ID:dvi_888 | 
		Coordinate:scaffold_10324:1060912-1061062 + | 
		Confidence:Candidate | 
		Type:Unknown | 
		[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] | 
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read | 
![]()  | 
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CDS [Dvir\GJ15131-cds]; exon [dvir_GLEANR_15429:1]; intron [Dvir\GJ15131-in]
No Repeatable elements found
| ##################################################--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- CCACAAAGCTACTCAAGTTATGCGCCCTGTTCTGGGATATAATCTATGTGGTAAGTTGGCATGGACAGCCGAGACGTTAGGCCTAAAGTTTCGTATGGAAATGTCGGCTTATGAACTTTAGAGCATTGTAAATGCCTTATAATTATAATAGCATTAAAGAGCTGTAATTACATAGAGTAGTCAGGTTTCATTAACTCGCCGAGTTGACTAACCCCCCGAACACTTGAAAGTGTCTGCGACTAACTAGTTGA **************************************************((((((((((((...((..((((((.(((....))).))))))..))...))))))))))))...((((((.(((((((((...........))))))).)).))))))((((...(((((.....)))))..))))..............**************************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M047 female body  | 
	SRR060667 160_females_carcasses_total  | 
	SRR060674 9x140_ovaries_total  | 
	SRR060678 9x140_testes_total  | 
	SRR060681 Argx9_testes_total  | 
	SRR060689 160x9_testes_total  | 
	SRR060679 140x9_testes_total  | 
	SRR060671 9x160_males_carcasses_total  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................TGTGGTAAGTTGGCATGGA.......................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ........................................................................................................................................................................TACATAGAGTGGTCAGGTTT............................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| ..............AAGTTATGCGCCCTGTTCTGGGATA.................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .............CAAGTTGTGCGCCCTGTTCTGG........................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .................................................................................................GAAATGTCGGCTCCGGAACT...................................................................................................................................... | 20 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .......GCTACTCAAGTTATGCGCCCTGTT............................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ......................................................................GAGACGTTAAGACTAGAGT.................................................................................................................................................................. | 19 | 3 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| ...........................................................................................................................................................................ATAGAGTTGTAAGGTCTCA............................................................. | 19 | 3 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................CTTGGAAGGGTCTGCTACT.......... | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| 
GGTGTTTCGATGAGTTCAATACGCGGGACAAGACCCTATATTAGATACACCATTCAACCGTACCTGTCGGCTCTGCAATCCGGATTTCAAAGCATACCTTTACAGCCGAATACTTGAAATCTCGTAACATTTACGGAATATTAATATTATCGTAATTTCTCGACATTAATGTATCTCATCAGTCCAAAGTAATTGAGCGGCTCAACTGATTGGGGGGCTTGTGAACTTTCACAGACGCTGATTGATCAACT
 **************************************************((((((((((((...((..((((((.(((....))).))))))..))...))))))))))))...((((((.(((((((((...........))))))).)).))))))((((...(((((.....)))))..))))..............**************************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M047 female body  | 
	SRR060689 160x9_testes_total  | 
	SRR060685 9xArg_0-2h_embryos_total  | 
	M027 male body  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .........................GGACAAGACCCTATGTTAGAT............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| ..........................................................................................................................................................ATTTCTCGACATTAATGTT.............................................................................. | 19 | 1 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| .........................................................................................................................................................ACCTTCTCGACATTAATGT............................................................................... | 19 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| .............................................................................................................................................................TCGGGACATTAGTGTATCT........................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| Species | Coordinate | ID | Alignment | 
|---|---|---|---|
| droVir3 | scaffold_10324:1060862-1061112 + | dvi_888 | CCACAAAGCTACTCAAGTTATGCGCCCTGTTCTGGGATATAATCTATGTGGTAAGTTGGCA---------------------------TGGAC------------A--------------------------------------------------GCCGAGACGTTAG-GCCTAAAGTTTCGTATGGAAATGTCGGCTTATGAACTTTAGAGCATTGTAAATG---------CCTTATAATTATAATAGCATTAAAGAGCTGTAATTACATAGA-GTAGTCAGGTTTCATTA------------ACTCGCCGAGTTGACTAACCCCCCGAACACTTGAAAGTGTCTGC--GA-CTAACTAGTTGA | 
| droMoj3 | scaffold_6496:4981204-4981497 - | CCACGAAGGTGTTAAAAATCTTTGCCCTAATCTGGGATATAATATATGTTGTAAGTGTGCGCATTTAATATGATTAAAGTGGTTTTTATTGTTTCTTATGAGTGGCGTAACCTGAGC---------------------------TGAGGCTTGTTGACGGAAACGTTTTGG-------GGGCCTATGCAAATGAGGTCTAAAACTCTTTTGAGTGCTGTAAATACTATTGGGGCATTATAATTATAATAGCATTAAA-AGATATAATTACACGAA-TAAGACACGTTTCATTA----------AGACCCACTGAGTTTACTAACTC-A-----G--------------------GTCTCTAACTGA | |
| droGri2 | scaffold_15245:9143463-9143802 + | CCACAAAAGTTTTGAAAGTATTCGCCCTGATCTGGGATATAATCTATGTGGTAAGTTTGCAAA--TAATATAGTTA---TGAATTTTATTGAC------------AGAAACTTGAGGAGGTAGGCTTAACAAAAGGGGATTAGTTCTGGTTTGTTGGCGGAAATGTTATGGCTTTTAATTTCATATGCAAATTACTTCTTA--AATCGCAGAGTGTTGTAAATGGTATA-AAACCTCATAATTATAATAGCATTAAA-AGACATAATTACATAAAAAAAGACAAGTTTCATTAGCCACAGCTTAGACTCCGCGAGTTTACTAACCTCA-----ACTTGAAAGTGTCTACTGGACCTAACTAGCTGA | |
| droWil2 | scf2_1100000004513:2472339-2472394 + | CCACATGTTGTTTGAAAGTGTTATCCATAATATGGGATATTATATATGCGGTAAGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| droEle1 | scf7180000491265:11892-11947 + | CAACAAACGTTTTAAAGGGGTTTGCCCTGTTCTGGGATATTATCTATGCTGTAAGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| dm3 | chr2R:2916614-2916669 + | CCACAAACGTTTTGAAGGGCTTTGCCCTCTTTTGGGATATTATCCTCGCTGTGAGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | 
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droVir3 | 
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| droMoj3 | 
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| droGri2 | 
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| droWil2 | 
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| droEle1 | 
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| dm3 | 
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Generated: 05/16/2015 at 11:34 PM