ID:dvi_19046 |
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Type:Unknown |
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CDS [Dvir\GJ12127-cds]; exon [dvir_GLEANR_12118:5]; exon [dvir_GLEANR_12118:4]; CDS [Dvir\GJ12127-cds]; intron [Dvir\GJ12127-in]
No Repeatable elements found
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Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M027 male body |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............GTAGGATCTCTGTGCAGCCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCGTTCGGATGATCCGCGCG. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....AGGTGCGCGTAGGATCTCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................CGCTGTGCAGCCTGAGGAC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................AGCCTGAGGACACGGCATTGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....GGTGCGCTTAGGATCTCTGTGCAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................GATCTCTGTGCAGCCTGAGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATCACATCGTTCGGATGATC....... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................AGCCTGAGGACACGGCATTGGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACATCGTTCGGATCATCCGC.... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATGAACTGAGATCACATCGTTCG.............. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........GCGCGTAGGATCTCTGTGCAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..GGAGGTGCGCGTAGGATCTCTGTGCAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGATCTCAATGAGCTGA............................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............GTAGGATCTCTGTGCAGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................................................................................................AAGGCCGGCCACAGAGGGTGA...................................................................................................................................................... | 21 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGAGCTGAGATCACATCGTTC............... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................TGTGCAGCCTGAGGACAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATCACATCGTTCGGATGATC....... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATGAGCTGAGATCACATCGTTC............... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TTATCCTCCTAGCTAACCTTGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................AATTGAAGACCAAACCAGT............................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................GACACGGCATTGGAGGAAGCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATGAAGCTGATGTCAAT................................... | 19 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................GAACAGGGCATTGGAGGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 3 | 12 | 0.17 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................CTTGTTGCCAACCATGCTGCG............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 3 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCAAATCACCCTTTTC.................................................................... | 18 | 2 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................GTGAGAGCACGGCATTGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 3 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................................CGGCCACAGAGGGTGATA.................................................................................................................................................... | 18 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| .............................................................................................TCTTTACTTACCTTGACC................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................CTTGTTGCCAACCATGCTGC.............................................................................................................................................................................................................. | 20 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
|
TACGTCCACGCGCATCCTAGAGACACGTCGGACTCCTGTGCCGTAACCTCCATCCGGTCGGCATTGAGATCGATCAACAGGTTTGGTTATAGGAGAATTGATTGGAACTGGTGCCAAAATCAGTTGGTTAACTTTTGATTTGGTCAGTTTATGGAAAGCAATGGTAACGAAAAGAACGACGGTTGGTACGAGCCTAAGTGTAGGTTGATGATATATCTGTTTACGGCTTTGCGGCCGGTGTGTCCAACTAGTGTCTGGGGTTGACTTACTTGGGAATTCGAATACTTGGGGATAAACAAAAAACCCCGTGGGCTGATTTTAGTGGAAAAAGAACAAAGAAGGACGCGTCCTTCGACTAGAGTTACTCGACTCTAGTGTAGCAAGCCTACTAGGCGCGCG
**************************************************(((((...((.((((....(((((((((..................))))))...(((((...(((((...((((....)))).....))))).)))))..................)))....)))).))...........((((....))))..(((.....)))......((((......))))......((((.((..(((.......))).)).))))..............((((............)))).....(((.((((......))))...)))....)))))....************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060669 160x9_females_carcasses_total |
SRR060667 160_females_carcasses_total |
V116 male body |
M047 female body |
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SRR060668 160x9_males_carcasses_total |
V053 head |
SRR060666 160_males_carcasses_total |
SRR060664 9_males_carcasses_total |
SRR060672 9x160_females_carcasses_total |
SRR060679 140x9_testes_total |
SRR060657 140_testes_total |
SRR060687 9_0-2h_embryos_total |
SRR060665 9_females_carcasses_total |
SRR060686 Argx9_0-2h_embryos_total |
SRR060671 9x160_males_carcasses_total |
SRR060656 9x160_ovaries_total |
SRR060663 160_0-2h_embryos_total |
SRR060684 140x9_0-2h_embryos_total |
GSM1528803 follicle cells |
SRR060661 160x9_0-2h_embryos_total |
M028 head |
M027 male body |
SRR1106729 mixed whole adult body |
SRR060682 9x140_0-2h_embryos_total |
SRR060685 9xArg_0-2h_embryos_total |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGGGGATTGGAATACT................................................................................................................. | 18 | 2 | 3 | 12.67 | 38 | 9 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 0 | 2 | 1 | 2 | 2 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTGGGGATTGGAATACT................................................................................................................. | 19 | 3 | 15 | 1.20 | 18 | 1 | 0 | 3 | 1 | 0 | 2 | 0 | 1 | 7 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGGGGATTGGAATACTA................................................................................................................ | 19 | 3 | 17 | 1.12 | 19 | 1 | 2 | 2 | 1 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| .........................................................................TCAACAAGTTTGGTTATACAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTTGGGGATAAACAAAA.................................................................................................. | 19 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................TACTTGGGAAGTCGAATAA.................................................................................................................. | 19 | 2 | 6 | 0.33 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGGGTATTGGAATACT................................................................................................................. | 18 | 2 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGAATACGAGTACTTG............................................................................................................... | 18 | 3 | 20 | 0.15 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGTCCGGGGTTTAATTA................................................................................................................................... | 20 | 3 | 10 | 0.10 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................TGATTGGGACCGGTGCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 2 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAAACCCAGAGGGATGATT................................................................................. | 20 | 3 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................TGGTGTCACGGGTTGACTTA................................................................................................................................... | 20 | 3 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GGTGAGTCCAGCTCGTGTC................................................................................................................................................ | 19 | 3 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGTGGACTTATTTGGGA............................................................................................................................ | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................ACGCCTTTGGGGCCTGTGTG............................................................................................................................................................. | 20 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAGAAAAAAGTAGGACG...................................................... | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
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