ID:dwi_3785 |
Coordinate:scf2_1100000004954:5050427-5050577 + |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
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| -5.0 | -4.5 | -4.3 |
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CDS [Dwil\GK23330-cds]; exon [dwil_GLEANR_6650:6]; intron [Dwil\GK23330-in]
No Repeatable elements found
| mature | star |
| ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------############-------------------------------------- GATTGCTCGAAACCAACAGAACAGACACACAGACAGACGCTCGCTACATAAACTGCATATGTGTGCGTGCACACATCCAATTGACATGCAAAAGAGATGGGAAACGCCGTATAGCGAAACTGAAAGAGATGGACTCTATCCATTTTTTACTGTTTTTTCCGCCAGTTAATTAACTCGCGTTATCTTTTTATACCCTTGCAGAGAGTATTCTAATATTGGTCATGCTTTGTTTGTGTATTGATGTATATAGT ***************************************************************************((((.((..............((((......))))...............))..)))).********************************************************************************************************************* |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M045 female body |
V118 embryo |
V117 male body |
M020 head |
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|
CTAACGAGCTTTGGTTGTCTTGTCTGTGTGTCTGTCTGCGAGCGATGTATTTGACGTATACACACGCACGTGTGTAGGTTAACTGTACGTTTTCTCTACCCTTTGCGGCATATCGCTTTGACTTTCTCTACCTGAGATAGGTAAAAAATGACAAAAAAGGCGGTCAATTAATTGAGCGCAATAGAAAAATATGGGAACGTCTCTCATAAGATTATAACCAGTACGAAACAAACACATAACTACATATATCA
*********************************************************************************************************************((((.((..............((((......))))...............))..)))).*************************************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M045 female body |
V118 embryo |
V117 male body |
V119 head |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .TAACGAGCTTTGGTTGTCTTGTCTGT................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 0 | 6 | 0.17 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
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| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| droWil2 | scf2_1100000004954:5050377-5050627 + | dwi_3785 | GATTGC-------TCGAAACCAA-CAGAACAGACACACAGACAGACGC----------------------------TCGCTACATAAA-CTGCATATGTGTGCGT--GCACACATCCAATTGACATGCAAAAGAG-------ATG------GGAAACGCCGTATAGCGAAACTG--------------AAAGAGATGGAC----TCT----------------------ATC------------------------CATTTTTTACTGT---------------------------------------------------------TTTTTCCGCCAGTTAATTAACTCGC-GTT---ATCTTTTTATACCCTTGCAGAGAGTATTCTAATATTG-GTCATGCT-----------TTGTTT--GTGTATTGA-TGTATATAGT |
| droVir3 | scaffold_10324:741912-742014 + | CTAGCCACTTTG----------CAG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GC------------------------TATTGCTGCCACTTAAA---------G--------------------------------------------------AAAGT------TGAG--------CGC-------------------------A----T--A---TTCCTTTTATGCCCTTGCAGAGGGTATTATGATTATG-TCTCGA-------------------------------TATGTGTAAC | |
| droMoj3 | scaffold_6496:1404187-1404285 - | TTGTTGCTGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTTTGTGCT-----------AT------TGTTGCTCTAAT------TTAATGCGTTG-AGT-------------------------T----T--T---CTCTTTCAATACCCTTGCAGAGAGTATTGTAACT-GG-GTCAAGAG-----------T------------------------TGT | |
| droGri2 | scaffold_15110:15480244-15480337 + | TGACTG-------A-------------------------------------------------------------------------G-C---------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGAC-----------------------------ATC------------------------AGTTTATTAATTTATTTTTGA------ATTGTT-----------------ATAA--------TGA-------------------------A-------T---ATATTTGCGTACCCTTGCAGAGGGTATTATAAATTTG-ACCA------------------------------------------- | |
| dp5 | Unknown_group_4:28572-28637 + | GTTACTTTCC------------ACC------C---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-----------------------------------------------------------------------------------------------T---TATTTTGTTTACCCTTGCAAGGAGTATTGTACTTTTG-GTCAGTTG-----------T------------------------TTG | |
| droPer2 | scaffold_2310:1313-1404 + | TATACATTTTTA----------ATT------A---------------ATTATT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCGCCATATATATCAAATATATTTATTATTCTTAT-TA--------T---------------------------------------------------------------------TTTTAGTT----------------------------------------TTTTTTTG-TATTAT-------------------------------TTGATTTATT | |
| droAna3 | scaffold_13250:1997482-1997619 + | ATATCC--------GATAGCCGC-CA--------------------------------------------------------------------------------------------------------TATAACTAA--A---CGATCGG----------------------AAATGGCACAACCTAAACTGCAAGGG----TATA-----------------------------------------------------------------TCAACTTCG-G-----CTCCGCCCGAA------G--------TTAGCT-------------------------T--TCC--T---TTCATGTTATGCCCTTACAGAGGGTATTATAATTTTG-GTCA------------------------------------------- | |
| droBip1 | scf7180000396483:6459-6558 + | AAACTG-------AGA-----------------------------------------------------------------------G-A---------------------------------------------------------------------------------------------------------TTTAC----------------------------------------------------TTTTAG-TT--------TTTATAATTTTTT-T-----TTACTTTTAAT------TTTT--------ACC-------------------------T----T--A---TTATTATTATACCCTTGCAGAGGGTAATATAATTTTG-TCCA------------------------------------------- | |
| droKik1 | scf7180000302351:764345-764468 - | AAAAGC-------TGAAAATCAT-CAAAGCACACACACACACAGACTG----------------------------CGGGCA--TTAACTCGCATACAAACGCGCTTACACACAGGCCAACAA-------------------ATT------AAAGACACAGTGGGGCAGAATAT--------------AAAAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAAGGATT | |
| droFic1 | scf7180000453158:64411-64499 - | CTATAT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A------------------------AATTTTTTAATCT---------------------------------------------------------TCCCTATGGTAGATATACATA----TGTTGTCCGATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATTATAATTTCA-GTCA------------------------------------------- | |
| droEle1 | scf7180000491186:991396-991612 - | AGACAT-------ACG-------------------------------GTTTTTCAAAAATTAACATATATGTGATTTAA--------G-CT----------------ACACATTTTCAACTAA-------------------TAT------AAAAAAGAAAGGAAGCAAACTTT--------------GGCAAGCCGAAGTTTATATACCCTTGCAGCTATTGC---------------AAAACTTAAATATTCTTGT-TA--------ACATTTAAATTTCAATTATT-----------------AGAT--CGTAG-AAG---------------------------------T---TAATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATTATAATTTCA-GTCA------------------------------------------- | |
| droRho1 | scf7180000763854:3000-3149 + | CACGTA-------TAA-----------------------------------------------------------------------A-GTGCACTTGTG----------------TAACAA--------------------ATGTGTTAAA----------------------ACGTATCCAGACCGAAAATGCTGGAG----TGTGTCTT------------------------------------------------------------------------------TGCGTCTCATTTTACGA--------TAAAAT-------------------------T----A--T---ATATTTATATACCCTTGCAAAGCGTTTTATAATTTCG-GTCAAAAG-------------------------------TATAAAGT | |
| droBia1 | scf7180000302512:188271-188428 + | ACACAT-CCA------------ACT------C---------------ATTTTTCGATGAG----------------------------------------------------------------------------------TTA-----------------------------CGGGAATATAGTATGAAAGA------------------------CGATGGTGTCGATTGAG---------GCGTTTTCTCTTGT-TT--------TTTTTTGAATCTT------TGTTTGTAAAAA------TTAA--------TGG-------------------------T----T--G---TTCTTTTTATACTATTACAGAGGGTATAATAATTTCA-GTCA------------------------------------------- | |
| droTak1 | scf7180000415741:161278-161444 - | TGTGTGCCATATCCTA-------------------------------GTTGTG--------------------------------------------------------------------------CGAAAGAAATAACGA---TGATGAAAGAGGGCAATAAGGCAGAACGG--------------AAAAGGTTTGAG----TGA-----------------------------------------TTTTTTTTA--------------------------TTCGTT-----------------TT--------G-AGTGATTTTCTGGCCGGCGA--------CTCGG-G-A---AAATTTTTATACCCTTGTAGAGGGTATTATAATTTCA-GTCA------------------------------------------- | |
| droEug1 | scf7180000407790:2342-2413 - | TTCATTCTCT------------ACT------C----------T----GTTTTT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T---AGTTTTTTATACTCTTGCAGAGAGTATTATTATTTTG-GTCAGATG-----------T--------------------T---TGT | |
| dm3 | chrX:21979320-21979392 + | ATC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGTCATAACCCTGCAGAGACTATCCTAACGTCT-AGCAATAA-----------CCATATGAGGTTATTGACTATAGATAAT | |
| droSim2 | 3l:22362869-22362945 + | T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTATACCCTTGCAGAGGGTATACTGATTTCT-GAGATAAGTTAGCGGAGCAGCGAGG--GAGTATAAA-TATATAAAGT | |
| droSec2 | scaffold_41:54196-54244 - | TC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTTTATACCCTTGCAGGTGGTATTATAGTTTTTGGTCTCAT-----------------------------------GCCTT | |
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Generated: 05/18/2015 at 08:17 AM