ID:dwi_2487 |
Coordinate:scf2_1100000004902:4656251-4656401 - |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -12.0 | -11.8 | -11.7 |
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exon [dwil_GLEANR_11485:2]; CDS [Dwil\GK11258-cds]; intron [Dwil\GK11258-in]
No Repeatable elements found
| ##################################################--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- GAATTCTGAATCTATAACTGATTATAAAAATGAGATAATCGAAGCGGATAGTCAGCATTCCGAGATAGACGAGTTTTGTAGTTCTTCGACCGAAGATGCTGAGGAAGGCGCCGACGTCATAGTCGATCCCTGTAGCAGTTCCATCATTGAGTTCGCATTAGAAAGCGATACTGATGTGAATACTTCACCTACCAAACCCACATTTGCTACTTCCAAGACTCCGGATTCTTACATTTATGAAAAAGAGCTGC **********************************************************************************************************************.............((((..((((((((....(((((((........)))).))))))).)))).......))))........*************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M045 female body |
V118 embryo |
V117 male body |
M020 head |
V119 head |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................AATCGAAGCGGATAGTCAGC................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ..ATTCTGAATCTATAACTGAT..................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 |
| ..............................................GATAGTCAGCATTCCGAGATAGA...................................................................................................................................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ...........CTATAACTGATTATAAAAA............................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................ATAGTCGATCCCTGTAGCAGTTCCAT........................................................................................................... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ............................AATGAGATAATCGAAGCG............................................................................................................................................................................................................. | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................CATTGAGTTCGCATTAGA......................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................TCCGGATTCTTACATTTATGAAAAAGAGC... | 29 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................TCATTGAGTTCGCATTAGAA........................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................ATTGAGTTCGCATTAGAAAGC..................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................ATAGTCAGCATTCCGAGATAG....................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| .........................................................................................CGCAAGATGCTGAGGAAG................................................................................................................................................ | 18 | 2 | 6 | 1.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................ATACTTCACCTACCAAACCCA................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................GACCGAAGTTGCTAAGGA.................................................................................................................................................. | 18 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................CCGAAGATACGGAGGAGGGC.............................................................................................................................................. | 20 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ............................................................................................AGGATCCTGAGGACGGCG............................................................................................................................................. | 18 | 3 | 20 | 0.15 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................ATGAGCAAGGCGCTGACG....................................................................................................................................... | 18 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TCGCAAGATGCTGAGGAAG................................................................................................................................................ | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
|
CTTAAGACTTAGATATTGACTAATATTTTTACTCTATTAGCTTCGCCTATCAGTCGTAAGGCTCTATCTGCTCAAAACATCAAGAAGCTGGCTTCTACGACTCCTTCCGCGGCTGCAGTATCAGCTAGGGACATCGTCAAGGTAGTAACTCAAGCGTAATCTTTCGCTATGACTACACTTATGAAGTGGATGGTTTGGGTGTAAACGATGAAGGTTCTGAGGCCTAAGAATGTAAATACTTTTTCTCGACG
***************************************************.............((((..((((((((....(((((((........)))).))))))).)))).......))))........********************************************************************************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M045 female body |
M020 head |
V119 head |
V117 male body |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ................................................................................................................CTGCAGTATCAGCTAGGGACAT..................................................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ..........................................................................................................CCGCGGCTGCAGTATCAGCTA............................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................TTTGGGTGTAAACGATGAAGG..................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................CGCCTATCAGTCGTAAGGC............................................................................................................................................................................................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................CGTCAAGGTAGTAACTCAAGCGTAATCT......................................................................................... | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................ATAAACGATGATGGTTCT................................. | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................................TGAAGGTTCTAAGGCGGAA........................ | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| droWil2 | scf2_1100000004902:4656201-4656451 - | dwi_2487 | GAATTCTGAATCTATAACTGATTATAAAAATGAGATAATCGAAGCGGATAGTCAGCATTCCGAGATAGACGAGTTTTGTAGTTCTTCGACCGAAGATGCTGAGGAAGGCGCCGACGTCATAGTCGATCCCTGTAGCAGTTCCATCATTGAGTTCGCATTAGAAAGCGATACTGATGTGAATACTTCACCTACCAAACCCACATTTGCTACTTCCAAGACTCCGGATTCTTACATTTATGAAAAAGAGCTGC |
| droVir3 | scaffold_13047:1843604-1843669 - | CAACCCCGGCACCACGCAGGAC---AATGAAGCAACATTAGCTGTGGATGGCCTGCACTCGGTG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGGA | |
| droGri2 | scaffold_14906:8676631-8676655 - | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCTACATCTACGAGAAGGAACTGT | |
| dp5 | 2:27287917-27287941 + | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCTACATATACGAGCAAGAGCTAA | |
| droPer2 | scaffold_6:2578156-2578180 + | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCTACATATACGAGCAAGAGCTAA | |
| droKik1 | scf7180000302247:259197-259221 - | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCGTACATCTACGAAAAAGAACTCA | |
| droRho1 | scf7180000778307:23153-23178 - | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCTTATATCTACGAAAAGGAGCTGA | |
| droTak1 | scf7180000414009:188679-188703 - | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCTTACATCTACGAGAAGGAGCTCA | |
| droEug1 | scf7180000409490:89888-89912 - | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCTTATATCTACGAAAAGGAGCTGA | |
| dm3 | chr3R:4632446-4632471 + | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCCTACATCTACGAAAAGGAACTGA | |
| droYak3 | 3R:8694433-8694461 + | GGC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCCTACATCTACGAAAGGGAACTAA | |
| droEre2 | scaffold_4770:16953817-16953842 - | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTCCTATATCTACGAAAAGGAACTAA |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droWil2 |
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| droVir3 |
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| droGri2 |
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| dp5 |
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| droPer2 |
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| droKik1 |
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| droRho1 |
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| droTak1 |
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| droEug1 |
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| dm3 |
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| droYak3 |
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| droEre2 |
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Generated: 05/18/2015 at 04:34 AM