ID:hsa-mir-4327 | 
		Coordinate:chr21:30375294-30375378 - | 
		Confidence:Known | 
		Type:Unknown | 
		
[View on miRBase] [View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}]  | 
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read | 
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	No conservation details. | 
| -26.9 | -26.5 | -26.0 | -26.0 | 
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| 
CCTGGAAAAGTCTCAAACAATGAGGCCGGATGACCTCCGAGAAAGCCACAGGCCTGGGTAGGCTTGCATGGGGGACTGGGAAGAGACCATGAACAGGTTAGTCCAGGGAGTTCTCATCAAGCCTTTACTCAGTAGTGGGTTCTTCATAGTTAGCATTAATGTTTAATAGATACATTTCCCCTTGG
 *********************************************....((........(((((((.((((((..(((((....((((.......))))..))))).....)))))))))))))))***********************************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139188 lung  | 
	SRR139193 ovary  | 
	TAX577738 breast  | 
	SRR330916 skin  | 
	SRR330913 skin  | 
	SRR330921 skin  | 
	SRR039623 liver  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ................................................................................................GTTAGTCCAGGGAGT.......................................................................... | 15 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ............................................................GGCTTGCATGGGGGACT............................................................................................................ | 17 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..............................................................................GGAAGAGCCCATGAACAG......................................................................................... | 18 | 1 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| .....................GAGGCCGGATGAC....................................................................................................................................................... | 13 | 0 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| ...............................................................................GAAGAGCCCATGAACAGG........................................................................................ | 18 | 1 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| ...............................................................................................................................................TCGTAGTTAGCATTACTGTTTT.................... | 22 | 3 | 18 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...............................................................................................................................................TCATAGTTCGCATTATTGTGT..................... | 21 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..................................................................................................................................................AAGTTAGCATTAATGTTT..................... | 18 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| ...........................................................................................AACAGGATAGTCGAGGGA............................................................................ | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| 
GGACCTTTTCAGAGTTTGTTACTCCGGCCTACTGGAGGCTCTTTCGGTGTCCGGACCCATCCGAACGTACCCCCTGACCCTTCTCTGGTACTTGTCCAATCAGGTCCCTCAAGAGTAGTTCGGAAATGAGTCATCACCCAAGAAGTATCAATCGTAATTACAAATTATCTATGTAAAGGGGAACC
 ***********************************************************....((........(((((((.((((((..(((((....((((.......))))..))))).....)))))))))))))))*********************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139188 lung  | 
	SRR040038 cervix  | 
	SRR342894 heart  | 
	SRR342900 heart  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .....................................................................CCCCCTGACCCTTCT..................................................................................................... | 15 | 0 | 20 | 1.10 | 22 | 22 | 0 | 0 | 0 | 
| ...............................................................................................CCAATCAGATCCCTCAAGAC...................................................................... | 20 | 2 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| ............................CTACTGGAGGCTCT............................................................................................................................................... | 14 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| .........................................................................................................CCCTCAAGAGTAG................................................................... | 13 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| Species | Coordinate | ID | Alignment | 
|---|---|---|---|
| hg38 | chr21:30375244-30375428 - | hsa-mir-4327 | CCTGGAAAAGTCTCAAACAATGAGGCCGGATGACCTCCGAGAAAGCCACAGGCCTGGGTAGGCTTGCATGGGGGACT-GGGAAGAGACCATGAACAGGTTAGTCCAGGGAGTTCTCATCAAG-CCTTTACTCAGTAGTGGGTTCTTC-----ATAGTTAGCATTAATGTTTAATAGATACATTTCCCCTTGG | 
| panTro4 | chr21:16535729-16535914 - | CCTGGAAAAGTCTCAAACAATGAGGCAGGATGACCTCCGAGAAAGCCACAGGCCTGGGTAGGCTTGCATGGGGGACT-GGGAAGAGACCATGAACAGGTTAGTCCAGGGAGTTCTCATCAAGCCCTTTACTCAGTAGTGGGTCCTTC-----ATAGTTAGCATTAATATTTAATAGATAACTTTCCCCTTGG | |
| rheMac3 | chr3:16401909-16402095 + | CCTGGAAAAGTCTCAAACAATGAGGCAGGATGACCTCTGAGAAAGCCACAGGCCTGGGTAGACTTGCATGGGGGACTGGGGAAGAGACCATGAACAGGATAGTCTAGGGAGTTCCCATCAAGCCCTTTACTCAGTAGTGGGTCCTTC-----ATAGTGAGCATTAAGGTTTAATAGATACATTTCCCCTTGG | |
| mm10 | Unknown | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | |
| rn5 | Unknown | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | |
| canFam3 | chr31:25239518-25239684 - | -------------------ATGGGGTAGGATGACCTCTGGGAAAGTAGTGGCTCATGGCCATCTTGCTTGGTACTTG-GGCCAGAAGCCA-GAGCAGAGAGGTTGAGTG-GTTTTCTTC---TCCTTTACCCACAGATGGGTCTTTCAGCCTATACTTAGCGATAACCTTTAACAGACAAATCACTCCCTCG | |
| monDom5 | Unknown | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | 
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| hg38 | 
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| panTro4 | 
  | 
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| rheMac3 | 
  | 
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| mm10 | 
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| rn5 | 
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| canFam3 | 
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| monDom5 | 
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Generated: 12/12/2014 at 10:33 AM