ID:hsa-mir-4267 |
Coordinate:chr2:110069961-110070042 - |
Confidence:Known |
Type:Unknown |
[View on miRBase] [View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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No conservation details. |
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AGGGGTGGTATCTCCGAAGGAGCCGAGGATTCTCCGTGATGACTTGCAAACTCAGCAGGCTCCAGCTCGGTGGCACTGGGGGAAGGCTCCAGACCCCAGCCTCTGTCATCCCTGCATGGAGCCCACATCTCCAAGGAGGCTGGGAGATCCTGTTTGGGGGTCAATTTAAATGTGAAGGAGCA
*********************************************.......(((.(((((.......((.((..((((((.....)))))).))))))))))))......*********************************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139210 testes |
SRR139170 heart |
SRR139182 liver |
SRR139208 testes |
SRR139211 testes |
SRR553576 testes |
SRR342901 heart |
SRR342899 heart |
SRR095854 brain |
SRR330921 skin |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................TTCTCCGTGATGACTTGCAAACTCAGC.............................................................................................................................. | 27 | 0 | 2 | 1.50 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................................ATCCTGTTTGGGGGTC.................... | 16 | 0 | 4 | 1.00 | 4 | 0 | 0 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............TCCGAAGGAGCCGAGGATTCTCCGTGA............................................................................................................................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................GAAGGCTCCAGACCC...................................................................................... | 15 | 0 | 14 | 1.00 | 14 | 0 | 14 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................TCTCCAAGGAGGCTGG....................................... | 16 | 0 | 4 | 1.00 | 4 | 0 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............TCCGAAGGAGCCGAGGATTCTCCGTG................................................................................................................................................ | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................TCCAGCTCGGTGGCACTGGGGGAAGGC............................................................................................... | 27 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................CCCACATCTCCAAGGAG............................................ | 17 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .........................AGGATTCTCCGTG................................................................................................................................................ | 13 | 0 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ................AAGGAGCCGA............................................................................................................................................................ | 10 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................TCCAGCTCGGTGG............................................................................................................. | 13 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ..............................................................................................................CCTGCATGGAGCC........................................................... | 13 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
|
TCCCCACCATAGAGGCTTCCTCGGCTCCTAAGAGGCACTACTGAACGTTTGAGTCGTCCGAGGTCGAGCCACCGTGACCCCCTTCCGAGGTCTGGGGTCGGAGACAGTAGGGACGTACCTCGGGTGTAGAGGTTCCTCCGACCCTCTAGGACAAACCCCCAGTTAAATTTACACTTCCTCGT
***********************************************************************.......(((.(((((.......((.((..((((((.....)))))).))))))))))))......********************************************* |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139208 testes |
SRR330916 skin |
SRR330922 skin |
SRR330908 skin |
SRR342895 heart |
GSM450601 brain |
RoviraIPAgo2 breast |
SRR039611 liver |
SRR039621 liver |
SRR330921 skin |
SRR342898 heart |
TAX577741 breast |
TAX577743 breast |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................GCCACCGTGAC........................................................................................................ | 11 | 0 | 20 | 24.10 | 482 | 482 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................GGGTGCGGAGGTTCCTCCGACGCT..................................... | 24 | 3 | 5 | 1.00 | 5 | 0 | 3 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................GGTGCGGAGGTTCCTCCGACGCT..................................... | 23 | 3 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................GGGGTCGGAGACTGTAGGGAGGT.................................................................. | 23 | 2 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................GTCTTGGATCGGAGACAGTA......................................................................... | 20 | 2 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................TTGGGTGCAGAGGTTCCTCC........................................... | 20 | 2 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................GGGGTCGGAGACAGTAGA....................................................................... | 18 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................GAGGTCGAGCC................................................................................................................ | 11 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................TCTGCCGACCCCCTAGGACAA............................ | 21 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| .......................................................................................................................TCGGGTGTAGAGGT................................................. | 14 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............GCTTGCTCGGCTCC.......................................................................................................................................................... | 14 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................CTGATAGGCACTACTGAACTT...................................................................................................................................... | 21 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| hg38 | chr2:110069911-110070092 - | hsa-mir-4267 | AGGGGTGGTATCTCCGAAGGAGCCGAGGATTCTCCGTGATGACTTGCAAACTC--AGCAGGCTCCAGCTCGGTGGCACTGGGGGAAGGCTCCAGACCCCAGCCTCTGTCATCCCTGCATGGAGCCCACATCTCCAAGGAGGCTGGGAGATCCTGTTTGGGGGTCAATTTAAATGTGAAGGAGCA |
| panTro4 | Unknown | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| rheMac3 | chr13:109590258-109590441 - | AGGGGTGGTATCTCTGAAGGATCCAAGGATTCTCTGTGATGACTTGTGAACTCTAAGCAGGCTCCAGCTCGGCGGCACTGGGGGAAGGTTCCAGACCCCAGCCTCTGTCATCCCTGCATGGAGCCCACACCTCCAAAGAAGCTGGGAGGTCCTATTTGGGGGTCCATTTAAATGTGAAGGAGCA | |
| mm10 | Unknown | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| rn5 | Unknown | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| canFam3 | Unknown | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| monDom5 | Unknown | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| hg38 |
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| panTro4 |
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| rheMac3 |
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| mm10 |
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| rn5 |
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| canFam3 |
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| monDom5 |
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Generated: 12/12/2014 at 11:41 AM