ID:hsa-mir-3153 | 
		Coordinate:chr9:89312225-89312306 + | 
		Confidence:Known | 
		Type:Unknown | 
		
[View on miRBase] [View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}]  | 
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read | 
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	No conservation details. | 
| -35.8 | -35.4 | -35.1 | 
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| 
CCTGAAGCACCGTACTAGAACATGGTGGCTGTAATCGATCAGTAAAATTAGACAAATTTTAAATGTCCCTGTCCCCTTCCCCCCAATTAAAGTAGATTGGGGGAAAGCGAGTAGGGACATTTAAAATTTGTTGTCCTTACTGTATGCGGGACACTTCATTTAGGGCGTGGCTTCAGAAAACA
 ********************************************************(((((((((((((((((..(((.(((((((((......))))))))).))).)).)))))))))))))))..........**********************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139176 kidney  | 
	SRR039190 blood  | 
	SRR039612 liver  | 
	SRR039620 liver  | 
	SRR094131 uterus  | 
	SRR139180 liver  | 
	SRR139216 thymus  | 
	SRR139217 thymus  | 
	SRR330905 skin  | 
	SRR191405 breast  | 
	SRR342901 heart  | 
	SRR330919 skin  | 
	SRR342900 heart  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................TCCCCTTCCCCCCAA................................................................................................ | 15 | 0 | 20 | 2.45 | 49 | 49 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...............................................................TGTCCCTGTCCCCTTCCCCCCA................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...................................................................................................GGGGAAAGCGAGTAGGGACATT............................................................. | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...............................................................TGTCCCTGTCCCCTTCCCCCC.................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ................................................................................................................AGGGACATTTAAAATTTGTTG................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .............................................................................................................................ATTTGTTGTCCTTACTGTATGCGG................................. | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...........................................................................CTTCCCCCCAATTAA............................................................................................ | 15 | 0 | 5 | 1.00 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...................................................................................................GGGGAAAGCGAGTAGGGACAT.............................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .....................................................AAATTTTAAATGTCCCTG............................................................................................................... | 18 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| ....................................................CAAATTTTAAA....................................................................................................................... | 11 | 0 | 20 | 0.15 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 
| .................................................................................................TGGGGGAAAGC.......................................................................... | 11 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| ............................CTGTAATCGAT............................................................................................................................................... | 11 | 0 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| 
GGACTTCGTGGCATGATCTTGTACCACCGACATTAGCTAGTCATTTTAATCTGTTTAAAATTTACAGGGACAGGGGAAGGGGGGTTAATTTCATCTAACCCCCTTTCGCTCATCCCTGTAAATTTTAAACAACAGGAATGACATACGCCCTGTGAAGTAAATCCCGCACCGAAGTCTTTTGT
 **********************************************(((((((((((((((((..(((.(((((((((......))))))))).))).)).)))))))))))))))..........********************************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR139216 thymus  | 
	SRR139209 testes  | 
	SRR139179 liver  | 
	SRR139171 kidney  | 
	SRR139173 kidney  | 
	SRR139200 placenta  | 
	SRR191486 breast  | 
	SRR342898 heart  | 
	SRR342901 heart  | 
	SRR191631 breast  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................................................CCCTTTCGCTCATCCCTGTAA............................................................. | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .............................................TTAATCTGTTTAAAA.......................................................................................................................... | 15 | 0 | 20 | 2.10 | 42 | 0 | 42 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..............................................................................................................................................................AAATCCCGCACCGA.......... | 14 | 0 | 3 | 2.00 | 6 | 0 | 0 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .....................................................................................................................................................CTGTGAAGTAAATCCCG................ | 17 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ...............................................................................................ACACCCCCTTTCGCTCATCCCTGT............................................................... | 24 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| ..........................................................................................TCATCTAACCCCCTTTCGCTC....................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| .............................................................................................................................................................TAAATCCCGCACCGAA......... | 16 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .....................................................................................................................................................................GCACCGAAGTCTTTTG. | 16 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| ................TTTTGTACCACCGAGATTAG.................................................................................................................................................. | 20 | 2 | 11 | 0.09 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| Species | Coordinate | ID | Alignment | 
|---|---|---|---|
| hg38 | chr9:89312175-89312356 + | hsa-mir-3153 | CCTGAAGCACCGTACTAGAACATGGTGGCTGTAATCGATCAGTAAAATTAGACAAATTTTAAATGTCCCTGTCCCCTTCCCCCCAATTAAAGT-AGATTGGGGGAAAGCGAGTAGGGACATTTAAAATTTGTTGTCCTTACTGTATGCGGGACACTTCATTTAGGGCGTGGCTTCAGAAAACA | 
| panTro4 | chr9:88080298-88080400 + | CCTGAAGCACCGTACTAGAACATGGTGGCTGTAATCGATCAG--------------------------------------------------TA------------------------------AAATTTGTTGTCCTTACTGTATGCGGGACACTTCATTTAGGGCGTGGCTTCAGAAAACA | |
| rheMac3 | chr15:98694298-98694461 + | CCTGAAGCGATGTACCAGAACGTAGTG-----------TCAGTAAAATCAGACAGATTTTAAATGTCCCTATCC-------CCCAATTAAACT-AGACTGGGGGAAAGCGGGTAGGGACATTTAAAATTTGTTGTCCTCCTTGTGTGCGGGACACTTCATTTAGGGCGTAGCTTCAGAGACCA | |
| mm10 | chr13:51645900-51646026 + | TCCTGAG--ATGCGCAGGAAGGTAGTACCTAC-----GTTAATATAATTAGC-------------------------------------AAATGGGATT-GTGGAAAGTAAGGGAGG---ATTGTA----GTTAACTTTATTGTATCCCTT----ATGACTTGGGGTGTGGTTTCAAAGGCCT | |
| rn5 | chr17:15666729-15666847 - | CCTTGAG--ATGGGCTGGAAGGTAGTACCTTC-----GTTAACATAATTAGC-------------------------------------AAATGGGATT--------GTGGGAAGGGAGGATTACA----GCTAACT----TGTATCCGTG----CTGACTTGGGGTGTGGTTTCAAAGGCCT | |
| canFam3 | Unknown | --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| monDom5 | Unknown | --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | 
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| hg38 | 
  | 
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| panTro4 | 
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| rheMac3 | 
  | 
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| mm10 | 
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| rn5 | 
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| canFam3 | 
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| monDom5 | 
  | 
Generated: 12/12/2014 at 10:53 AM