ID:hsa-mir-3945 | 
		Coordinate:chr4:184851013-184851110 - | 
		Confidence:Known | 
		Type:Unknown | 
		
[View on miRBase] [View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}]  | 
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read | 
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	![]()  | 
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	No conservation details. | 
| -34.9 | -34.8 | -34.8 | 
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| 
TGTACTCAAATATCACCTCAAATAAGATGAGGTCTTTCTGAGAGAAAAGAGATGTTGATGCACGTGACGGGGAGGGCATAGGAGAGGGTTGATATAAAATGCAATTACAGCCTCTTATGCTTTCCAAAGTGGGGGATGATTCAATGATTCCTGACTGGTCCACAGCCATATATCAATTGAGGTTATAATACTAATTTG
 ***********************************((((........)))).(((....)))...(((..(((((((((((((...(((((.((...........))))))))))))))))))))..(((.((((((.((...)).)))))).))).)))...***********************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139205 spleen  | 
	SRR139185 lung  | 
	SRR139202 spleen  | 
	SRR139204 spleen  | 
	SRR139183 lung  | 
	SRR139203 spleen  | 
	SRR139184 lung  | 
	SRR139186 lung  | 
	SRR139187 lung  | 
	SRR139207 spleen  | 
	SRR139210 testes  | 
	SRR139211 testes  | 
	SRR139171 kidney  | 
	SRR139180 liver  | 
	SRR139208 testes  | 
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	SRR139174 kidney  | 
	SRR139179 liver  | 
	SRR139194 ovary  | 
	SRR139214 thymus  | 
	SRR139216 thymus  | 
	TAX577739 breast  | 
	SRR139173 kidney  | 
	SRR139188 lung  | 
	SRR139190 lung  | 
	SRR139165 heart  | 
	SRR139172 kidney  | 
	SRR139192 ovary  | 
	SRR139209 testes  | 
	SRR139215 thymus  | 
	SRR139217 thymus  | 
	SRR342898 heart  | 
	TAX577740 breast  | 
	SRR139166 heart  | 
	SRR139177 liver  | 
	SRR139178 liver  | 
	SRR139193 ovary  | 
	SRR139195 ovary  | 
	SRR139206 spleen  | 
	TAX577745 breast  | 
	SRR039190 blood  | 
	SRR040028 cervix  | 
	SRR094131 uterus  | 
	SRR139176 kidney  | 
	SRR139189 lung  | 
	SRR139200 placenta  | 
	SRR139219 thymus  | 
	SRR191590 breast  | 
	TAX577738 breast  | 
	SRR039191 blood  | 
	SRR039616 liver  | 
	SRR039623 liver  | 
	SRR040010 cervix  | 
	SRR040036 cervix  | 
	SRR139164 heart  | 
	SRR139191 ovary  | 
	SRR139196 ovary  | 
	SRR139199 placenta  | 
	SRR139201 placenta  | 
	SRR191397 breast  | 
	SRR191442 breast  | 
	SRR191461 breast  | 
	SRR191485 breast  | 
	SRR191614 breast  | 
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	SRR330911 skin  | 
	SRR330917 skin  | 
	SRR330921 skin  | 
	SRR330923 skin  | 
	SRR342895 heart  | 
	SRR342900 heart  | 
	SRR553576 testes  | 
	TAX577589 breast  | 
	TAX577590 breast  | 
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	TAX577743 breast  | 
	TAX577746 breast  | 
	SRR040018 cervix  | 
	SRR342899 heart  | 
	GSM450607 brain  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTTTCCAA....................................................................... | 22 | 0 | 1 | 127.00 | 127 | 16 | 6 | 15 | 9 | 5 | 5 | 5 | 7 | 3 | 0 | 1 | 3 | 6 | 3 | 2 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 1 | 5 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTTTCC......................................................................... | 20 | 0 | 1 | 57.00 | 57 | 8 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 6 | 0 | 8 | 1 | 0 | 2 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 2 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTTTCCAAA...................................................................... | 23 | 0 | 1 | 29.00 | 29 | 3 | 5 | 1 | 1 | 2 | 7 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..........................................................................................................ACAGCCTCTTATGCTTTCCA........................................................................ | 20 | 0 | 1 | 24.00 | 24 | 0 | 3 | 5 | 4 | 0 | 0 | 2 | 5 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..........................................................................................................ACAGCCTCTTATGCTTTCCAA....................................................................... | 21 | 0 | 1 | 19.00 | 19 | 1 | 3 | 1 | 0 | 2 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..........................................................................................................ACAGCCTCTTATGCTTTCCAAA...................................................................... | 22 | 0 | 1 | 19.00 | 19 | 3 | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTTTC.......................................................................... | 19 | 0 | 1 | 12.00 | 12 | 0 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTT............................................................................ | 17 | 0 | 1 | 12.00 | 12 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTTT........................................................................... | 18 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
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| ..........................................................................................................ACAGCCTCTTATGCTTTCC......................................................................... | 19 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...........................................................................................................CAGCCTCTTATGCTTTCCAAA...................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..........................................................................................................ACAGCCTCTTATGCTTT........................................................................... | 17 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...........................................................................................................CAGCCTCTTATGCTTTCCAAAT..................................................................... | 22 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
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| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTCTCC......................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ............................................................................................................AGCCTCTTATGCTTTCCAAAGT.................................................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................GACAGCCTCTTATGCTTTCCA........................................................................ | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGTCTCTTATGCTTTCCAA....................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCTTTCCAAT...................................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGCCTCTTATGCCTTCCAT....................................................................... | 22 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TAAAGACTCTTATGCTTTCCA........................................................................ | 21 | 2 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................TACAGACTCATATGCTTTCCA........................................................................ | 21 | 2 | 10 | 0.10 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...............................................................................AGGAGAGGGGTGATCTAAAA................................................................................................... | 20 | 2 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| ...........................................................................................................................................TTCAATTATTCCGGACTGGTG...................................... | 21 | 3 | 19 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...............................................................................................................................AGGGGGGGATGATTCAATAGT.................................................. | 21 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| 
ACATGAGTTTATAGTGGAGTTTATTCTACTCCAGAAAGACTCTCTTTTCTCTACAACTACGTGCACTGCCCCTCCCGTATCCTCTCCCAACTATATTTTACGTTAATGTCGGAGAATACGAAAGGTTTCACCCCCTACTAAGTTACTAAGGACTGACCAGGTGTCGGTATATAGTTAACTCCAATATTATGATTAAAC
 ***********************************((((........)))).(((....)))...(((..(((((((((((((...(((((.((...........))))))))))))))))))))..(((.((((((.((...)).)))))).))).)))...***********************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139181 liver  | 
	SRR040042 cervix  | 
	SRR330912 skin  | 
	TAX577741 breast  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ......................................................................................CCAACTATATTTTAC................................................................................................. | 15 | 0 | 15 | 1.00 | 15 | 15 | 0 | 0 | 0 | 
| .......................................................ACCACGTGCACTGCCCCTA............................................................................................................................ | 19 | 2 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| .......................................................ACAACCTGCACTGCCCCT............................................................................................................................. | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| .......................................................ACTACCTGTACTGCCCCT............................................................................................................................. | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| .......................................................ACTACCTGCACGGCCCCT............................................................................................................................. | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| Species | Coordinate | ID | Alignment | 
|---|---|---|---|
| hg38 | chr4:184850963-184851160 - | hsa-mir-3945 | TGTACTCAAATATCACCTCAAATAAGATGAGGTCTTTCTGAGAGAAAAGAGATGTTGATGCACGTGACGGGGAGG-GCATAGGAGAGGGTTGATATAAAATGCAATTACAGCCTCTTATGCTTTCCAAAGTGGGGGATGATTCAATGATT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTGACTGGT--CCACAGCCATATATCAATTGAGGTTATAATACTAATTTG | 
| panTro4 | chr4:188184593-188184790 - | TGTACTCAAATATCACCTCAAATAAGATGAGGTCTTTCTGAGAGAAAAGAGATGTTGACGCATGTGACGGGGAGG-GCTTAGGACAGGGTTGATATAAGATGTAATTACAGGCTCTTATGCTTTCCAAAGTGGGGGATGATTCAATGATT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTGACTGGT--CCACAGCCATATATCAATCGAGGTTATAATACTAATTTG | |
| rheMac3 | chr5:178973394-178973591 - | TGGACTCAAATATCACCTCAAATAAAATGAGGTCTTTCTGAGAGAAAAGAGATGTTGACGCAGGTGATGGGGAGG-GGATAGGAGAGAGTTGATATAAAATGCAATTATAGGCTCTTATGCTTTCCAAAGGGGGGGATGATTCAGTGATT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTGGCTGGT--CCACAGCCGTATGTCAACTGAGGTTAAAATGCTAATTTG | |
| mm10 | chr8:46434306-46434705 + | TGACCTTAGGTATCACCTCAAACATACTAGTGACTTCCTGAGAGGCAGGATGGGCGGGTG----TTAAGGGGAGGAACATACAGGAAAC-CTCTGCTATATGGAAGTTTTGGTTCTTAAATTTTTCAAAGAGGA-GCTGGTTCA-TGACTCTTGGGGGTGGAGTGGGGAtGtgtGGttgTgtgTGTGttGgTgTGGgTGGggTGttGgTgtgTtgtTtGtgTttGgTGGggTgtttgTgTgTGtGtTggggggTGggTgTgTgGGgTTgTTttGTGTGGGGtTTtttGGTGTGTGggTGTGTATTTAACCTCATGACTTTTTtgtgTTGtTtTTgGggttttGGggttGttGgGtTCCTCATGAGTTTTTAAAGGCAGATATTGATTGAGCAGAAGATACTAACTAG | |
| rn5 | chr16:48759157-48759296 - | TGGCCTTGGGTATCACCTCAAATACGATAGTGACTCCCTGAGAGGAAGGACAGACTGGCA----TGAAGGAAAGAAATATACAGGAAAACTC-------ATGAAAGTTTAGGCTCTTGAAATTTCCAAAGAGGG-GTTGGTTCA-TGACT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTT------------------------------------------------ | |
| canFam3 | Unknown | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| monDom5 | Unknown | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | 
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| hg38 | 
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| panTro4 | 
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| rheMac3 | 
  | 
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| mm10 | 
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| rn5 | 
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| canFam3 | 
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| monDom5 | 
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Generated: 12/12/2014 at 10:49 AM