ID: CG31689_in4_dme-mir-4914
chr2L:2737493-2737736 +
Display Libraries
(1)
1182-4H 		(2)
2OME_MUTANT.ip 		(6)
AGO1.ip 		(1)
AGO2.ip 		(5)
AGO2.mut 		(1)
AGO3.ip 		(2)
AUB.ip 		(7)
BODY 		(4)
DCR2.mut 		(1)
DISC 		(5)
EMBRYO 		(1)
G2 		(1)
GM2 		(19)
HEAD 		(3)
KC 		(1)
LARVAE 		(2)
LOQS.mut 		(7)
ML_CELL_LINE 		(3)
OSS 		(2)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(45)
OVARY 		(2)
PIWI.ip 		(1)
PUPAE 		(4)
R2D2.mut 		(2)
S1 		(7)
S2 		(1)
S2_NP 		(4)
S2_R 		(1)
S3 		(2)
TESTES 		(95)
TOTAL_RNA.ip 		(5)
WHOLE 		(1)
WING 		(2)
ZUC.mut 		(2)
mbn2
Showing top 125 reads
CCAGAAGAAGCGCCTATCCATCGCCCTGGAACTGATAGACAATCCAGCTGTGCTATTTTTAGACGAGCCCACAACGTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGTGGTCCTCGAAACCAGTTGTGCTTCGATCAGATTCCAAAATTGACACATTCCGACCTTGAATCACCCACAGCGGATTGGACAGCTCCTCCTCCTTCGACACCATCCAGCTGCTGCGCGGCCTGGCCAACGAGGGACGTACCATCGT
...........................................................................(((.((((...((((.((.((((((....(((((...........)))))...((((....))))..))))))..)).))))..)))).))).............................................................................
...........................................................................76...........................................................................................169.........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm V127: IP:total RNA G2 M065: MUT:CG1091 ovary - sample C, homozygous mutant V0892:GSM628272 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNA SRR031703:GSM466496 IP:total RNA MUT:r2d2 Total small RNAs from r2d2 homozygous flies SRR317116:GSM767600 IP:total RNA 5-6 days old flies.. SRR317117:GSM767601 IP:total RNA ld flies.. V081:GSM609229 IP:total RNA embryo 2-6hr SRR317114:GSM767598 IP:total RNA om 5-6 days old flies.. SRR317111:GSM767595 IP:total RNA : from 5-6 days old flies.. SRR317115:GSM767599 IP:total RNA old flies.. GSM467729: IP:total RNA Dmel_wt_sRNAseq V098:GSE24544 IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2[L811fsX] ovary total RNA SRR317113:GSM767597 IP:total RNA 5-6 days old flies.. V096: MUT:loqs loqsKO/f00791 ovary V147: IP:total RNA 1182-4H cell V097:GSE24545 IP:total RNA CS ovary total RNA SRR317110:GSM767594 IP:total RNA ays old flies.. SRR060653:GSM548592 IP:total RNA hs-Penelope_ ovaries_total SRR317112:GSM767596 IP:total RNA old flies.. V148: IP:total RNA mbn2 V140: IP:total RNA Dessication_female_body V0652: IP:ago1 MUT:dcr2 dcr2 ovary, AGO1-IP, reseq V137: IP:total RNA Male aged head SRR014270:GSM327628 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_NA_0_2hr_Emb SRR014269:GSM327629 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_LK_0_2hr_Emb V073: IP:total RNA mbn2 V094:SRX247213 IP:ago2 FLAG-IP from S2-R+, FLAG-HA-AGO2 V131: IP:total RNA ML-DmD16-c3 V085: IP:total RNA CME W2 wing disc SRR065806:GSM593303 IP:piwi MUT:squ Piwi-IP_squ_mut_ovaries SRR029633: IP:total RNA total small RNAs from hen1 homozygous flies SRR060652:GSM548591 IP:total RNA hs-Penelope_testes_total V091: IP:total RNA fGS/OSS total   SRR032152:GSM466489 IP:ago1 Ago1-associated small RNAs from Oregon R V141: IP:total RNA Heat_female_body SRR065804:GSM593301 IP:piwi MUT:zuc Piwi-IP_zuc_H-Y_ovaries V089:GSM609237 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNA SRR031701:GSM466494 IP:total RNA Total small RNAs from r2d2 heterozygous flies SRR031692:GSM466487 IP:total RNA Total small RNAs from Oregon R SRR001349:GSM278705 IP:total RNA heterozygous_dcr-2_untreated S24:GSM399107 IP:total RNA male body #2 SRR341115:GSM786604 IP:Nibbler MUT:Unoxidized Schneider 2 (S2) cellsoxidation.. GSM379065: IP:total RNA Zuc Heterozygote SRR298537:GSM744630 MUT:Vret ret Mutant.. M066: IP:AGO1 MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, overexpression UAS1091 OSS2:GSM385744 IP:total RNA OSS_s2 V093: IP:total RNA MUT:loqs loqs-KO, 40A; loqs-PB rescue/TM3  male total RNA V014: IP:total RNA DTT 8h SRR298536:GSM744629 IP:total RNA erozygote.. S30:GSM361908 IP:total RNA s2-48 Biological Replicate #2 SRR010955:SRX002240 IP:aub Aub IP in Ago3 heterozygotes V083:GSM609223 IP:total RNA male, one day SRR014276:GSM327634 IP:total RNA Ovary_rep1_NA(fem)_x_Har(male)_F1 M069: IP:total RNA MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, overexpression UAS1091 V0632: IP:ago1 wt ovary AGO1-IP, reseq SRR014275:GSM327624 IP:total RNA Ovary_rep1_LK_P V0882:GSM628271 IP:total RNA MUT:r2d2 r2d2[1] ovary total RNA ¬† V132: IP:total RNA ML-DmD32 S33:GSM399110 IP:total RNA KC-48 #2 SRR351333:GSM811192 IP:total RNA MUT:Nibbler ygenotype: nbr[f02257].. V035:GSM609250 IP:total RNA ML-DmD32 cell V129: IP:total RNA ML-DmBG1-c1 V086: IP:total RNA female body, aged OSS6:GSM385748 IP:total RNA OSS_s6 V024:GSM399101 IP:total RNA kc167 cell SRR001348:GSM278693 IP:2'Ome in mutant MUT:ago2 ago2_oxidized SRR031697:GSM466490 IP:total RNA Total small RNAs from dcr-2 heterozygous flies GSM379067: MUT:SpnE SpnE Mutant SRR014274:GSM327633 IP:total RNA Ovary_rep1_LK(fem)_x_Har(male)_F1 S19:GSM322219 IP:total RNA 2-4day pupae #1 SRR014282:GSM327621 IP:total RNA Ovary_rep1_wK_P SRR014278:GSM327632 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_Har(male)_F1 SRR014279:GSM327630 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_wK(male)_F1 V032: IP:total RNA S1 cell V019:GSM609219 IP:total RNA GM2 cell SRR029608: IP:total RNA total small RNAs from hen1 heterozygous flies V013:GSM609251 IP:total RNA aged female head V010:GSM609217 IP:total RNA MLDmD20c5 V082:GSM609238 IP:total RNA embryo 14-24hr V146: IP:total RNA S1 cell GSM379054: IP:total RNA Flam Heterozygote S1:GSM286601 IP:total RNA male head V134: IP:total RNA ML-DmD8 SRR060643:GSM548582 IP:total RNA A2_testes_total SRR014277:GSM327623 IP:total RNA Ovary_rep1_NA_P SRR001339:GSM278706 IP:total RNA WT_females_non-beta-eliminated SRR065801:GSM593298 IP:total RNA zuc_het(H-Y)_ovaries SRR060651:GSM548590 IP:ago3 A2_ovaries_Ago3 SRR031704:GSM466497 IP:2'Ome in mutant MUT:r2d2 ies.. GSM379062: MUT:Squ Squ Mutant SRR001664:GSM278703 IP:total RNA MUT:dcr2 homozygous_dcr-2_untreated GSM379061: IP:total RNA Squ Heterozygote SRR351332:GSM811191 IP:total RNA Nibbler ygenotype: control wild type (w, 5905).. M067: IP:total RNA MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, knockdown DS1091 S10:GSM286605 IP:total RNA 2-6h #1 (8) S2:GSM240749 IP:total RNA female head GSM280083:GSM280083 MUT:dcr2 dcr-2-/- ovaries (18-29nt) S17:GSM322245 IP:total RNA 3rd inster #1 GSM379066: MUT:Zuc Zuc Mutant S29:GSM322543 IP:total RNA male head #1 V008: IP:total RNA S2-DRSC V018:GSM399100 IP:total RNA Kc167 cell V128: IP:total RNA S3 V038: IP:total RNA Felix sample S2 only V012: IP:total RNA Dcr2 male (Katsutomo, whole fly?) SRR010957:SRX002242 IP:aub Aub IP in Ago3 trans-heterozygotes SRR097866:GSM666012 IP:total RNA Drosophila S2-NP cells V145: IP:total RNA S2-DRSC V034: IP:total RNA ML-DmD16c3 cell SRR298711:GSM744619 SETDB1 Mutant.. SRR014273:GSM327622 IP:total RNA Ovary_rep1_Har_P S21:GSM399105 IP:total RNA disk #2 V0642: IP:ago1 MUT:ago2 ago2 ovary, AGO1-IP, reseq SRR060646:GSM548585 IP:total RNA yw67c23(2)_ovaries_total SRR341116:GSM786605 IP:Luciferase MUT:Oxidized pe: Schneider 2 (S2) cellsoxidation.. V142: IP:total RNA Oxidation_female_body V077: IP:total RNA cold, female head GSM467730: MUT:r2d2 Dmel_r2d2_sRNAseq SRR001347:GSM278704 IP:total RNA MUT:ago2 ago2_untreated V063:GSM609230 IP:ago1 CS,ovary,AGO1IP
..................................................................................................................................................TTCCGACCTTGAATCACCCACAGt.......................................................................... 24 t 40.00 36.00 2.00 - - - 3.00 3.00 - 3.00 2.00 - - - 3.00 - 1.00 1.00 3.00 - 1.00 - 1.00 3.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCCGACCTTGAATCACCCACAG........................................................................... 23 1 36.00 36.00 - 2.00 - - 2.00 4.00 - 2.00 4.00 1.00 - - 4.00 - 1.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGTGG............................................................................................................................................... 26 1 36.00 36.00 3.00 1.00 3.00 - 1.00 - 6.00 - - 1.00 - 4.00 - 3.00 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATG.................................................................................................................................................. 23 1 33.00 33.00 3.00 - 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 2.00 1.00 - 5.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGTG................................................................................................................................................ 25 1 17.00 17.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCCGACCTTGAATCACCCACA............................................................................ 22 1 10.00 10.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGT................................................................................................................................................. 24 1 6.00 6.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGTGGT.............................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAA.................................................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAAT................................................................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGTGGTC............................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCC...................................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GAGTGAGAGCGAGTTCCAATG.................................................................................................................................................. 21 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCA..................................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGCGCGGCCTGGCCAACGAGGGACt......... 25 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCCGACCTTGAATCACCCACAG........................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GAGAGCGAGTTCCAATGTGGTCCTCGAA....................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CCTCGAAACCAGTTGTGCTTCGATCAGA.................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CTGCGCGGCCTGGCCAAgttt.............. 21 gttt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TCCTCGAAACCAGTTGTGCTTCGATCA.................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCCGACCTTGAATCACCCAC............................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GACCTTGAATCACCCACA............................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCCGACCTTGAATCACCCACAGa.......................................................................... 24 a 2.00 36.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAGTTCCAATGTGGTCCTCG......................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCACCCACAGCGGATTGGACAGCTCC........................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCGCCCTGGAACTGATAGACAATCC....................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CTGCGCGGCCTGGCCAAgt................ 19 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCGACACCATCCAGCTGCTGCGCG............................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CCATCCAGCTGCTGCGCGGCC......................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................ATCGCCCTGGAACTGATAGAC............................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TTAGACGAGCCCACAAC......................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GTGCTATTTTTAGACGAGCCCACAACcgg...................................................................................................................................................................... 29 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TCCAATGTGGTCCTC.......................................................................................................................................... 15 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGCTGCGCGGCCTGGCCAACGAGGGAC.......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TCCTCCTCCTTCGACACCATC......................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GAGAGCGAGTTCCAATGTGGTCC............................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGATAGACAATCCAGCTGT................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGCGCGGCCTGGCCAcgc................ 18 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTTTAGACGAGCCCACAACcgg...................................................................................................................................................................... 22 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GGCCTGGCCAACGAGGGACGTA....... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TCCAAAATTGACACATTCCGACCTTGAA..................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAGTTCCAATGTGGTgctg.......................................................................................................................................... 19 gctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GTGCTATTTTTAGACGAGCCCACAACc........................................................................................................................................................................ 27 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATttgg............................................................................................................................................... 26 ttgg 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................GCTATTTTTAGACGAGCCCACAACcgga..................................................................................................................................................................... 28 cgga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCCTGGAACTGATAGACAATCCAGCT................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGaggt.............................................................................................................................................. 27 aggt 1.00 33.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................ATTTTTAGACGAGCCCACAACcgg...................................................................................................................................................................... 24 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGTGGTCC............................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGCGCGGCCTGGCCAACGAGG............. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGCGCGGCCTGGCCAACGAGGGAat......... 25 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CGACCTTGAATCACCCACAGt.......................................................................... 21 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AATTGACACATTCCGACCTTGAATC................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TATCCATCGCCCTGGAACTGATAGA............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GTTCCAATGTGGTCCTCGA........................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GTGAGAGCGAGTTCCAATGTG................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGATAGACAATCCAGCTGTGCT.............................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CCTCCTCCTTCGACACCATCCAGC..................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GACACCATCCAGCTGCTGCGC............................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGCGCGGCCTGGCCAACGAGGGACGga....... 27 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGTGCTATTTTTAGACGAGCCCACAACc........................................................................................................................................................................ 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAAAATTGACACATTCCGACCTTGAA..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GTGAGAGCGAGTTCCAATGTGGTCC............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AAACCAGTTGTGCTTCGATCA.................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........CGCCTATCCATCGCCCTGGAAC.................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGAGTGAGAGCGAGTTCCAATG.................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AGTTCCAATGTGGT.............................................................................................................................................. 14 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GCGCGGCCTGGCCAACGAGGGACGTAC...... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AACCAGTTGTGCTTCGATCAGATTC............................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GACAATCCAGCTGTGCTAT............................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CATCCAGCTGCTGCGCGG........................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................ACCTTGAATCACCCACAGt.......................................................................... 19 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTCGACACCATCCAGCTGCTGCGCGGC.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GCTGCGCGGCCTGGCCAAC................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTGAGTGAGAGCGAGTTC....................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ATTCCGACCTTGAATCACCCACAG........................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CAGATTCCAAAATTGACACATTCCGAC........................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAAACCAGTTGTGCTTCGATCAGAT................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGCTGCGCGGCCTGGCCAACGAGGG............ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TTCCAAAATTGACACATTCCGACCTT........................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GCCAACGAGGGACGTACa..... 18 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AAAATTGACACATTCCGA............................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGCCCTGGAACTGATAGACA........................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTTTAGACGAGCCCACAACGTGAGTGA................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CGACACCATCCAGCTGCTGCGC............................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GAGAGCGAGTTCCAATG.................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CAGCTCCTCCTCCTTCGACACCATCC........................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCCGACCTTGAATCACCCACAGg.......................................................................... 24 g 1.00 36.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCCGACCTTGAATCACCCACAGCGaat...................................................................... 28 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ATTGGACAGCTCCTCCTCCTTCGt................................................ 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................ACGAGGGACGTACCATCG. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AAACCAGTTGTGCTTCGATC..................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................GATCAGATTCCA............................................................................................................. 12 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................CCAACGAGGGAC.......... 12 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 -
.............................................................................................................................................................AATCACCCACAG........................................................................... 12 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGAGAGCGAGTT........................................................................................................................................................ 12 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07
...........................................................................................................................................................................................CTCCTTCGACAC............................................. 12 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
CCAGAAGAAGCGCCTATCCATCGCCCTGGAACTGATAGACAATCCAGCTGTGCTATTTTTAGACGAGCCCACAACGTGAGTGAGAGCGAGTTCCAATGTGGTCCTCGAAACCAGTTGTGCTTCGATCAGATTCCAAAATTGACACATTCCGACCTTGAATCACCCACAGCGGATTGGACAGCTCCTCCTCCTTCGACACCATCCAGCTGCTGCGCGGCCTGGCCAACGAGGGACGTACCATCGT
...........................................................................(((.((((...((((.((.((((((....(((((...........)))))...((((....))))..))))))..)).))))..)))).))).............................................................................
...........................................................................76...........................................................................................169.........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm V127: IP:total RNA G2M065: MUT:CG1091 ovary - sample C, homozygous mutantV0892:GSM628272 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNASRR031703:GSM466496 IP:total RNA MUT:r2d2 Total small RNAs from r2d2 homozygous fliesSRR317116:GSM767600 IP:total RNA 5-6 days old flies..SRR317117:GSM767601 IP:total RNA ld flies..V081:GSM609229 IP:total RNA embryo 2-6hrSRR317114:GSM767598 IP:total RNA om 5-6 days old flies..SRR317111:GSM767595 IP:total RNA : from 5-6 days old flies..SRR317115:GSM767599 IP:total RNA old flies..GSM467729: IP:total RNA Dmel_wt_sRNAseqV098:GSE24544 IP:total RNA MUT:dcr2 dcr-2[L811fsX] ovary total RNASRR317113:GSM767597 IP:total RNA 5-6 days old flies..V096: MUT:loqs loqsKO/f00791 ovaryV147: IP:total RNA 1182-4H cellV097:GSE24545 IP:total RNA CS ovary total RNASRR317110:GSM767594 IP:total RNA ays old flies..SRR060653:GSM548592 IP:total RNA hs-Penelope_ ovaries_totalSRR317112:GSM767596 IP:total RNA old flies..V148: IP:total RNA mbn2V140: IP:total RNA Dessication_female_bodyV0652: IP:ago1 MUT:dcr2 dcr2 ovary, AGO1-IP, reseqV137: IP:total RNA Male aged headSRR014270:GSM327628 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_NA_0_2hr_EmbSRR014269:GSM327629 IP:total RNA Embryo_0-2hrs_rep1_LK_0_2hr_EmbV073: IP:total RNA mbn2V094:SRX247213 IP:ago2 FLAG-IP from S2-R+, FLAG-HA-AGO2V131: IP:total RNA ML-DmD16-c3V085: IP:total RNA CME W2 wing discSRR065806:GSM593303 IP:piwi MUT:squ Piwi-IP_squ_mut_ovariesSRR029633: IP:total RNA total small RNAs from hen1 homozygous fliesSRR060652:GSM548591 IP:total RNA hs-Penelope_testes_totalV091: IP:total RNA fGS/OSS total  SRR032152:GSM466489 IP:ago1 Ago1-associated small RNAs from Oregon RV141: IP:total RNA Heat_female_bodySRR065804:GSM593301 IP:piwi MUT:zuc Piwi-IP_zuc_H-Y_ovariesV089:GSM609237 IP:total RNA MUT:ago2 ago2[414] ovary total RNASRR031701:GSM466494 IP:total RNA Total small RNAs from r2d2 heterozygous fliesSRR031692:GSM466487 IP:total RNA Total small RNAs from Oregon RSRR001349:GSM278705 IP:total RNA heterozygous_dcr-2_untreatedS24:GSM399107 IP:total RNA male body #2SRR341115:GSM786604 IP:Nibbler MUT:Unoxidized Schneider 2 (S2) cellsoxidation..GSM379065: IP:total RNA Zuc HeterozygoteSRR298537:GSM744630 MUT:Vret ret Mutant..M066: IP:AGO1 MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, overexpression UAS1091OSS2:GSM385744 IP:total RNA OSS_s2V093: IP:total RNA MUT:loqs loqs-KO, 40A; loqs-PB rescue/TM3  male total RNAV014: IP:total RNA DTT 8hSRR298536:GSM744629 IP:total RNA erozygote..S30:GSM361908 IP:total RNA s2-48 Biological Replicate #2SRR010955:SRX002240 IP:aub Aub IP in Ago3 heterozygotesV083:GSM609223 IP:total RNA male, one daySRR014276:GSM327634 IP:total RNA Ovary_rep1_NA(fem)_x_Har(male)_F1M069: IP:total RNA MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, overexpression UAS1091V0632: IP:ago1 wt ovary AGO1-IP, reseqSRR014275:GSM327624 IP:total RNA Ovary_rep1_LK_PV0882:GSM628271 IP:total RNA MUT:r2d2 r2d2[1] ovary total RNA ¬†V132: IP:total RNA ML-DmD32S33:GSM399110 IP:total RNA KC-48 #2SRR351333:GSM811192 IP:total RNA MUT:Nibbler ygenotype: nbr[f02257]..V035:GSM609250 IP:total RNA ML-DmD32 cellV129: IP:total RNA ML-DmBG1-c1V086: IP:total RNA female body, agedOSS6:GSM385748 IP:total RNA OSS_s6V024:GSM399101 IP:total RNA kc167 cellSRR001348:GSM278693 IP:2'Ome in mutant MUT:ago2 ago2_oxidizedSRR031697:GSM466490 IP:total RNA Total small RNAs from dcr-2 heterozygous fliesGSM379067: MUT:SpnE SpnE MutantSRR014274:GSM327633 IP:total RNA Ovary_rep1_LK(fem)_x_Har(male)_F1S19:GSM322219 IP:total RNA 2-4day pupae #1SRR014282:GSM327621 IP:total RNA Ovary_rep1_wK_PSRR014278:GSM327632 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_Har(male)_F1SRR014279:GSM327630 IP:total RNA Ovary_rep1_w1118(fem)_x_wK(male)_F1V032: IP:total RNA S1 cellV019:GSM609219 IP:total RNA GM2 cellSRR029608: IP:total RNA total small RNAs from hen1 heterozygous fliesV013:GSM609251 IP:total RNA aged female headV010:GSM609217 IP:total RNA MLDmD20c5V082:GSM609238 IP:total RNA embryo 14-24hrV146: IP:total RNA S1 cellGSM379054: IP:total RNA Flam HeterozygoteS1:GSM286601 IP:total RNA male headV134: IP:total RNA ML-DmD8SRR060643:GSM548582 IP:total RNA A2_testes_totalSRR014277:GSM327623 IP:total RNA Ovary_rep1_NA_PSRR001339:GSM278706 IP:total RNA WT_females_non-beta-eliminatedSRR065801:GSM593298 IP:total RNA zuc_het(H-Y)_ovariesSRR060651:GSM548590 IP:ago3 A2_ovaries_Ago3SRR031704:GSM466497 IP:2'Ome in mutant MUT:r2d2 ies..GSM379062: MUT:Squ Squ MutantSRR001664:GSM278703 IP:total RNA MUT:dcr2 homozygous_dcr-2_untreatedGSM379061: IP:total RNA Squ HeterozygoteSRR351332:GSM811191 IP:total RNA Nibbler ygenotype: control wild type (w, 5905)..M067: IP:total RNA MUT:CG1091 Flag-HA-Ago2 S2R+, knockdown DS1091S10:GSM286605 IP:total RNA 2-6h #1 (8)S2:GSM240749 IP:total RNA female headGSM280083:GSM280083 MUT:dcr2 dcr-2-/- ovaries (18-29nt)S17:GSM322245 IP:total RNA 3rd inster #1GSM379066: MUT:Zuc Zuc MutantS29:GSM322543 IP:total RNA male head #1V008: IP:total RNA S2-DRSCV018:GSM399100 IP:total RNA Kc167 cellV128: IP:total RNA S3V038: IP:total RNA Felix sample S2 onlyV012: IP:total RNA Dcr2 male (Katsutomo, whole fly?)SRR010957:SRX002242 IP:aub Aub IP in Ago3 trans-heterozygotesSRR097866:GSM666012 IP:total RNA Drosophila S2-NP cellsV145: IP:total RNA S2-DRSCV034: IP:total RNA ML-DmD16c3 cellSRR298711:GSM744619 SETDB1 Mutant..SRR014273:GSM327622 IP:total RNA Ovary_rep1_Har_PS21:GSM399105 IP:total RNA disk #2V0642: IP:ago1 MUT:ago2 ago2 ovary, AGO1-IP, reseqSRR060646:GSM548585 IP:total RNA yw67c23(2)_ovaries_totalSRR341116:GSM786605 IP:Luciferase MUT:Oxidized pe: Schneider 2 (S2) cellsoxidation..V142: IP:total RNA Oxidation_female_bodyV077: IP:total RNA cold, female headGSM467730: MUT:r2d2 Dmel_r2d2_sRNAseqSRR001347:GSM278704 IP:total RNA MUT:ago2 ago2_untreatedV063:GSM609230 IP:ago1 CS,ovary,AGO1IP
......................................................................................................................................................................................................CCATCCAGCTGCTGCGCGGC.......................... 20 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................aATCAGATTCCAAAAT......................................................................................................... 16 a 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................ttaACAGCTCCTCCTCCT.................................................... 18 tta 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................ctATCCAGCTGCTGCGCGGC.......................... 20 ct 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTTGAATCACCCACAGCGGAT...................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................ctacAGAGCGAGTTCCAATGT................................................................................................................................................. 21 ctac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................tcaaGAAACCAGTTGTGCT........................................................................................................................... 19 tcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................ctTCCTTCGACACCATCCAGCTG................................... 23 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................aaccTTGGACAGCTCCTCCTCCTTC.................................................. 25 aacc 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................ACCATCCAGCTGCTGC............................... 16 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................ttcCCTTCGACACCATCC........................................ 18 ttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGGACAGCTCCTCCTCCTTCG................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................attaACAGCTCCTCCTCCT.................................................... 19 atta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................cataACAGCTCCTCCTCCT.................................................... 19 cata 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................tagATCCAGCTGTGCTAT............................................................................................................................................................................................ 18 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTGGACAGCTCCTCCTCCTTC.................................................. 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................tccgCCATCCAGCTGCTGC............................... 19 tccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................gGATCAGATTCCAAAAT......................................................................................................... 17 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................tccCTCCTCCTCCTTCGAC............................................... 19 tcc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
ccggAGAAGAAGCGCCTAT................................................................................................................................................................................................................................... 19 ccgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ctcCAGCTCCTCCTCCTT................................................... 18 ctc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................aAGATTCCAAAATTGACACA.................................................................................................. 20 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................ACCATCCAGCTGC.................................. 13 6 0.83 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ACCAGTTGTGCTT.......................................................................................................................... 13 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................ACGAGGGACGTA....... 12 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GTCCTCGAAACC.................................................................................................................................... 12 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 -
.....................................................................................................TCCTCGAAACCA................................................................................................................................... 12 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................CGTACCATCGT 11 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GTGGTCCTCGAA....................................................................................................................................... 12 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -