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Type:Unknown |
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CDS [Dvir\GJ21682-cds]; exon [dvir_GLEANR_7020:3]; exon [dvir_GLEANR_7020:2]; CDS [Dvir\GJ21682-cds]; intron [Dvir\GJ21682-in]
No Repeatable elements found
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V047 embryo |
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| ....................................................................................................................................................GTTTATTTGATAGTTCCTTTC........................................................... | 21 | 3 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ............................................CAGGCGGGGAGTATGGC....................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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|
GGATATTAGCGTAACGCGTTCTCGTGCGGTCGGTGTGTGGTCCGGTTCGCCACTCATACCGGCTCTCTACCTTAGTTAAAATTTACGCTCAGAGTTACGATGGACGTGCAGCGCTCGGTTAGAGAACGTTTAACATGTAACACGTGTTAAAATAAACTATAAAGGTAAGGTGAACGTCAGCGAGCGTCGACGAGGGGTACCGTCGCGACGGCAGTTAATACGTTGGGT
**************************************************.((........((((.(((((((((((....((((....((..(((((.....((((....(((((.......)))))....))))))))).))...))))...)))))...))))))...)))))).************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060685 9xArg_0-2h_embryos_total |
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| .........................................CCGGTTGGCCACTCTTACA........................................................................................................................................................................ | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
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| droEle1 | scf7180000491201:696190-696372 - | CCTACAATCGGATTGCGCAAGAGCATGCTAGCCACATTCCAGGCCAAGTCGTAAGTACT---CCGTAG------GCAGGTGTGCCCCCCCTTCCCCAATGG---TTAATAA-----------------------------------------------C--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GA-TGCATTGTTTT-CCCCAC---------TGGCA-TT-GGCATAGGCACTGGCAAACGCTCCACATGCCAGCGCCGCCGTTGCACATGCCACACA | |
| droRho1 | scf7180000780104:38953-39118 - | CCTACAATCGAATTGCGCAAGAACATGCTAGTTACACACCAGGCCAAGCGGTGAGTACT---CCGTAG------GCAGGTGT------GGCC-CCAAACAG---TTAGTAA-----------------------------------------------T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GA-TGCATTGTTTT-CCGCA----------------C-----CCAGGCACTGGCAGCCGCTCCGCATGCCAGCGCCGCCGTTGCACATGCCACCCA | |
| droBia1 | scf7180000302291:2857545-2857711 + | CCTACAATCGAATTGCGCAAGAGCACGCCAGTCACACACCCGGCCAAGCAGTGAGTATT---CCGCGG------GCAGGTGT------GGCT-CCAAGTAG---TGTGCAA-----------------------------------------------T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACGGCATTGTTTT-CCGTT---------------------CCTAGGCTCTCGCCAACGCTCCGCATGCCAGCGCCGCCGTTGCCCATGCCACCCA | |
| droTak1 | scf7180000415401:55263-55433 - | CCTACAATCGAATTGCGCAAGAGCATGCCAGTCACACACCAGGCCAGGCAGTGAGTAGTATTCCGTGG------GCAGGTGT------GGCT-TTAAGTAG---TTTGCAA-----------------------------------------------T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATTGCATTGTTTTTCCGTT---------------------CCTAGGCACTAGCTAACGCTCCGCATGCCAGCGCCGCCGTTGCTCATGCTACCCA | |
| droEug1 | scf7180000409474:1525576-1525741 + | CTTACAATCGAATTGCGCAAGAGCATGCTAATCATGCACCAGGCCAAGTGGTGAGTATT---CCGTGG------GCAGGTGT------GGCT-CCAAATAG---CTTGCAA-----------------------------------------------T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GA-TGAATTTTATT-CCGGA----------------C-----CCAGGCACTAGCCAATGCTCCGCATGCCAGTGCAGCCGTTGCACACGCCACTCA | |
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| droSec2 | scaffold_1:13991408-13991580 - | CCTACAATCGGATTGCGCAAGAGCATGCCAACCATACACCAGGCCAAGTTGTGAGTGTG---CCGTGC------ACAGGTGT------GGCC-CCAAATTGTAATTTGTAA-----------------------------------------------T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GA-TGCATTGTCTT-CCACA----------------AC-TTTGTAGGCACTGGCTAATGCCCCCCATACCAGCGCCGCCGTTGCACATGCCACCCA | |
| droYak3 | 2R:12759695-12759865 + | CCTACAATCGCATTGCGCAAGAGCATGCCAACCACACACCAGGCCAAGTGGTGAGTGTT---CCGTGC------ACAGGTGT------GGCC-CCAAATCG---TTTGTAA-----------------------------------------------T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GA-TGCATTGTCTT-CCACA----------------CCCTATGTAGGCACTAGATAATGCTCCGCATGCCAGCGCCGCCGTTGCACATGCCACCCA | |
| droEre2 | scaffold_4845:10581035-10581204 - | CCTACAATAGAATTGCGCAAGAGCATGCCAACCACACACCAGGCCAAGTTGTGAGTGTT---CCGTGC------ACAGGTGT------GGCC-CCAAATCG---TTTGTAA-----------------------------------------------T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GG-TGCATTGTCTT-CCACA----------------CC-TCTGTAGGCACTAGAAAATGCTCCGCATGCCAGCGCCGCCGTTGCACATGCCACCCA |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droVir3 |
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Generated: 05/16/2015 at 09:37 PM