dcr-2_beta-eliminated V076:GSM609225 IP:total RNA ML-DmBG3-C2 M064: IP:AGO2 MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, knockdown DS1091 V094:SRX247213 IP:ago2 FLAG-IP from S2-R+, FLAG-HA-AGO2
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGAT.................................................................................................... 22 1 29645.00 29645.00 6440.00 5881.00 2960.00 2525.00 2063.00 1094.00 918.00 786.00 689.00 512.00 285.00 394.00 172.00 299.00 327.00 269.00 248.00 177.00 250.00 201.00 172.00 91.00 192.00 84.00 138.00 23.00 128.00 128.00 100.00 119.00 105.00 76.00 62.00 30.00 84.00 72.00 74.00 71.00 48.00 38.00 22.00 19.00 44.00 39.00 34.00 8.00 35.00 35.00 37.00 37.00 35.00 32.00 29.00 34.00 37.00 33.00 20.00 16.00 31.00 19.00 29.00 10.00 27.00 28.00 20.00 28.00 24.00 17.00 19.00 15.00 17.00 23.00 12.00 18.00 17.00 16.00 20.00 16.00 17.00 16.00 16.00 11.00 12.00 8.00 14.00 15.00 14.00 1.00 7.00 12.00 10.00 12.00 7.00 11.00 - 10.00 6.00 1.00 - - 8.00 1.00 7.00 3.00 1.00 7.00 7.00 5.00 5.00 3.00 4.00 4.00 6.00 5.00 - 4.00 - 1.00 6.00 2.00 5.00 1.00 3.00 4.00 4.00 3.00 5.00 5.00 - 2.00 - 2.00 1.00 - 4.00 - - 3.00 3.00 1.00 1.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - 2.00 1.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - 2.00 - 2.00 - - 1.00 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGA..................................................................................................... 21 1 4024.00 4024.00 655.00 820.00 422.00 321.00 321.00 178.00 128.00 112.00 74.00 88.00 40.00 71.00 94.00 40.00 14.00 71.00 47.00 35.00 13.00 19.00 26.00 28.00 6.00 10.00 30.00 35.00 14.00 9.00 13.00 19.00 7.00 16.00 8.00 8.00 7.00 8.00 11.00 4.00 9.00 8.00 1.00 - 6.00 3.00 1.00 13.00 1.00 2.00 5.00 2.00 2.00 - 3.00 1.00 2.00 3.00 5.00 2.00 4.00 4.00 4.00 2.00 3.00 4.00 6.00 1.00 3.00 2.00 3.00 - 6.00 3.00 10.00 2.00 2.00 2.00 2.00 - 3.00 2.00 1.00 3.00 6.00 3.00 1.00 - - - 4.00 - - 1.00 5.00 - - 2.00 3.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 2.00 - 3.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 2.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAG............................................................... 22 1 1498.00 1498.00 54.00 161.00 56.00 137.00 114.00 12.00 13.00 10.00 37.00 10.00 104.00 6.00 100.00 26.00 7.00 4.00 32.00 42.00 2.00 14.00 3.00 37.00 - 62.00 3.00 41.00 3.00 6.00 32.00 5.00 4.00 4.00 24.00 39.00 4.00 6.00 4.00 4.00 9.00 18.00 25.00 23.00 1.00 3.00 3.00 7.00 6.00 2.00 - 3.00 3.00 2.00 5.00 - - 2.00 5.00 13.00 - 12.00 1.00 13.00 1.00 - 3.00 - - 2.00 4.00 7.00 2.00 2.00 1.00 1.00 1.00 3.00 - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - 11.00 - 1.00 1.00 - - - 12.00 - 1.00 4.00 5.00 11.00 - - 1.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - 2.00 - 2.00 3.00 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 2.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAA................................................................. 20 1 488.00 488.00 25.00 57.00 30.00 79.00 81.00 5.00 8.00 - 24.00 3.00 11.00 1.00 39.00 5.00 1.00 - 11.00 3.00 2.00 3.00 3.00 10.00 - 5.00 - 2.00 1.00 3.00 1.00 3.00 2.00 5.00 1.00 9.00 1.00 4.00 - 1.00 2.00 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - 2.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAG...................................................................................................... 20 1 424.00 424.00 28.00 67.00 77.00 50.00 25.00 16.00 12.00 12.00 7.00 5.00 2.00 8.00 11.00 5.00 3.00 5.00 4.00 1.00 4.00 2.00 4.00 1.00 1.00 1.00 2.00 25.00 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 3.00 - - - - - - 10.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - 3.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAA................................................................ 21 1 368.00 368.00 9.00 51.00 12.00 55.00 53.00 2.00 6.00 - 6.00 1.00 19.00 1.00 26.00 8.00 2.00 3.00 4.00 8.00 1.00 2.00 2.00 18.00 - 4.00 2.00 5.00 1.00 1.00 3.00 1.00 - 2.00 2.00 7.00 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 6.00 1.00 - - 3.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 2.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - 2.00 - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGt.............................................................. 22 t 216.00 40.00 23.00 21.00 42.00 11.00 8.00 1.00 2.00 3.00 18.00 - 12.00 2.00 4.00 7.00 1.00 - 1.00 7.00 1.00 - 3.00 7.00 - 3.00 - - 3.00 1.00 2.00 - - 1.00 4.00 1.00 2.00 - 2.00 1.00 - 3.00 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATT................................................................................................... 23 1 202.00 202.00 49.00 39.00 18.00 18.00 16.00 7.00 7.00 3.00 3.00 4.00 1.00 3.00 3.00 1.00 4.00 2.00 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - 5.00 1.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATa................................................................................................... 23 a 179.00 29645.00 46.00 29.00 19.00 20.00 10.00 9.00 9.00 3.00 3.00 4.00 4.00 3.00 1.00 2.00 1.00 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAGt.............................................................. 23 t 147.00 1498.00 13.00 8.00 50.00 2.00 8.00 - 1.00 - 5.00 2.00 7.00 6.00 2.00 - 3.00 1.00 - 4.00 - - - 5.00 1.00 - 1.00 - 2.00 1.00 - - 3.00 1.00 2.00 - 2.00 1.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - 3.00 - - 3.00 - - - - - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAA.................................................................. 19 1 119.00 119.00 4.00 15.00 8.00 29.00 13.00 2.00 - - 2.00 2.00 1.00 - 19.00 1.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 4.00 - 3.00 - - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGcgat.................................................................................................... 22 cgat 104.00 12.00 8.00 23.00 21.00 2.00 4.00 2.00 16.00 2.00 - - - 2.00 1.00 - 1.00 3.00 4.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGct.................................................................................................... 22 ct 69.00 424.00 6.00 3.00 18.00 1.00 2.00 7.00 9.00 6.00 3.00 - - - 2.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGAc.................................................................................................... 22 c 47.00 4024.00 2.00 6.00 10.00 4.00 3.00 1.00 6.00 2.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTTGATCACCAGTAACTGAGAT.................................................................................................... 23 1 45.00 45.00 8.00 9.00 - 6.00 3.00 5.00 1.00 - 1.00 4.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGA....................................................................................................... 19 1 45.00 45.00 1.00 4.00 - 13.00 9.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTGTT................................................................................................ 26 1 41.00 41.00 6.00 6.00 6.00 6.00 3.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAG............................................................... 21 1 40.00 40.00 1.00 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - 5.00 - 3.00 1.00 - - - - - 3.00 - 4.00 - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGA.............................................................. 22 1 39.00 39.00 1.00 6.00 - 4.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 4.00 - 3.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - 3.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAtat.................................................................................................... 22 tat 38.00 45.00 6.00 9.00 2.00 - 2.00 1.00 2.00 1.00 1.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGAa.................................................................................................... 22 a 36.00 4024.00 4.00 5.00 6.00 2.00 4.00 2.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTTGATCACCAGTAACTGAGA..................................................................................................... 22 1 36.00 36.00 7.00 5.00 5.00 4.00 - 2.00 1.00 2.00 - 1.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGgt.................................................................................................... 22 gt 35.00 424.00 3.00 4.00 8.00 3.00 2.00 3.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGggat.................................................................................................... 22 ggat 34.00 12.00 1.00 2.00 6.00 5.00 2.00 3.00 3.00 2.00 4.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTGATCACCAGTAACTGAGAT.................................................................................................... 21 1 29.00 29.00 8.00 5.00 - 5.00 4.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAcat.................................................................................................... 22 cat 29.00 45.00 12.00 8.00 3.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTTGATCACCAGTAACTGAG...................................................................................................... 21 1 27.00 27.00 1.00 4.00 6.00 4.00 - - 1.00 - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCGATGGGGCACTCAGGCT............... 19 1 25.00 25.00 - 2.00 3.00 - 2.00 - - - - - 2.00 - 2.00 2.00 1.00 - 2.00 1.00 - 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGAg.................................................................................................... 22 g 24.00 4024.00 7.00 2.00 7.00 - - 2.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTGTTT............................................................................................... 27 1 22.00 22.00 10.00 2.00 2.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGtgat.................................................................................................... 22 tgat 18.00 12.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - 1.00 2.00 - 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTG.................................................................................................. 24 1 17.00 17.00 1.00 5.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGcga..................................................................................................... 21 cga 17.00 12.00 - 6.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TCACCTAATAGA.............................................................................................................................................................. 12 9 14.22 14.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 10.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGtt.................................................................................................... 22 tt 14.00 424.00 1.00 5.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAGA.............................................................. 23 1 13.00 13.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGc..................................................................................................... 21 c 13.00 424.00 - 2.00 5.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAa............................................................... 22 a 13.00 368.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTG........................................................................................................ 18 1 12.00 12.00 1.00 2.00 - 2.00 4.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAaat.................................................................................................... 22 aat 11.00 45.00 - 7.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTtaga..................................................................................................... 21 taga 10.00 1.00 - 5.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAA................................................................. 19 1 9.00 9.00 - 2.00 - 4.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTcaga..................................................................................................... 21 caga 9.00 1.00 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAgg............................................................... 22 gg 8.00 488.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGc.............................................................. 22 c 8.00 40.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGg..................................................................................................... 21 g 7.00 424.00 - 1.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATaa.................................................................................................. 24 aa 7.00 29645.00 - 4.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTGT................................................................................................. 25 1 7.00 7.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAt............................................................... 22 t 7.00 368.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGATCACCAGTAACTGAGATTGT................................................................................................. 23 1 6.00 6.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGt..................................................................................................... 21 t 6.00 424.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTGATCACCAGTAACTGAGA..................................................................................................... 20 1 6.00 6.00 2.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAt.................................................................. 19 t 6.00 5.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CTTCGATGGGGCACTCAGGCT............... 21 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCA................................................................... 18 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAGc.............................................................. 23 c 5.00 1498.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATc................................................................................................... 23 c 5.00 29645.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAc............................................................... 22 c 4.00 368.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTGTTTC.............................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTCGATGGGGCACTCAGGCT............... 20 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTaaga..................................................................................................... 21 aaga 4.00 1.00 - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................ATCACCAGTAACTGAGAT.................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAca..................................................................................................... 21 ca 4.00 45.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TCACCAGTAACTGAGAT.................................................................................................... 17 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTCTGGCAATCAAAAG............................................................... 17 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTt.................................................................................................. 24 t 4.00 202.00 1.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAA................................................................ 20 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGgga..................................................................................................... 21 gga 4.00 12.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................ACCAGTAACTGAGAT.................................................................................................... 15 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGcgct.................................................................................................... 22 cgct 3.00 12.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAggt.............................................................. 22 ggt 3.00 9.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TATCAAGGGCCGAGTTACC.......................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAta..................................................................................................... 21 ta 3.00 45.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGtga..................................................................................................... 21 tga 3.00 12.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATg................................................................................................... 23 g 3.00 29645.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAAaaaa.................................................................. 19 aaaa 3.00 0.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGtt............................................................. 23 tt 3.00 40.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGAA............................................................. 23 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGttt................................................................................................... 23 ttt 3.00 424.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGgggt.................................................................................................... 22 gggt 2.00 12.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAcag............................................................... 22 cag 2.00 119.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTTTTCTGGCAATCAAAA................................................................ 18 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TCGTTATCAAGGGCCGAGTTACC.......................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TACTTCGATGGGGCACTCAGGCT............... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAact.................................................................................................... 22 act 2.00 45.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACCTTTGATCACCAGTAACTGA....................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAca................................................................. 20 ca 2.00 5.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAGg.............................................................. 23 g 2.00 1498.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAcaag............................................................... 22 caag 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAtt.............................................................. 22 tt 2.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGcg...................................................................................................... 20 cg 2.00 12.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAaa..................................................................................................... 21 aa 2.00 45.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGcc.................................................................................................... 22 cc 2.00 424.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAgg............................................................... 21 gg 2.00 9.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATaaaa................................................................. 20 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAgag............................................................... 22 gag 2.00 119.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................CGTTTTCTGGCAATCAAAAG............................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTTGATCACCAGTAACTGAGATa................................................................................................... 24 a 1.00 45.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAcagt.............................................................. 23 cagt 1.00 119.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................ACTTCGATGGGGCACTCAGGCT............... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAccgt.............................................................. 22 ccgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAcaa................................................................ 21 caa 1.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTGTa................................................................................................ 26 a 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGAaa................................................................................................... 23 aa 1.00 4024.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTccta............................................................................................... 27 ccta 1.00 202.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAGtt............................................................. 24 tt 1.00 1498.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACggag...................................................................................................... 20 ggag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAga................................................................. 20 ga 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTttt................................................................................................ 26 ttt 1.00 202.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TTTTCTGGCAATCAAAAGAA............................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTTTTCTGGCAATCAAca................................................................ 18 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GATCACCAGTAACTGAGAT.................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAg.................................................................. 19 g 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAcagt.............................................................. 22 cagt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAt...................................................................................................... 20 t 1.00 45.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAggg............................................................... 22 ggg 1.00 119.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATtaaa................................................................. 19 taaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAtg............................................................... 22 tg 1.00 488.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTtata..................................................................................................... 21 tata 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATttt.................................................................. 19 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTtagt..................................................................................................... 21 tagt 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTTTTCTGGCAATCAAAAG............................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTcag...................................................................................................... 20 cag 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ATAAGGTAGAGAAAT 15 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ATCAAGGGCCGAGTTACC.......................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TACCTTTGATCACCAGTcttc......................................................................................................... 21 cttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAa...................................................................................................... 20 a 1.00 45.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAtata................................................................................................... 23 tata 1.00 45.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGctt................................................................................................... 23 ctt 1.00 424.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TACGGTTTCGTTTTCaaa......................................................................... 18 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACCTTTGATCACCAGTAACTG........................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAtaat............................................................... 22 taat 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAaatt................................................................................................... 23 aatt 1.00 45.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCgaa................................................................. 20 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTtaac..................................................................................................... 21 taac 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGct............................................................. 23 ct 1.00 40.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAcg............................................................... 22 cg 1.00 488.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACT......................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAAatt................................................................... 18 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAgag............................................................... 21 gag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAAct.............................................................. 23 ct 1.00 368.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGg.............................................................. 22 g 1.00 40.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGtttg.................................................................................................. 24 tttg 1.00 424.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TTTTCTGGCAATCAAAAGAACTTG......................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCca.................................................................. 19 ca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAcag.................................................................................................... 22 cag 1.00 45.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAg................................................................ 21 g 1.00 488.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAcacg............................................................... 22 cacg 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAccgt.............................................................. 23 ccgt 1.00 119.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TTTTCTGGCAATCAAAAGAACT........................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAtagt.............................................................. 22 tagt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAAGta............................................................. 23 ta 1.00 40.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTGTTTCT............................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATaaa................................................................................................. 25 aaa 1.00 29645.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCGATGGGGCACTCAGGCTA.............. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCcaa................................................................. 20 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TTTTCTGGCAATCAAAAGA.............................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATtaaa................................................................. 20 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTtag...................................................................................................... 20 tag 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................CGTTTTCTGGCAATCAAA................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAAc................................................................ 21 c 1.00 488.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTGATCACCAGTAACTGAtat.................................................................................................... 21 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAac..................................................................................................... 21 ac 1.00 45.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTtagg..................................................................................................... 21 tagg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTaag...................................................................................................... 20 aag 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATcaca................................................................................................ 26 caca 1.00 29645.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATCAAtaga.............................................................. 23 taga 1.00 119.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATgg.................................................................................................. 24 gg 1.00 29645.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCAATgaa.................................................................. 19 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTTGATCACCAGTAACTGA....................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGATCACCAGTAACTGAGATTG.................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTTGATCACCAGTAACTtag...................................................................................................... 21 tag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCGTTTTCTGGCAATCAAAcgt.............................................................. 22 cgt 1.00 9.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGATTa.................................................................................................. 24 a 1.00 202.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ATAAGGTAGAGAAATagat 19 agat 1.00 1.00 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGcgac.................................................................................................... 22 cgac 1.00 12.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAGAga................................................................................................... 23 ga 1.00 4024.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTGATCACCAGTAACTGAGATT................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GTTTCTGATACGGTTTgttt............................................................................... 20 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTGATCACCAGTAACTGAGATa................................................................................................... 22 a 1.00 29.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACcgag...................................................................................................... 20 cgag 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGtt...................................................................................................... 20 tt 1.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGAaaa.................................................................................................... 22 aaa 1.00 45.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTGATCACCAGTAACTGcggg.................................................................................................... 22 cggg 1.00 12.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TTATCAAGGGCCGAGTTACC.......................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTTTGATCACCAGTAACTGAGATT................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TATCAAGGGCCG................................................................................................................................. 12 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
...............................................................................................................................................ATTCAACTACTTCGAgc............................ 17 gc 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
.............................................................................................................TTCTGGCAATCAAAAGc.............................................................. 17 c 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AATAGAATCCGTAGTaata................................................................................................................................................. 19 aata 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTCTGGCAATCAAAAGt.............................................................. 18 t 0.50 4.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AAGAACTTGGACTCGACaa............................................... 19 aa 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCGATGGGGCACTCAGGCg............... 19 g 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
.......................................................................................................................................................ACTTCGATGGGGCACcgct.................. 19 cgct 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCAAAAGAACTTGGAagc.................................................... 18 agc 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAACTACTTCGATGGGcta....................... 19 cta 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ATAAGGTAGAGAAATcgat 19 cgat 0.50 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ATAAGGTAGAGAAATggat 19 ggat 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGCA....................................................................... 14 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................ACTCAGGCTATAAGGTAca..... 19 ca 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTCTGGCAATCAAA................................................................. 15 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................ACCAGTAACTGAG...................................................................................................... 13 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCGTTTTCTGGC........................................................................ 13 13 0.15 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
CATGGTATCAAATCAGATTCACCTAATAGAATCCGTAGTGAGCTCGTTATCAAGGGCCGAGTTACCTTTGATCACCAGTAACTGAGATTGTTTCTGATACGGTTTCGTTTTCTGGCAATCAAAAGAACTTGGACTCGACTTGAATTCAACTACTTCGATGGGGCACTCAGGCTATAAGGTAGAGAAAT
..................................................................((((((..((((.(((.((((((((.......)))))))))))..))))..)))))).................................................................
.............................................................62.................................................................129.........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR060652:GSM548591 IP:total RNA hs-Penelope_testes_totalSRR060645:GSM548584 IP:total RNA yw67c23(2)_testes_totalV091: IP:total RNA fGS/OSS total  SRR060643:GSM548582 IP:total RNA A2_testes_totalSRR060650:GSM548589 IP:total RNA A1_testes_totalV093: IP:total RNA MUT:loqs loqs-KO, 40A; loqs-PB rescue/TM3  male total RNAV090:GSM609234 IP:total RNA CS  male total RNA  V092: IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2[G31R] male total RNA  V0632: IP:ago1 wt ovary AGO1-IP, reseqV138: IP:total RNA Male cold bodySRR317113:GSM767597 IP:total RNA 5-6 days old flies..V144: IP:total RNA OSCGSM280085:GSM280085 IP:total RNA WT testes (18-24nt)SRR298537:GSM744630 MUT:Vret ret Mutant..V097:GSE24545 IP:total RNA CS ovary total RNAV083:GSM609223 IP:total RNA male, one daySRR014278:GSM327632 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_Har(male)_F1SRR317117:GSM767601 IP:total RNA ld flies..SRR298712:GSM744620 MUT:Bam n: Bam Mutant..SRR298536:GSM744629 IP:total RNA erozygote..V0652: IP:ago1 MUT:dcr2 dcr2 ovary, AGO1-IP, reseqSRR317112:GSM767596 IP:total RNA old flies..SRR032095:GSM442735 IP:ago1 MUT:dcr2 AGO1 IP dcr2 knockdownSRR317116:GSM767600 IP:total RNA 5-6 days old flies..V136: IP:total RNA Male aged bodySRR351332:GSM811191 IP:total RNA Nibbler ygenotype: control wild type (w, 5905)..V0642: IP:ago1 MUT:ago2 ago2 ovary, AGO1-IP, reseqV063:GSM609230 IP:ago1 CS,ovary,AGO1IPSRR317114:GSM767598 IP:total RNA om 5-6 days old flies..V012: IP:total RNA Dcr2 male (Katsutomo, whole fly?)V098:GSE24544 IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2[L811fsX] ovary total RNAV015: IP:total RNA DreRFHV148hSRR317110:GSM767594 IP:total RNA ays old flies..S24:GSM399107 IP:total RNA male body #2V0882:GSM628271 IP:total RNA MUT:r2d2 r2d2[1] ovary total RNA ¬†SRR060644:GSM548583 IP:total RNA A2_ovaries_totalV0662: IP:ago1 MUT:r2d2 r2d2 ovary, AGO1-IP, reseqV0892:GSM628272 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNASRR014275:GSM327624 IP:total RNA Ovary_rep1_LK_PSRR317111:GSM767595 IP:total RNA : from 5-6 days old flies..S21:GSM399105 IP:total RNA disk #2S5:GSM275691 IP:total RNA imaginal discV142: IP:total RNA Oxidation_female_bodyGSM379061: IP:total RNA Squ HeterozygoteGSM379063: IP:total RNA Vasa HeterozygoteSRR351333:GSM811192 IP:total RNA MUT:Nibbler ygenotype: nbr[f02257]..SRR014274:GSM327633 IP:total RNA Ovary_rep1_LK(fem)_x_Har(male)_F1SRR014276:GSM327634 IP:total RNA Ovary_rep1_NA(fem)_x_Har(male)_F1V089:GSM609237 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNAV141: IP:total RNA Heat_female_bodyGSM379051: MUT:armi Armi MutantSRR060653:GSM548592 IP:total RNA hs-Penelope_ ovaries_totalGSM379066: MUT:Zuc Zuc MutantV088:GSM609232 IP:total RNA MUT:r2d2 r2d2[1] ovary total RNA ¬†V082:GSM609238 IP:total RNA embryo 14-24hrSRR065801:GSM593298 IP:total RNA zuc_het(H-Y)_ovariesGSM379057: MUT:Krimp Krimp MutantSRR317115:GSM767599 IP:total RNA old flies..V065:GSM609236 IP:ago1 MUT:dcr2 dcr-2[L811fsX], ovary, AGO1IPSRR014281:GSM327631 IP:total RNA Ovary_rep1_wK(fem)_x_w1118(male)_F1V140: IP:total RNA Dessication_female_bodyM065: MUT:CG1091 ovary - sample C, homozygous mutantSRR014282:GSM327621 IP:total RNA Ovary_rep1_wK_PSRR014280:GSM327620 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118_PV064:GSM609231 IP:ago1 MUT:ago2 ago2[414], ovary, AGO1IPV139: IP:total RNA Cold_female_bodySRR065800:GSM593297 IP:total RNA zuc_H-Y_ovariesSRR031697:GSM466490 IP:total RNA Total small RNAs from dcr-2 heterozygous fliesGSM379065: IP:total RNA Zuc HeterozygoteGSM379056: IP:total RNA Krimp HeterozygoteSRR014277:GSM327623 IP:total RNA Ovary_rep1_NA_PSRR060646:GSM548585 IP:total RNA yw67c23(2)_ovaries_totalV078: IP:total RNA Desiccation, female headGSM379064: MUT:Vasa Vasa MutantV066:GSM609233 IP:ago1 MUT:r2d2 r2d2[1], ovary, AGO1IPGSM379062: MUT:Squ Squ MutantSRR014279:GSM327630 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_wK(male)_F1GSM379060: IP:total RNA SpnE HeterozygoteSRR029033:GSM430035 MUT:lacZ lacZ knockdownSRR298711:GSM744619 SETDB1 Mutant..GSM379053: MUT:armi Aub MutantV137: IP:total RNA Male aged headSRR029030:GSM430032 MUT:dcr2 dcr-2 knockdownSRR032152:GSM466489 IP:ago1 Ago1-associated small RNAs from Oregon RGSM379059: MUT:piwi Piwi MutantGSM379067: MUT:SpnE SpnE MutantSRR032094:GSM442734 MUT:ago2 ago2 knockdownSRR031698:GSM466491 IP:2Ome flies..V079: IP:2'Ome in mutant Oxidation, female headGSM379050: IP:total RNA Armi HeterozygoteSRR014273:GSM327622 IP:total RNA Ovary_rep1_Har_PGSM379055: MUT:Flam Flam MutantV077: IP:total RNA cold, female headV084:GSM609224 IP:total RNA female, one daySRR032092:GSM442732 IP:total RNA mock oxidizedGSM379054: IP:total RNA Flam HeterozygoteSRR031699:GSM466492 IP:total RNA Total small RNAs from dcr-2 homozygous fliesS3:GSM286602 IP:total RNA male bodySRR031704:GSM466497 IP:2'Ome in mutant MUT:r2d2 ies..GSM313161: IP:2Ome dcr-2 heterozygous, oxidizedGSM379052: IP:total RNA Aub HeterozygoteGSM467729: IP:total RNA Dmel_wt_sRNAseqV147: IP:total RNA 1182-4H cellGSM180335: IP:total RNA imaginal discsS28:GSM360262 IP:total RNA 0-2d pupaeGSM379058: IP:total RNA Piwi HeterozygoteV002:GSM609240 IP:total RNA IR+SRR031692:GSM466487 IP:total RNA Total small RNAs from Oregon RV086: IP:total RNA female body, agedSRR031703:GSM466496 IP:total RNA MUT:r2d2 Total small RNAs from r2d2 homozygous fliesV146: IP:total RNA S1 cellOSS2:GSM385744 IP:total RNA OSS_s2V006: IP:total RNA r2d2 female: possibly heterozygousV001:GSM609239 IP:total RNA MUT:IR IR-S35:GSM609244 IP:total RNA KC+48 #2SRR060647:GSM548586 IP:ago2 A2_ovaries_FLAG-Ago2S9:GSM286604 IP:total RNA 0-1h #3 (7)OSS7:GSM385821 IP:total RNA OSS_s7SRR060648:GSM548587 IP:aub A2_ovaries_FLAG-AubV096: MUT:loqs loqsKO/f00791 ovarySRR031701:GSM466494 IP:total RNA Total small RNAs from r2d2 heterozygous fliesSRR029028:GSM430030 IP:total RNA untreated (mock)SRR001664:GSM278703 IP:total RNA MUT:dcr2 homozygous_dcr-2_untreatedSRR097867:GSM666013 IP:total RNA Drosophila S2-NP cellsGSM280082:GSM280082 IP:total RNA WT ovaries (18-29nt)SRR029633: IP:total RNA total small RNAs from hen1 homozygous fliesV132: IP:total RNA ML-DmD32SRR029032:GSM430034 MUT:r2d2 r2d2 knockdownOSS6:GSM385748 IP:total RNA OSS_s6V036: IP:total RNA ML-DmD20c5 cellV007:GSM609247 IP:total RNA heat female headSRR097866:GSM666012 IP:total RNA Drosophila S2-NP cellsSRR031696:GSM466489 IP:ago1 Ago1-associated small RNAs from Oregon RS8:GSM272651 IP:total RNA S2-48,+48, KC-48, +48 mixSRR065804:GSM593301 IP:piwi MUT:zuc Piwi-IP_zuc_H-Y_ovariesSRR010954:SRX002239 IP:2'Ome in mutant Aub trans-heterozygotes, oxidizedV085: IP:total RNA CME W2 wing discSRR010959:SRX002244 IP:ago3 Ago3 IP in heterozygotesSRR032096:GSM442736 IP:ago2 MUT:dcr2 AGO2 IP dcr2 knockdownS20:GSM322338 IP:total RNA 2-4day pupae#2S27:GSM360260 IP:total RNA 0-1d Pupae (w)GSM280083:GSM280083 MUT:dcr2 dcr-2-/- ovaries (18-29nt)V148: IP:total RNA mbn2S23:GSM399106 IP:total RNA female body #2V073: IP:total RNA mbn2S22:GSM322533 IP:total RNA female head #1SRR341116:GSM786605 IP:Luciferase MUT:Oxidized pe: Schneider 2 (S2) cellsoxidation..SRR029608: IP:total RNA total small RNAs from hen1 heterozygous fliesS19:GSM322219 IP:total RNA 2-4day pupae #1SRR341115:GSM786604 IP:Nibbler MUT:Unoxidized Schneider 2 (S2) cellsoxidation..SRR001345:GSM278708 IP:total RNA MUT:ago2 ago2_non-beta-eliminatedS18:GSM322208 IP:total RNA 3rd inster #2V022: IP:total RNA ML-DmD32 cellV026:GSM609221 IP:total RNA 1182-4H cellSRR060651:GSM548590 IP:ago3 A2_ovaries_Ago3SRR010958:SRX002243 IP:piwi Piwi IP in Ago3 trans-heterozygotesSRR341118:GSM786607 IP:Luciferase MUT:Unoxidized pe: Schneider 2 (S2) cellsoxidation..SRR097865:GSM666011 IP:total RNA Drosophila S2-NP cellsSRR341117:GSM786606 IP:Nibbler MUT:Oxidized Schneider 2 (S2) cellsoxidation..V128: IP:total RNA S3OSS8:GSM385822 IP:total RNA OSS_s8SRR029031:GSM430033 MUT:loqs loqs-ORF knockdownV080: IP:total RNA Starvation, female headGSM467731: MUT:loqs Dmel_loq_sRNAseqGSM280088:GSM280088 IP:ago1 S2cell (AGO1IP)SRR014268:GSM327627 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_HAR_0_2hr_EmbSRR060649:GSM548588 IP:piwi A2_ovaries_FLAG-PiwiSRR010953:SRX002238 IP:total RNA Aub heterozygotes, oxidizedV081:GSM609229 IP:total RNA embryo 2-6hrSRR001347:GSM278704 IP:total RNA MUT:ago2 ago2_untreatedSRR001349:GSM278705 IP:total RNA heterozygous_dcr-2_untreatedV023: IP:total RNA Dcr2 female headSRR065152:GSM577959 IP:piwi ..V032: IP:total RNA S1 cellSRR065155:GSM577962 IP:piwi ies..V126: IP:total RNA CME L1SRR001341:GSM278695 IP:total RNA WT_males_non-beta-eliminatedV013:GSM609251 IP:total RNA aged female headS32:GSM609242 IP:total RNA s2+48 #2V010:GSM609217 IP:total RNA MLDmD20c5V127: IP:total RNA G2GSM313163: IP:total RNA dcr-2 heterozygous, untreatedV014: IP:total RNA DTT 8hGSM313162: IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2 homozygous, untreatedSRR001339:GSM278706 IP:total RNA WT_females_non-beta-eliminatedSRR014270:GSM327628 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_NA_0_2hr_EmbS2:GSM240749 IP:total RNA female headS17:GSM322245 IP:total RNA 3rd inster #1GSM313164: IP:2'Ome in mutant MUT:ago2 ..V009:GSM609235 IP:total RNA CMEL1SRR014269:GSM327629 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_LK_0_2hr_EmbSRR010960:SRX002245 IP:2'Ome in mutant wt, oxidizedSRR031702:GSM466495 IP:2Ome flies..V028:GSM609226 IP:total RNA CMEW1 Cl.8+ cellV035:GSM609250 IP:total RNA ML-DmD32 cellV129: IP:total RNA ML-DmBG1-c1SRR001344:GSM278692 IP:2'Ome in mutant MUT:dcr2 dcr-2_beta-eliminatedV076:GSM609225 IP:total RNA ML-DmBG3-C2M064: IP:AGO2 MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, knockdown DS1091V094:SRX247213 IP:ago2 FLAG-IP from S2-R+, FLAG-HA-AGO2
.........................ATAGAATCCGTAGTGAGCTCGTTATCAAG...................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................tagTTTGATCACCAGTAA........................................................................................................... 18 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ATCAAATCAGATTCACCTAATA................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TACGGTTTCGTTTTCTGGCAAT..................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ttcaTACCTTTGATCACCAGT............................................................................................................. 21 ttca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................acacTTCTGGCAATCAAAA................................................................ 19 acac 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGATTCACCTAA.................................................................................................................................................................. 12 12 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................AAGGGCCGAGT.............................................................................................................................. 11 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CAGGCTATAAG.......... 11 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CGAGTTACCTT........................................................................................................................ 11 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -