ID:hsa-mir-8075 |
Coordinate:chr13:113262920-113262999 + |
Confidence:Known |
Type:Unknown |
[View on miRBase] [View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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No conservation details. |
| -31.9 | -31.3 | -31.2 |
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| mature | star |
|
TACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGGTCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGGTCTGCCTCGCTTATACGTGCC
************************************..((....................((((((..(((((((((((((((..............)).)).))))))).)))).))))))..))..**************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139208 testes |
SRR139211 testes |
SRR139214 thymus |
SRR139212 testes |
SRR139209 testes |
SRR330904 skin |
SRR330905 skin |
TAX577742 breast |
SRR330906 skin |
SRR330921 skin |
SRR553576 testes |
SRR330908 skin |
TAX577739 breast |
TAX577590 breast |
SRR330916 skin |
SRR342898 heart |
GSM450601 brain |
SRR342901 heart |
SRR342899 heart |
TAX577579 breast |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................................TTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTC.............................................................................................................. | 30 | 0 | 9 | 3.00 | 27 | 27 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................TATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTC.............................................................................................................. | 29 | 0 | 9 | 3.00 | 27 | 27 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................TATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTC................................................................... | 29 | 0 | 9 | 3.00 | 27 | 27 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTC................................................................... | 30 | 0 | 9 | 3.00 | 27 | 27 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................TTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTC........................ | 30 | 0 | 9 | 3.00 | 27 | 27 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................TATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTC........................ | 29 | 0 | 9 | 3.00 | 27 | 27 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................TGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGC...................................... | 24 | 0 | 7 | 2.00 | 14 | 0 | 14 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................TGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGC................................................................................. | 24 | 0 | 7 | 2.00 | 14 | 0 | 14 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................TGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGC............................................................................................................................ | 24 | 0 | 7 | 2.00 | 14 | 0 | 14 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................TACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGT......................... | 26 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................TCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGA....................................................................... | 30 | 0 | 7 | 1.00 | 7 | 0 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................TACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGT.................................................................... | 26 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................TCGCTTATACGTGCCC................................................................................................................................ | 16 | 0 | 8 | 1.00 | 8 | 0 | 0 | 0 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................TACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGT............................................................................................................... | 26 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................TCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGA.................................................................................................................. | 30 | 0 | 7 | 1.00 | 7 | 0 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| TACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGT.......................................................................................................................................................... | 26 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GCCCTTGCTGATGGCAGAT...................................................................... | 19 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 0 | 0 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................CAGATGTCGGGTCTGCCTCGCTTA........ | 24 | 0 | 3 | 1.00 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................GCCCTTGCTGATGGCAGAT........................... | 19 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 0 | 0 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................TCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGA............................ | 30 | 0 | 7 | 1.00 | 7 | 0 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................TCGCTTATACGTGCCC.......................................... | 16 | 0 | 8 | 1.00 | 8 | 0 | 0 | 0 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................TACGTGCCCTTGCTGATGGCAG........................................................................ | 22 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................GCCCTTGCTGATGGCAGAT................................................................................................................. | 19 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 0 | 0 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....GCCCTTGCTGATGGCAGAT............................................................................................................................................................ | 19 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 0 | 0 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................CAGATGTCGGGTCTGCCTCGCTTA................................................... | 24 | 0 | 3 | 1.00 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................TACGTGCCCTTGCTGATGGCAG............................. | 22 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................TCGCTTATACGTGCCC..................................................................................... | 16 | 0 | 8 | 1.00 | 8 | 0 | 0 | 0 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| TACGTGCCCTTGCTGATGGCAG.............................................................................................................................................................. | 22 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................TACGTGCCCTTGCTGATGGCAG................................................................................................................... | 22 | 0 | 9 | 1.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..CGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGA...................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 5 | 0.40 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................CGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGA........................................................................................................... | 28 | 0 | 5 | 0.40 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................GATGTCGGGTCTGCCTCGCTTATA................................................. | 24 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................GATGTCGGGTCTGCCTCGCTTATA...... | 24 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................GATGTCGGGTCTGC................ | 14 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................GATGTCGGGTCTGCCTC........................................................ | 17 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................GATGTCGGGTCTGC........................................................... | 14 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................GATGTCGGGTCTGCCTC............. | 17 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................ATGTCGGATCTGCC................................................................................................................................................ | 14 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................GATGTCGGATCTGCCTC................................................................................................... | 17 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................CTTGCTGATGGCAGATGTCGGATC......................................................................................................... | 24 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................ATGTCGGATCTGCC..................................................................................................... | 14 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................GATGTCGGATCTGCCTC.............................................................................................................................................. | 17 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......CCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATC.................................................................................................................................................... | 26 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................CAGATGTCGGAT.......................................................................................................... | 12 | 0 | 20 | 0.20 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ...................................................CTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGA...................................................................................................... | 27 | 1 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........CTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGA................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................CAGATGTCGGAT..................................................................................................................................................... | 12 | 0 | 20 | 0.20 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ........CTTGCTGATGGCAGATGTCGGATC.................................................................................................................................................... | 24 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................CCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATC......................................................................................................... | 26 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TCGGATCGGCCTCGC................................................................................................. | 15 | 1 | 20 | 0.15 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................TCGGATCGGCCTCGC............................................................................................................................................ | 15 | 1 | 20 | 0.15 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................TCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGC............................... | 27 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................TCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGC.......................................................................... | 27 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................GATGTCGGGTCTG................. | 13 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................TCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGC..................................................................................................................... | 27 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................GATGTCGGGTCTG............................................................ | 13 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................CTTGCTGATGGCAGATGTCG.................................................................. | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................CTTGCTGATGGCAGATGTCG....................... | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................TTATACGTGCCCTTGCTGATGG...................................................................................................................... | 22 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................TTGCTGATGGCAGATGTCGG............................................................................................................ | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................TTATACGTGCCCTTGCTGATGG................................ | 22 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........TTGCTGATGGCAGATGTCGG....................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................TTGCTGATGGCAGATGTCGG...................... | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TTATACGTGCCCTTGCTGATGG........................................................................... | 22 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................TTGCTGATGGCAGATGTCGG................................................................. | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................CTTGCTGATGGCAGATGTCG............................................................................................................. | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........CTTGCTGATGGCAGATGTCG........................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...GTGCCATTGCTGATGGCAGGTG........................................................................................................................................................... | 22 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................GTGCCATTGCTGATGGCAGGTG.......................... | 22 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................GTGCCATTGCTGATGGCAGGTG..................................................................... | 22 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................GTGCCATTGCTGATGGCAGGTG................................................................................................................ | 22 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ....................AGATGTCGGAT..................................................................................................................................................... | 11 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ...............................................................AGATGTCGGAT.......................................................................................................... | 11 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................GTCGGGTCTG................. | 10 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ......................................................................................................................................................GATGTCGGGTCTTC................ | 14 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ..............GATAGCCGATGGCGGATCTG.................................................................................................................................................. | 20 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ..............................................................................................................GTCGGGTCTG............................................................ | 10 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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|
ATGCACGGGAACGACTACCGTCTACAGCCTAGACGGAGCGAATATGCACGGGAACGACTACCGTCTACAGCCTAGACGGAGCGAATATGCACGGGAACGACTACCGTCTACAGCCCAGACGGAGCGAATATGCACGGGAACGACTACCGTCTACAGCCCAGACGGAGCGAATATGCACGG
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Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR342901 heart |
SRR139201 placenta |
GSM450608 brain |
TAX577745 breast |
SRR330904 skin |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................................................................AGCCCAGACG................ | 10 | 0 | 20 | 1.55 | 31 | 31 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................AGCCCAGACG........................................................... | 10 | 0 | 20 | 1.55 | 31 | 31 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................GTCTACAGCCCAGAC................. | 15 | 0 | 5 | 1.00 | 5 | 0 | 5 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................GTCTACAGCCCAGAC............................................................ | 15 | 0 | 5 | 1.00 | 5 | 0 | 5 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................TCGACTACCGTCTTCAGGCCAG................... | 22 | 3 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TCGACTACCGTCTTCAGGCCAG.............................................................. | 22 | 3 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ................................................................CTACAGCCTGGACATAGCGA................................................................................................ | 20 | 3 | 19 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| .....................CTACAGCCTGGACATAGCGA........................................................................................................................................... | 20 | 3 | 19 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ........................................................................................................................................................ACAGCCCAGACG................ | 12 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| .............................................................................................................ACAGCCCAGACG........................................................... | 12 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| hg38 | chr13:113262870-113263049 + | hsa-mir-8075 | TACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGGTCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGGTCTGCCTCGCTTATACGTGCC |
| panTro4 | chr13:114008199-114008378 + | TACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGATCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTCGGGTCTGCCTCGCTTATACGTGCCCTTGCTGATGGCAGATGTTGGATCTGCCTCGCTTATACGTGCC | |
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| rn5 | Unknown | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | |
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| monDom5 | Unknown | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| hg38 |
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| panTro4 |
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| rheMac3 |
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| mm10 |
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| rn5 |
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| canFam3 |
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| monDom5 |
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Generated: 12/12/2014 at 11:06 AM