ID:dvi_329 |
Coordinate:scaffold_12942:59738-59806 - |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -27.8 | -27.7 | -27.7 |
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Antisense to exon [dvir_GLEANR_3025:5]; Antisense to CDS [Dvir\GJ18415-cds]
No Repeatable elements found
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CGTATAACCACTCACACAAATTTGTGGCCACCATGTGCATGAGCCCAAATCGCGATGTTACCTTGTGCCGCGCCATGTCCATATACGTGGTGTTTAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCAATGCATAGGATCATGCGGCAGATAGGAGTGATAGCTACAAAGACATCGTG
***********************************(((((..((((((...(((...(((.(((.....(((((((((......))))))))).....))).)))..)))..)))))).))))).........************************************ |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060658 140_ovaries_total |
SRR060684 140x9_0-2h_embryos_total |
SRR060675 140x9_ovaries_total |
SRR060679 140x9_testes_total |
SRR060657 140_testes_total |
SRR060685 9xArg_0-2h_embryos_total |
SRR060660 Argentina_ovaries_total |
SRR060686 Argx9_0-2h_embryos_total |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 0 | 1 | 1270.00 | 1270 | 1143 | 30 | 38 | 11 | 47 | 0 | 1 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATCG.. | 25 | 0 | 1 | 209.00 | 209 | 112 | 64 | 19 | 8 | 4 | 2 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGG.................................................... | 23 | 0 | 1 | 181.00 | 181 | 134 | 11 | 20 | 13 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATC... | 24 | 0 | 1 | 73.00 | 73 | 21 | 20 | 15 | 14 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGC.................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 60.00 | 60 | 1 | 37 | 18 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCAA................................................. | 26 | 0 | 1 | 54.00 | 54 | 11 | 29 | 11 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCG................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 33.00 | 33 | 6 | 14 | 7 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCA.................................................. | 25 | 0 | 1 | 29.00 | 29 | 11 | 10 | 7 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATCGT. | 26 | 0 | 1 | 27.00 | 27 | 5 | 10 | 9 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATCGTG | 27 | 0 | 1 | 22.00 | 22 | 1 | 15 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCC.................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 20.00 | 20 | 5 | 9 | 3 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACAT.... | 23 | 0 | 1 | 18.00 | 18 | 2 | 8 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCAAT................................................ | 27 | 0 | 1 | 16.00 | 16 | 2 | 9 | 2 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGG..................................................... | 22 | 0 | 1 | 16.00 | 16 | 7 | 4 | 4 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACA..... | 22 | 0 | 1 | 14.00 | 14 | 3 | 5 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGCGC................................................................................................ | 23 | 0 | 1 | 11.00 | 11 | 0 | 5 | 5 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGC..................................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 9.00 | 9 | 1 | 6 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGCGCCATG............................................................................................ | 27 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 0 | 5 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGCG................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 0 | 4 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................GAGTGATAGCTACAAAGACATCG.. | 23 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 3 | 3 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................TAGGAGTGATAGCTACAAAGACATCG.. | 26 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 0 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTTGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 6.00 | 6 | 5 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACT........................................................ | 19 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 3 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTG...................................................... | 21 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 0 | 2 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGCGCC............................................................................................... | 24 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 0 | 1 | 4 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGA....... | 20 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 0 | 1 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGTC................................................... | 24 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGT.................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAGGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGTGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGAC...... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACGTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGCGCCA.............................................................................................. | 25 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................ATAGGAGTGATAGCTACAAAG........ | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................CTAGGAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 25 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................GAGTGATAGCTACAAAGACATCGT. | 24 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTTGG.................................................... | 23 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTATACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TACGTGGTGTTTAGGAAGATAAACT............................................................. | 25 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................ATAAACTGTACTTGGGCAATGC.............................................. | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACGGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCA................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATGAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCTA................................................. | 26 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................GAGTGATAGCTACAAAGACATCGTG | 25 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTT....................................................... | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCC.................................................. | 25 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TACGTGGTGTTTAGGAAGATAAAC.............................................................. | 24 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAAATGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................AGGAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 23 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................TAGGAGTGATAGCTACAAAGACATCGT. | 27 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCAG................................................. | 26 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGAGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................GTGGTGTTTAGGAAGATAAACTG............................................................ | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAACACATCG.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTATCTTGTGCCGC.................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAACACATC... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ..............................................................................................TAGGAGGATAAACTGTACTTGCGC................................................... | 24 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCAATC............................................... | 28 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................ATAGGAGTGATAGCTACAAAGA....... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ................................................................................................................................................GAGTGATAGCTACAAAGACATC... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
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| ..............................................................................................TAGTAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTCACCTTGTGC..................................................................................................... | 18 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTAGTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .........................................................................................GTGTTTAGGAAGATAAACTGTACA........................................................ | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTGGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TTTAGGAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGAAAGCTACAAAGACATCG.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ..............................................................................................GAGGAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................TAAACTGTACTTGGGCAATGCATAGGA........................................ | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTGCTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................TGTGCATGAGCCCAAATCGCGATG................................................................................................................ | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................TAGGAGTGATAGCTACAAAGACA..... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................TAGGAGTGATAGCTACAAAGACATC... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................ATAGGAGTGATAGCTACAAAGACATCG.. | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................ATGCGGCAGATAGGAGTGATAG................ | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGAGAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACCAAGACATCG.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGAAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGTTAGCTACAAAGACATCG.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCCA................................................. | 26 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCCTGTGCCG................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATTTTACCTTGTGCCG................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGGCATCG.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTTTGCCG................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................TCGCGATGTTACCTTGTGCCG................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACGAAGACATCG.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTATCTTGTGCC.................................................................................................... | 19 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACAATA.. | 25 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................TCATGCGGCAGATAGGAGTGATAGCTAC............ | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACCTGCGC................................................... | 24 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ..............................................................................................TTGGAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................ATAGGAGTGATAGCTACAAAGACA..... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATCT.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATTA.. | 25 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TGCGGCAGATAGGAGTGATAGCT.............. | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................AAACTGTACTTGGGCAATGCATAGGA........................................ | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGTG.................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .....................................................................................................................................GCGGCAGATAGGAGTGATAGC............... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCC................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATGAACTGTACTTGGG.................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................ACGTGGTGTTTAGGAAGATAAAC.............................................................. | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATCGTC | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................ATGCGGCAGATAGGAGTGATAT................ | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATTTC. | 26 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTCACCTTGTGCCG................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACCGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGAC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TTTAGGAAGATAAACTGTACTTGGG.................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCAATG............................................... | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGGGATAGCTACAAAGACATCG.. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................TTACCTTGTGCCGCGCCAT............................................................................................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTCCTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCATT................................................ | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................TTGGGCAATGCATAGGATCATG................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................AGATAGGAGTGATAGCTACAAAGACA..... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGCAACC............................................... | 28 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TGCGGCAGATAGGAGTGATT................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGTG................................................... | 24 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAATTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TACGAAGATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGGAGATAAACTGTACTTGG..................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAACCTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATTC.. | 25 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGT.................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGCTACAAAGACATCTT. | 26 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTGCTTGGG.................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGA................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................TATACGTGGTGTTTAGGAAGATAAACT............................................................. | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................AGTGATAGCTACAAAGACATCGTG | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGCT................................................................................................. | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGTACTTGGGT................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAAATAAACTGTACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................ATAAACTGTACTTGGGCAATGCATAGG......................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TACGTGGTGTTTAGGAAGATAAACTGT........................................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................TGCATAGGATCATGCGGCAGATAG......................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................GTGGTGTTTAGGAAGATAAACTGT........................................................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TAGGAAGATAAACTGGACTTGGGC................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CGCGATGTTACCTTGTGCCGCGACATG............................................................................................ | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGGAGTGATAGTTACAAAGACAT.... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............AGAAATTTGTGGTCACCA........................................................................................................................................ | 18 | 2 | 11 | 0.09 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ............................................................................................................GTACTTGGGCAATGTATATT......................................... | 20 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ######################################################################################################################################################################### GCATATTGGTGAGTGTGTTTAAACACCGGTGGTACACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAATGGAACACGGCGCGGTACAGGTATATGCACCACAAATCCTTCTATTTGACATGAACCCGTTACGTATCCTAGTACGCCGTCTATCCTCACTATCGATGTTTCTGTAGCAC ************************************(((((..((((((...(((...(((.(((.....(((((((((......))))))))).....))).)))..)))..)))))).))))).........*********************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060684 140x9_0-2h_embryos_total |
SRR060675 140x9_ovaries_total |
SRR060679 140x9_testes_total |
SRR060658 140_ovaries_total |
M047 female body |
SRR060665 9_females_carcasses_total |
V047 embryo |
SRR060657 140_testes_total |
SRR060664 9_males_carcasses_total |
SRR060681 Argx9_testes_total |
SRR060685 9xArg_0-2h_embryos_total |
SRR060670 9_testes_total |
V116 male body |
SRR060682 9x140_0-2h_embryos_total |
SRR060686 Argx9_0-2h_embryos_total |
V053 head |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................CGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 24 | 0 | 1 | 77.00 | 77 | 49 | 15 | 10 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................CACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 26 | 0 | 1 | 70.00 | 70 | 59 | 7 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................ACACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 27 | 0 | 1 | 59.00 | 59 | 38 | 16 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................TACACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 28 | 0 | 1 | 54.00 | 54 | 41 | 4 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................CCTAGTACGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 26 | 0 | 1 | 52.00 | 52 | 31 | 11 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................AGGTATATGCACCACAAATCCTTCTAT................................................................. | 27 | 0 | 1 | 25.00 | 25 | 17 | 7 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................GTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 23 | 0 | 1 | 19.00 | 19 | 9 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................ACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 25 | 0 | 1 | 17.00 | 17 | 10 | 3 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................CTAGTACGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 25 | 0 | 1 | 13.00 | 13 | 8 | 2 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................ATCCTAGTACGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 28 | 0 | 1 | 13.00 | 13 | 8 | 3 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................TCCTAGTACGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 27 | 0 | 1 | 10.00 | 10 | 6 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................GTATATGCACCACAAATCCTTCTAT................................................................. | 25 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 5 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................GGTATATGCACCACAAATCCTTCTAT................................................................. | 26 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 6 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................CAGGTATATGCACCACAAATCCTTCTAT................................................................. | 28 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 3 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................TACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 0 | 1 | 1 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................ACAGGTATATGCACCACAAATCCTTCTAT................................................................. | 29 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................ACTAGTACGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 26 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................TAGTACGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 24 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................ATATGCACCACAAATCCTTCTAT................................................................. | 23 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........TGAGTGTGTTTAAACACCGGTGGTA....................................................................................................................................... | 25 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................AACACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 28 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................CGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................AAACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................TGAACCCGTTACGTATCCT........................................ | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................GGTGGTACACGTACTCGGGTT......................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................ACGTACTCGGGTTTAGCGCTACTAT............................................................................................................. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................GGTGGTACACGTACTCGGGTTT........................................................................................................................ | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................CGTACTCGGGTTTAGCGCTACAATCTAGC........................................................................................................ | 29 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................TAGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 19 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................CTTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................ATCCTAGTACGCCGTCTATCCTC...................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................CTAGTACGCCGTCTATCCTCACTATCG............... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................CTATTTGACATGAACCCGTTACGTAT........................................... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................ACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................AACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 26 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................CGCGGTACAGGTATATGCAC................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................TACTCGGGTTCAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................TTACACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 29 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................TATGCACCACAAATCCTTCTAT................................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................TAACGTACTCGGGTTTAGCGCTACAAT............................................................................................................. | 27 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................ACACGTACTCGGGTTTAGCGCTACCAT............................................................................................................. | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................TCCTAGTACGCCGTCTATCCTCACT................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................AGTACGCCGTCTATCCTCACTATCGAT............. | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......TGGTGAGTGTGTTTAAACACCG............................................................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................GTACGCCGTCTATCCTCACTAT................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................TCTATCCTCACTATCGATGTTTCTGT..... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................GTACGCCTTCTATCCTCACTAT................. | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................ATGCACCACAAATCCTTCTATTTGACAT.......................................................... | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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