ID:dvi_4021 | 
		Coordinate:scaffold_12855:5525555-5525705 - | 
		Confidence:Candidate | 
		Type:Unknown | 
		[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] | 
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read | 
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| -11.0 | -11.0 | -10.6 | -10.6 | 
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exon [dvir_GLEANR_10216:1]; CDS [Dvir\GJ10282-cds]; intron [Dvir\GJ10282-in]
No Repeatable elements found
| ##################################################--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- GCCGCGAATACGTAAAGCCAAGCACCATTGGGGCCGTGATATTATCGAAAGTGAGCAAATCTATAGTTATACTGGTTGCGTTATAGGGTAGGACTTTGGAAATATTTTTGTTAGTGTTAAAATTTAGTTATTAAGTTGAGTTTCGCGATTTTAGTTAAGTTGTATTATCGGAAAATGTTGTATTTAAAAATATATATCTACTTATCAAGATATATCAAAATATTTATGTTAATTTTTCATAGAATTTAATT *********************************************************........((...(((....((...((((..(((.(((...((((...))))...))).)))........))))...))..)))...))*********************************************************************************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060681 Argx9_testes_total  | 
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	SRR060678 9x140_testes_total  | 
	SRR060680 9xArg_testes_total  | 
	V116 male body  | 
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	SRR060664 9_males_carcasses_total  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ..............AAGCCAAGCACCATTGGGGCC........................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .............................................................................................................................AGTTATTAAGTTGAGTTTCGC......................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................................AATCTATAGTTATACTGGTTG............................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ............................................................................................................................................................AAGTTGTATTATCGGAAAATG.......................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .................................................................................................................GTGTTAAAATTTAGTTATTAA..................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ......................................................................ACTGGTTGCGTTATAGGGTAG................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..............................................................................................................................................TCGCGATTTTAGTTAAGTTG......................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .................................................................................TATAGGGTAGGACTTTGGAAAAA................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .................................................................GTTATACTGGTTGCGTTATAGGGTAG................................................................................................................................................................ | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..............................................................................CGTTATAGGGTAGGACTTTGG........................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ........................................................................................................................................TGAGTTTCGCGATTTTAGTTA.............................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .................................................................................................................................ATTAAGTTGAGTTTCGCGATT..................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .....................................................................................................................................................TTTAGTTAAGTTGTATTATCG................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..........................................................................GTTGCGTTATAGGGTAGGACCA........................................................................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .......................................................CAAATCTATAGTTATACTGG................................................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .................................................................................TATAGGGTAGGACCTTGGAAA..................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........................................TTATCGAAAGTGAGCAAATCTA............................................................................................................................................................................................ | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .......................................................................CTGGTTGCGTTATAGGGTAGGTC............................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .................................................................GTGGTACTGGTTGCGTTATTG..................................................................................................................................................................... | 21 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| ..................................CGTGAAATTGTCGAAAGGGA..................................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 9 | 0.22 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 
| ........................................................................................................................................................................CGGAAACTGGTGTATTAAAAA.............................................................. | 21 | 3 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| ..................................CGTGATATTGTTGAAAGGGA..................................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| 
CGGCGCTTATGCATTTCGGTTCGTGGTAACCCCGGCACTATAATAGCTTTCACTCGTTTAGATATCAATATGACCAACGCAATATCCCATCCTGAAACCTTTATAAAAACAATCACAATTTTAAATCAATAATTCAACTCAAAGCGCTAAAATCAATTCAACATAATAGCCTTTTACAACATAAATTTTTATATATAGATGAATAGTTCTATATAGTTTTATAAATACAATTAAAAAGTATCTTAAATTAA
 *********************************************************************************************************........((...(((....((...((((..(((.(((...((((...))))...))).)))........))))...))..)))...))*********************************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060681 Argx9_testes_total  | 
	SRR060680 9xArg_testes_total  | 
	SRR060679 140x9_testes_total  | 
	SRR060670 9_testes_total  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................CCCCGGCACTATAATAGCTTT......................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 1 | 1 | 1 | 0 | 
| .......................................................................GACCAACGCAATATCCCATC................................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| .GGCGCTTATGCATTTCGGTT...................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| ...........................................................................................CTGGAACCTTTATAAAAAC............................................................................................................................................. | 19 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| .............................................GCTTTCACTCGTTTAGATAT.......................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| ....GCTTATGCATTTCGGTTCGTG.................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 
| .GGCGCTTATGCATTTCGGTTC..................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| .............................................TCTTTCACTCGTTTAAATA........................................................................................................................................................................................... | 19 | 2 | 18 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| Species | Coordinate | ID | Alignment | 
|---|---|---|---|
| droVir3 | scaffold_12855:5525505-5525755 - | dvi_4021 | GCCGCGAATACGTAAAGCCAAGCACCATTGGGGCCGTGATATTATCGAAAGTGAGCAAATCTATAGTTATACTGGTTGCGTTATAGGGTAGGACTTTGGAAATATTTTTGTTAGTGTTAAAATTTAGTTATTAAGTTGAGTTTCGCGATTTTAGTTAAGTTGTATTATCGGAAAATGTTGTATTTAAAAATATATATCTACTTATCAAGATATATCAAAATATTTATGTTAATTTTTCATAGAATTTAATT | 
| droMoj3 | scaffold_6540:5847256-5847318 - | GCCGCCGATGC--AAAGCTTCGCATCATTGGGGTCGTAATATTATCGAAAGCGAACGGATGTGTA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | |
| droGri2 | scaffold_14906:8473367-8473403 + | AGGC-------------CCACCCATCACTGGGGTCGTAATATTATAGAAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | 
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droVir3 | 
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| droMoj3 | 
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| droGri2 | 
  | 
Generated: 05/17/2015 at 05:06 AM