ID:

eca-mir-9099

Coordinate:

chr11:6019440-6019578 -

Confidence:

Known

Class:

Unknown

Genomic Locale:

intergenic

[View on miRBase]

[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}]
Legend: mature star mismatch in read

Predicted structure

-68.2 -68.0 -68.0

Sense Strand Reads

TGACAGGGGCAGAGCTGGCAGGCTGCACACCTAGGGCTGGGGCTGGGGGTCAGGGGTCACTAGGCTGTTTAGAGGCTCCTTGTATTTACTCCGCTGGCTCTGTTGTTCCTGGGCTCCTCCATGTCTGCCCTTGGAAGCAGGTCTGGAGCAGGGAGCAAGGTCAGCTTCCCTAAAGACTTGAGTGACTACCAATTCCCAGCAATAACCCTATGCTTTGCAGAGCTTCTCTACGAAGGTGT

***********************************......(((((((((..((((((((((((((.....((((((((((((.(((.(((((..(((.((((..((((.((((............))))..)))))))))))))))).)))..))))))..)))))).....)).))).))))))).)).)))))))))....***********************************
Read size # Mismatch Hit Count Total Norm Total SRR871532

testes
...............................................................................................................................CCCTTGGAAGCAGGTCTGGAGC.......................................................................................... 22 0 1 1.00 1 1

Anti-sense strand reads

ACTGTCCCCGTCTCGACCGTCCGACGTGTGGATCCCGACCCCGACCCCCAGTCCCCAGTGATCCGACAAATCTCCGAGGAACATAAATGAGGCGACCGAGACAACAAGGACCCGAGGAGGTACAGACGGGAACCTTCGTCCAGACCTCGTCCCTCGTTCCAGTCGAAGGGATTTCTGAACTCACTGATGGTTAAGGGTCGTTATTGGGATACGAAACGTCTCGAAGAGATGCTTCCACA

***********************************......(((((((((..((((((((((((((.....((((((((((((.(((.(((((..(((.((((..((((.((((............))))..)))))))))))))))).)))..))))))..)))))).....)).))).))))))).)).)))))))))....***********************************
Read size # Mismatch Hit Count Total Norm Total

Generated: 09/01/2015 at 11:35 AM