ID:

mml-mir-578

Coordinate:

chr5:159106117-159106211 +

Confidence:

Known

Class:

Unknown

Genomic Locale:

intergenic

[View on miRBase]

[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}]
Legend: mature star mismatch in read

Predicted structure

Sense Strand Reads

AACAATTATTATTACCTCATTATGGCATTTTCCATTGTTGGTCTACATGGGATAAATATATAGACAAAATACAATCCTGGACTATAAGAAGCTCCTATAGCTCCTGTAGCTTCTTGTGCTCTGGGATTGTATTTTGTTTATATATATATATTTTAATCCCAAATGTCTAGTATTATGCTTGGGACATAGTGGCCA

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Read size # Mismatch Hit Count Total Norm Total SRR116845

epididymis
...............................................................................................................TCTTGTGCTCTGGGATTGTATTATC........................................................... 25 2 1 1.00 1 1

Anti-sense strand reads

TTGTTAATAATAATGGAGTAATACCGTAAAAGGTAACAACCAGATGTACCCTATTTATATATCTGTTTTATGTTAGGACCTGATATTCTTCGAGGATATCGAGGACATCGAAGAACACGAGACCCTAACATAAAACAAATATATATATATAAAATTAGGGTTTACAGATCATAATACGAACCCTGTATCACCGGT

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Read size # Mismatch Hit Count Total Norm Total

Generated: 09/01/2015 at 12:25 PM