ID:dvi_12851 |
Coordinate:scaffold_12970:2003938-2004088 + |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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CDS [Dvir\GJ19138-cds]; exon [dvir_GLEANR_4023:2]; intron [Dvir\GJ19138-in]
No Repeatable elements found
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Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR060685 9xArg_0-2h_embryos_total |
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SRR060682 9x140_0-2h_embryos_total |
SRR060670 9_testes_total |
SRR060666 160_males_carcasses_total |
M027 male body |
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V047 embryo |
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| ...........................................................................................................................................................................................................................ATAATCCGCCGGATTTGCCGC........... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................ATATAATCCGCCGGATTTGCCGCCAAT....... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ................................................................................................................................................................................................................................CCGCCGGATTTGCCGCCAATGGTGTC. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ............................TTATCATTTCTGCTTTCTAT........................................................................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................ATATTGGGCAGAGATGAGATT............................................................................................................................................... | 21 | 3 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .........................................................................................ATTGGGCAGAGATGAGATTG.............................................................................................................................................. | 20 | 3 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................TTTAGCATTAAGATATTAT................................................................................. | 19 | 2 | 16 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
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|
CCACCCTTTAGCGAGCTAATGTTTAAACAATAGTAAAGCGGAAAGATACACTAAGAGTATTTGAATTATCCTAATTAAATACAAGATTCAGACCCGTCTCTACTCTAATAGAAGTTCAGCCTGTGAGAGCTGACCTCTAAAGTATAATCTTAAATCTTAAATCTATAATACGTTAATGTTACCTCAAAAATAACAAGCATCACAGGGTATTGTTAGTTATATTAGGCGGCCTAAACGGCGGTTACCACAGT
**************************************************((((((..((....))..)))))).(((((.(((((((((((((...((((........((((((.(((((......)))))))))))))))...)))).))))))))).)))))....(((....((((((((...))))))))..))).************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M027 male body |
V053 head |
V047 embryo |
M028 head |
SRR060678 9x140_testes_total |
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SRR060687 9_0-2h_embryos_total |
M047 female body |
SRR060667 160_females_carcasses_total |
M061 embryo |
SRR060664 9_males_carcasses_total |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ................................................CACTAAGGGTATTAGAGTTA....................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 8 | 0.25 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................ATAGCTGACCTCTAAATT............................................................................................................ | 18 | 2 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................CACAGGGTCTTCTTAGTT................................. | 18 | 2 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................TCCAGACCCGTCTTTACTGTAA............................................................................................................................................... | 22 | 3 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GGCCTAATCGGGGCTTACC..... | 19 | 3 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................CACAGGGTCTTATTAGTT................................. | 18 | 2 | 10 | 0.10 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................GGCCTAATCGGGGCTTAC...... | 18 | 3 | 20 | 0.10 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................CTTGAATCTATTATACGTT............................................................................. | 19 | 2 | 11 | 0.09 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
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| ...........................................................................................................................................................CTTGAATCTATTATACGT.............................................................................. | 18 | 2 | 16 | 0.06 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| droEre2 | scaffold_4644:1769596-1769656 - | A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCTTTTGCAGTGTCGCATAATAATCAATACAATCCACCTGATCTGCCGCCGATGGTGTCC |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droMoj3 |
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| droGri2 |
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| droWil2 |
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| droPer2 |
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| droAna3 |
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