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Type:Unknown |
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CDS [Dvir\GJ13132-cds]; exon [dvir_GLEANR_13047:16]; intron [Dvir\GJ13132-in]
No Repeatable elements found
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| .....................................................................................................................................................ATTCCTAATCCTGGGGCC.................................................................................... | 18 | 3 | 20 | 0.10 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 |
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| ....................................CGCATAGTTGCTGGC........................................................................................................................................................................................................ | 15 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
|
ATGAATACATACGTGCACCCACGCCAACATGTAGGTGCGTATTAACGACCGACAACCCGTAATCTGCGAAGGCGCCATCAAACAAATGGACGCAAATTAAAGGATCTCGTTGACGGACTGCGACATAGGGTGTAAGTACACCTTAAGCGTAAGCATTAGGACGCCGATTTACGAAAATAAAAAAACAAAACAGCGAGTGTCCCATGTCTTGGACCTGAGATATCACGCAAGCCGGCTGACCCTCGATGGCC
**************************************************((((.(((((((((((((......(((((.....))))).))))))))).....((((((...(((..(((.(((((.(((((....))))).))..)))..)))........)))....)))))).................))))))))************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | V116 male body |
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V047 embryo |
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M027 male body |
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SRR060678 9x140_testes_total |
V053 head |
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M061 embryo |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ................................................................................................................ATGGACTGTGACAGAGGGT........................................................................................................................ | 19 | 3 | 16 | 0.75 | 12 | 2 | 2 | 1 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ...............................................................................................................GATGGACTGTGACAGAGGG......................................................................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.55 | 11 | 0 | 1 | 4 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
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| ................................................................................................................ATGGACTGCGACAGAGGG......................................................................................................................... | 18 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................GACTGCGACAGAGGGTGG...................................................................................................................... | 18 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .................................................................................................................CGGACTGTGACAGAGGGTGG...................................................................................................................... | 20 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................TACGAAGGCGTCATCAATCA....................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ................................................................................................................GCGGACTGTGACAGAGGGTG....................................................................................................................... | 20 | 3 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ................................................................................................................GTGGACTGTGACATAGGGTG....................................................................................................................... | 20 | 3 | 11 | 0.09 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................CAAAGTAAAGGGTCTCGT............................................................................................................................................. | 18 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| Species | Coordinate | ID | Alignment |
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| droBip1 | scf7180000396544:520555-520607 - | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGGGTACAGAATCTGGACTCGATTGTGCGTCCGGCTGACCGGGACTTGCCGG | |
| droKik1 | scf7180000302391:208949-209098 - | ----G-----------------------------------------------------------------------------------------CACCTGCCCCTCAGACATCT-TTTGATGGCAGTTTGTTTGTTCGGTTCGCGTGTAATTGCCGCTCGTATG--AAGGCC--------------------A--TAACTTG------------------------A-----------------------------AACTCT--------------------------------------------CGCCTGCAGGGTACAGAATCTGGACTCGATTGTTCGTCCGGCTGACCGGGACCTGCCCG | |
| droFic1 | scf7180000453839:1011959-1012139 + | ----GAGCTGGCA----------------------------------------------------------------------------CGCAGCACCTGCCCTTCAGACATCT-TTTGATGGCGGTTTGTTTGTG-----CGCGTGTAATTGGCGCTCGTATG--CTGGCA--------------------ATATAATTTG------------------------TA----CGTTAACGAAATG--------CTTAACTCTTG----------------------------------------GTGGCCTGCAGGGTACAGAATCTGGACACGATTGTCCGTCCGGCTGACCGGGATCTGCCCG | |
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| droRho1 | scf7180000776791:9805-10007 + | ----GAGCTGGCA-----------------C----------------------GCAGG----GAGGCAGGCAGGCAGG---CAG--GCAGGCAGCACCTGCCCTTCAGACATCT-TTTGATGGCAGTTTGTTTGTT-----CGCGTGTAATTGCCGCTCGTATG--CTGGCA--------------------A--TAACTTG------------------------TA----CATAAACGAAATG--------CTTAACTCT--------------------------------------------CGTCTACAGGGTACAGAATCTGGACACGATTGTCCGTCCGGCGGACCGGGATCTGCCCG | |
| droBia1 | scf7180000302193:5941099-5941265 + | -------------------------------------------------------------------------------------------------CTGCCCTTCAGACATCT-TTTGATGGCAGTTTGTTTGTT-----CGCGTGTAATTGCCGCTCGTATG--GCGGCC--------------------A--TAACTTG------------------------TGCGCCCATAAACGGAATG--------CTTAACTCTCGG---------------------------------------CTCGTTTACAGGGTTCAGAATCTGGACACGATTGTCCGCACGGCTGACCGGGATCTGCCAG | |
| droTak1 | scf7180000415773:669239-669413 - | ----GAGCAGGCA----------------------------------------------------------------------------CGCAGCACCTGCCCTTCAGACATCT-TTTGATGGCAGTTTGTTTGTT-----CGCGTGTAATTGCCGCTCGTATG--CCGGCA--------------------A--TAACTTG------------------------TA----CATAAACGAAATG--------CTTAACTCT--------------------------------------------CGTTTGCAGGGTGCAGAATCTGGACACGATTGTCCGACCGGCTGACCGGGATCTGCCCG | |
| droEug1 | scf7180000409466:5196895-5197078 + | CAAAGAGCTGGCA-----------------A----------------------GG----------------------------------AGCAGCACCTGCCCTTCAGACATCT-TTTGATGGCAGTTTGTTTGTT-----CGCGTGTAATTGCCGCTCGTATGCGCTGGCA--------------------A--TAACTTG------------------------TA----CATAAACGAAATG--------CTTAACTCT--------------------------------------------CGTCCGCAGGGTACAGAATCTGGACACGATTGTTCGTCCGGCTGACCGGGATCTGCCCG | |
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Generated: 05/16/2015 at 10:17 PM