ID:dvi_1505 | 
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		[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] | 
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CDS [Dvir\GJ17964-cds]; exon [dvir_GLEANR_2533:10]; intron [Dvir\GJ17964-in]
No Repeatable elements found
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| ........................................GAGAATGCCGGTATGAGC................................................................................................................................................................................................. | 18 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ........................................GAGAATGCCGGTATG.................................................................................................................................................................................................... | 15 | 1 | 4 | 1.75 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ................ATTTTACAGGCAATGACAACACC.................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..........TTTAAAATTTTACAGGCAATGACA......................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..................................................................TGAGAAATATGAATGCACTGC.................................................................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ................ATTTTACAGGCAATGACAACACCAGA................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..................................ACACCAGAGAATGCCGGCAAGTGCACTT............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ......................................................................................................................................GATCAACAGAAGCACATTGT................................................................................................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .........ATTTAAAATTTTACAGGCAAT............................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
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| ...........TTAAAATTTTACAGGCAATGACA......................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| .......................AGGCAATGACAACACCAGAGAA.............................................................................................................................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
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| .......................................TGAGAATGCCGGTATG.................................................................................................................................................................................................... | 16 | 2 | 20 | 0.10 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ..................................ACAAGTGAGAATGCCGGTA...................................................................................................................................................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.10 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
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| ........................................GAGAATTCCGGATAGTGC................................................................................................................................................................................................. | 18 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| ......................................................................................................................................GATCATCAGCAGCTCATT................................................................................................... | 18 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
| 
CTCAGCTAGTAAATTTTAAAATGTCCGTTACTGTTGTGGTCTCTTACGGCCATTCACGTGAAACAGATTCTTTATACTTATGTGACGTTCTTTAACCCAAAATAAAGAAAATAAACAGTGTGTGGGTGTGTTTTCTAGTTGTCTTCGAGTAACATATATAGGGTAATCGGTAGGTGATTGTTAGGCTGTTAATAAGTGTGAGTGTAAATGATGTGAACAAATATAAATAAAACTAAAATAAAAATATGCAT
 **************************************************((.((((.....((.((((...(((((.......(((((.....((((((((...((((((...(((.........))).))))))......))))))))))))))))))....)))).))..)))).)).....................**************************************************  | 
	Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060655 9x160_testes_total  | 
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	M047 female body  | 
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| .............................................................................................................................................................................GTGATAGTTAGGGTGGTAA........................................................... | 19 | 3 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 
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| ...................................................................................................................CTGTTTGTGGGTGTGTTTT..................................................................................................................... | 19 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 
| Species | Coordinate | ID | Alignment | 
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| droTak1 | scf7180000415287:244928-245179 + | CAGTCGATCATTCAAAATTCTACAGGCAATGACTACACCTGAAAATGCCGGTAAGTACA------GCTGTGCCAAA-GAACT-----------------------------------CAGTGTCCCGACAAA-AAAAACAACACTTGGAAGGAT-GAATCGT----------------------------------------TTTCTGAAATTTAGTTACCAGTTTTGAATCCCCAACAT--------ACAT---------------------------------------------------------CAGACAAACAT-CATGGCTGTATATATATATATACTCAGAACCCA------------------------------TCG-AGCA-TCACTAATCCCAATGATCACACGC-TCA--------------TTCA--------------------------------GACACAAGCA | |
| droEug1 | scf7180000409554:124488-124726 - | CAGTCGATCATTCAAAATTCTACAGGCAATGACAACACCTGAAAATGCCGGTAAGTACA------GCTGTGCGAAG-A-ATT-----------------------------------CAGTGTCCCAAATGA-------AACACTTGGAAGGCG-AAATCGT----------------------------------------TTACTGGAATTAAGTTACAAGTTTTGAATCCAATACAT--------ACAT---------------------------------------------------------CAGACAAAACT-CATGGCTGTATATAT------ACTCAGAAACCA------------------------------TCG-GACA-TCACTAACCCTTATAATCATACAT-TCA--------------TACA--------------------------------GACACAAGCA | |
| dm3 | chr2L:13276463-13276521 + | CAGTCGATCATTCAAAATTCTACAGGCAATGACAACACCTGAAAATGCCGGTAAGTACA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| droSim2 | 2l:12894579-12894637 + | CAGTCGATCATTCAAAATTCTACAGGCAATGACAACACCTGAAAATGCCGGTAAGTACA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
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| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droVir3 | 
  | 
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Generated: 05/17/2015 at 03:38 AM